生物地球化学循环

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生物地球化学循环

文章数：6篇

Nature 子刊：加州大学Banfield组揭示CPR细菌和DPANN古菌多样性及与低温TEM下宿主互作关系

该研究揭示了CPR细菌和DPANN古菌的位点特异性多样性，它们与地下水含水层中的不同宿主共存。鉴于CPR和DPANN生物已在人类菌群中被识别，它们的存在与牙周炎等疾病相关，该研究的发现有助于重新思考饮用水质量和人类健康的关系。

宏基因组地下水生态系统 CPR细菌低温透射电子显微镜群落

微生物组功能注释和结果优化工具DRAM

微生物(含病毒)群落改变了地球化学生态系统，但是由于缺乏可扩展的、分解代谢的注释软件，这些生物催化的特定反应难以解读。本文介绍了DRAM（新陈代谢的精炼注释），一个将海量的微生物基因组信息转化为微生物性状集的框架，本文表明，DRAM精确地分配了微生物对地球化学循环的贡献，并在底物水平自动划分肠道微生物碳水化合物代谢。作为DRAM的病毒模式，DRAM-v建立了识别病毒编码的辅助代谢基因(AMGs)的规则，从而对来自土壤和肠道的数千个假定的辅助代谢基因进行了代谢分类。DRAM和DRAM-v一起提供了关键的代谢谱分析功能，这些功能可用于破解微生物组功能。

DRAM 碳水化合物代谢 AMGs 数据库功能基因注释

南京农大团队发现土壤化学计量特性影响土壤碳、氮和磷循环的微生物群落及其对全球变化的抵抗力

面对全球变化，要保持生态系统功能的稳定性，就需要更好地理解功能特殊微生物群的调控因素及其种群对干扰的响应。在这项研究中，作者收集了中国54个管理的生态系统的土壤，并进行了一个微观实验，将干扰、元素化学计量和遗传抗性联系起来。发现与年平均温度和降水量相比，土壤碳:氮:磷化学计量对与碳、氮和磷主要生物地球化学过程相关的微生物类群的丰度有更大的影响。土壤全碳、全氮、全磷含量及其比值对微生物种群的遗传抗性有着强烈的直接影响，土壤全碳、全氮含量及其比值是磷循环对氮沉降、变暖和干湿性抗性的主要预测因子。总的来说，本文的工作强调了土壤化学计量平衡对于维持生态系统功能抵御全球变化能力的重要性。

全球变化生态系统功能功能基因生物地球化学循环碳矿化

Science：全球土壤群落及其对生物地球化学循环的影响（综述）

土壤是陆地上最大的碳库，相当于植被和大气碳库的总和。土壤碳库的周转受到土壤生物群落的调节，进而影响土壤肥力、植物生长和气候变化等。因此，对土壤群落的有效管理是我们应对生物多样性丧失和气候变化的全球威胁最有利的武器之一。探索不同生物对元素循环的差异化影响和土壤群落的功能生物地理学具有重要意义。在此之上，弄清机制、建立模型，将使我们更加从容的应对未来的全球化威胁。

土壤生物生物地球化学循环综述土壤生物学微生物地理学

气候变化背后的微生物学——问题和展望

在整个地球的生命史中，微生物存在的时间最长，微生物群落一直在改变气候，并且已经被气候所改变。了解环境微生物组在气候变化时如何响应、适应和演变，是我们认识气候 - 生态系统互馈能力的关键。

气候变化访谈录地球微生物学生物地球化学循环 Georgios Lyratzopoulos

饮用水菌群

是时候关注饮用水微生物组了

世界各地的自来水中含有大量的微生物，据估计每升水中含有的微生物细胞个数可在10^6-10^9之间。这些微生物与饮用水的质量和公共卫生风险密切联系，但是对其生物学特性的研究仍然较为滞后。《Trends in Microbiology》发表观点文章，提议有必要关注饮用水菌群。

饮用水菌群 Microbiome meta-omics Drinking water microbial ecology