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Shixian Hu
文章数:6篇
器官移植
Science子刊:肠道菌群失调与实质器官移植后的死亡率增加相关
越来越多的证据表明,肠道菌群与造血干细胞移植后的生存率相关,但肠道菌群对实质器官移植的影响尚未明确。Science Translational Medicine上发表的一项最新研究结果,发现肝移植患者及肾移植患者均表现出肠道菌群失调,并与免疫抑制剂的使用相关,同时,器官移植后的死亡率随着肠道菌群失调程度的增加而升高。
器官移植
研究论文
队列研究
克罗恩病
周宏伟+何肖龙Cell子刊:肠道菌群产生的一种酶或能缓解克罗恩病
肽聚糖是细菌细胞壁的主要结构成分,其特定碎片能通过激活模式识别受体NOD2,对宿主的多种生理过程产生影响。NOD2在克罗恩病(CD)病理机制中有重要作用,其功能缺失突变是CD最大的风险因素。然而,另一方面,源自菌群的NOD2配体(肽聚糖碎片)的变化是否在CD发病中发挥作用,目前尚不清楚。南方医科大学珠江医院周宏伟和何肖龙团队在Cell Host and Microbe发表一项最新研究,对这一问题进行了深入探索。他们发现,肠道菌群表达的一种肽聚糖水解酶——DL-endopeptidase(DL-内肽酶),能够促进肠道中的NOD2配体生成,从而活化宿主NOD2信号。这种细菌酶的耗竭在CD病理中有关键作用,旨在补充DL-内肽酶的干预方法,或是治疗CD的新思路。
克罗恩病
细菌酶
Nod2
DL-内肽酶
肠道菌群
遗传-菌群互作
Nature子刊:近8000人数据揭示遗传对肠道菌群的影响
宿主遗传可影响肠道菌群。近期,Nature Genetics背靠背发表了2篇基于大型单一人群队列的肠道微生物组GWAS研究。这项研究纳入了荷兰微生物组计划中的近8000名参与者,对肠道菌群宏基因组的组成(分类单元)和功能(通路)进行了全基因组关联研究(GWAS),鉴定出24个遗传位点(涉及37个SNP)与菌群分类单元和通路的关联,分析了潜在混杂因子(如用药、饮食和BMI)对这些关联的影响,用孟德尔随机化法探索了肠菌与宿主表型的因果关系,并通过功效分析强调了大样本量对于微生物组GWAS研究的重要性。有兴趣的读者可搭配阅读该团队同期发表的观点评论文章(见“延伸阅读”),讨论了微生物组GWAS的研究进展、技术现状、面临的挑战和未来的研究方向。
遗传-菌群互作
全基因组关联分析(GWAS)
肠道菌群
炎症性肠病(IBD)
IBD患者的表型和基因型对血浆蛋白质组有什么影响?
Journal of Crohn's and Colitis发表的研究,分析了IBD表型、基因型与血浆蛋白质组的关系。研究结果表明,在一大批IBD患者中,基因型和人类血浆蛋白质组之间存在着复杂而丰富的相互作用,与人口统计学和临床特征密切相关。本研究强调了基因型、表型和循环蛋白之间的密切关联,或可有助于改善IBD疾病的防治。
炎症性肠病(IBD)
基因型
蛋白质组
炎症性肠病(IBD)
Nature子刊:宿主遗传变异对肠道基因表达的影响,受炎症状态调控
超过240个基因风险位点与炎症性肠病(IBD)相关,但对它们如何在肠道组织中促进疾病发展人们所知甚少。Nature Communications近期发表的文章,鉴定出炎症依赖性的肠道顺式表达数量性状位点(cis-eQTLs),揭示出炎症状态调控宿主遗传变异对肠道基因表达的影响,或有助于确定参与炎症的细胞类型和通路以及指导未来的药物开发,为IBD患者的精准医疗提供参考。
炎症性肠病(IBD)
炎症
宿主遗传变异
炎症性肠病(IBD)
塑造IBD肠道菌群的遗传因素
肠道微生物群和宿主遗传在炎症性肠病(IBD)的发病机制中具有重要作用,这两个因素之间的相互作用及其在IBD病因中作用需要进一步研究。《Gut》近期发表的文章,揭示出免疫系统相关的常见和罕见遗传变异或是塑造肠道菌群的关键因素,或为发展疾病治疗新方法提供机制原理。
炎症性肠病(IBD)
全外显子组测序
基因-微生物相互作用