代谢潜力

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文章数：3篇

METABOLIC：对微生物基因组的功能特征、新陈代谢、生物地球化学和群落尺度功能网络进行高通量分析

作者展示了 METABOLIC 软件（微生物的代谢和生物地球化学分析），它以基于基因组的微生物代谢为基础，能够对菌群生态学和生物地球化学进行一致且可重复的研究，并将推动未培养的生物体整合到代谢和生物地球化学模型中。作者预计 METABOLIC 将使从宏基因组和基因组中更容易解释微生物代谢和生物地球化学，并使菌群研究在不同领域成为可能。METABOLIC 是用 Perl 和 R 编写的，网址为 https://github.com/AnantharamanLab/METABOLIC。

功能性状宏基因组组装基因组 (MAGs) 菌群生物地球化学代谢潜力

广东省科学院团队：揭示嗜酸杆菌在重金属污染土壤中的生态适应性机制

包括嗜酸杆菌(Acidobacteriia)在内的许多微生物，可在极酸/碱、极寒/热、高重金属、高压等许多极端环境中生存，我们在赞叹这些细菌坚忍不拔的同时，也非常好奇它们之所以自强不息的内在机制。广东省科学院孙蔚旻研究团队基于前期的野外调查发现嗜酸杆菌纲常在重金属污染严重的西南红壤中存在独特优势，这表明A嗜酸杆菌可能具有耐受、甚至转化重金属的代谢潜力，为探究嗜酸杆菌在极端土壤环境中的生态适用性机制，团队采用宏基因组学分箱手段揭示了其独特的代谢潜力，帮助了研究者们更好地理解这类分布广泛、奇特、但难培养的微生物。

宏基因组重金属污染嗜酸杆菌代谢潜力分箱

ISME：Micrarchaeota和Parvarchaeota古菌门的代谢多样性

Micrarchaeota门和Parvarchaeota门是古菌新发现的DPANN超门的成员，它们的基因组较小(~1 Mb)，但在自然界分布广泛，与其他古菌Thermoplasmatales目的成员存在共生或寄生关系。然而，Micrarchaeota门和Parvarchaeota门的生态功能、进化历程至今仍未研究清楚。本文通过宏基因组组装及分箱，丰富了数据库中现存Micrarchaeota门和Parvarchaeota门的基因组，并深入研究了它们的代谢多样性，揭示了Micrarchaeota、Parvarchaeota谱系相关的基因组共有和特有的特征，并为酸性矿山排水(AMD)和热泉群落的相互作用和生态功能提供了新的见解。

Micrarchaeota 古菌宏基因组组装代谢潜力 Parvarchaeota