Shyamal Das Peddada

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Shyamal Das Peddada

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Nature子刊：SECOM-用于评估菌群数据中未描述类群间的互作关系

人类肠道菌群形成了一个微生物相互作用的生态系统，由于复杂的潜在相互作用，一些微生物间可能存在非线性关联。近日，美国国立卫生研究院研究人员在Nature Communications发表最新研究，开发了一种称为Sparse Estimation of Correlations among Microbiomes （SECOM）的方法，用于估计微生物间的线性和非线性关系，同时保持稀疏性。该模型考虑了样本和分类单元的特异性偏差，在真实数据集中表现性能较好，值得相关人员测试。

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