宏基因组重叠群

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宏基因组重叠群

西安交大：用于聚类宏基因组重叠群的新方法——MetaDecoder

这是西安交通大学杨铁林、郭燕与团队在Microbiome发表的研究成果。可基于 GPU运算的 MetaDecoder，用于有效地聚类宏基因组重叠群并从菌群数据中重建菌群。在模拟数据集和真实数据集上应用 MetaDecoder 表明，它可以生成更完整且污染更低的基因组。使用 MetaDecoder，作者确定了新的高质量基因组并扩展了现有的细菌基因组集。

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