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iMeta：对于Nature微生物菌株传播研究的评论

本文对 Nature 微生物菌株传播研究进行了评论。该研究整合了公开可用的和新测序的宏基因组数据，纳入了来自20个不同国家，涵盖800多个细菌物种，总数超过9700的样本，并分析评估了母亲-孩子、双胞胎、家庭成员、同居者、同一人群内的不同个体、以及不同人群间的个体之间的肠道和口腔微生物组在菌株水平上的共享情况。

宏基因组肠道和口腔微生物组共享菌株直接传播非传染性疾病

宏基因组菌株检测

使用 SameStr 进行宏基因组菌株检测：识别可通过粪便移植转移的持久核心肠道菌群

作者开发了 SameStr，一种生物信息学工具，其能够检测宏基因组样本中共享菌株，提供了对宏基因组序列数据中共享菌株的稳健识别，具有足够的特异性和敏感性，以检查人类粪便菌群中的菌株持久性、转移和植入。作者的研究结果确定了一个持久健康的成人核心肠道菌群，且应进一步研究以阐明菌群对慢性疾病的贡献。

宏基因组菌株检测核心肠道菌群共享菌株单核苷酸变异 (SNV) 粪便菌群移植 (FMT)