王军
中国科学院微生物研究所研究员、中国肠道大会联合发起人
中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师,国家高层次海外人才项目入选者,德国马普学会合作伙伴小组负责人,北京市科技新星。主要进行生物数据的深度挖掘和分析工作,工作中利用统计学和生物信息学结合的方法,研究肠道菌群在动物和人类生态、基因组进化和疾病中的作用。至今,在Science,Nature,Nature Genetics,Nature Biotechnology等国际一流科技刊物上发表SCI论文28篇,承担重大基金项目5项,申请专利5项。
王军+陈义华NBT突破:用人工智能大规模挖掘人肠道菌群中的抗菌肽
① 结合3种自然语言处理神经网络模型(LSTM、Attention和BERT),建立一个从序列数据中挖掘抗微生物肽(AMP)的流程,准确率>90%;② 将该方法用于人肠道宏基因组数据,结合宏蛋白质组数据过滤,以及与肠菌的相关性网络分析,鉴定出241个候选AMP;③ 通过化学合成得到216个新型肽,证实其中181个(83.8%)有抗菌作用,这些AMP与已知AMP同源性低;④ 进一步筛选出其中的强效AMP,能通过不同机制有效抑制多重耐药革兰氏阴性致病菌,并在细菌性肺感染小鼠模型中验证了3种AMP的有效性。
03-03
谢鹏+周新雨:抑郁猴的大肠黏膜和肠腔菌群发生了什么变化?
① 雄食蟹猴随机分入慢性不可预知温和应激(CUMS)组或对照组,行为测试表明CUMS使猴子抑郁样行为增多;② 分析4个大肠区域的黏膜和腔内菌群,鉴定出两组猴的菌群组成差异,在门和科水平上,主要体现在厚壁菌门和拟杆菌门,以及普雷沃氏菌科和毛螺菌科,差异性ASV多与抑郁表型相关;③ 27个黏膜菌群功能和1个腔内菌群功能,在两组猴之间有显著差异,主要涉及碳水化合物和能量代谢;④ 肠腔代谢物分析证实,相关通路的9个代谢物在CUMS猴中降低。
2021-11-01
王军+周宏伟+解立新:建立靶向RNA的病原检测新方法mtNGS和mtTGS
① 与mNGS(二代测序技术的宏基因组)相比,mtNGS提高了微生物读长的比例,促进了细菌病原的鉴定,并能对真菌、病毒和抗生素抗性基因进行检测;② 基于纳米孔ONT的mtTGS其长读长的优势进一步提高了病原微生物的鉴定,也加快了诊断的时间;③ 利用ONT的直接RNA测序和靶向测序的结果表明其具有重要的病原检测潜力,但仍需进一步发展;④ 该研究表明靶向RNA的临床样本病原检测有更高的潜力,特别是当与ONT的发展和技术更新相结合时。
2021-10-23
仝小林+李敏+王军:葛根芩连汤调节肠道菌群,缓解大鼠糖尿病
① 分别使用葛根芩连汤(GQD)、二甲双胍(Met)或生理盐水治疗2型糖尿病大鼠12周,观测血糖、肠道屏障和炎症水平,分析肠道菌群;② GQD和Met均改善大鼠血糖、HbA1c、HOMA-IR和OGTT血糖水平;③ GQD改善结肠occludin等肠道屏障指标表达水平,降低了大鼠CRP、内毒素等炎症指标表达水平;④ GQD改善糖尿病大鼠肠道菌群多样性,升高Flavonifractor等有益菌丰度,降低Butyricimonas等条件致病菌丰度,且部分菌属和糖尿病相关生化指标密切相关。
2021-10-08
王军团队:天然淋巴细胞在胃肠道疾病中的研究进展(综述)
① 该论文综述了3种胃肠道疾病的研究进展,并展望ILC在肿瘤免疫治疗方面的可能应用;② 过敏性疾病—嗜酸性胃肠道疾病,ILC2通过响应不同信号如IL-33及TSLP等刺激分泌IL-5及IL-13导致嗜酸性粒细胞的聚集参与发病;③ 自身免疫疾病—乳糜泻,ILC1中的自然杀伤细胞可能直接损伤粘膜导致发病;④ 癌症—结直肠癌,ILC在结直肠癌中伴随肿瘤微环境的不同行使着不同功能;⑤ ILC可以结合细胞因子疗法,作为目前免疫治疗的补充手段。
2021-08-20
仝小林+曾益新+王军:菌群分析背书中医望舌诊断?
① 纳入94名志愿者收录8种舌苔类型,并采用宏基因组分析舌苔微生物群落;② 发现舌苔类型在健康人群中分布不均,但相应舌苔微生物组及其β多样性无显著差异;③ 不同舌苔类型中疾病相关特征菌丰度不同,白色宽厚油腻舌苔类型中胃炎、癌前胃炎相关致病菌富集;④ 黄色窄薄舌苔类型中机会致病菌富集,而黄色宽厚油腻舌苔鳞状细胞癌相关致病菌富集;⑤ 相同的舌苔类型中,糖尿病患者菌群有别于常人,二氧化碳嗜纤维菌属富集。
2021-07-26
蛋白质与肠道菌群互作影响机体脂代谢
① 在成年小鼠中,无论蛋白质数量和来源如何,增加饲料脂肪均增加了体重和组织重量;② 高酪蛋白(30%)促进高脂饮食的不良代谢,乳清蛋白(30%)对此有所抑制;③ 酪蛋白喂养的高脂饮食小鼠肠道通透性增加,出现低度炎症、脂质代谢改变和肝功能障碍,但乳清蛋白喂养无上述改变;④ 两者的差异效应伴随着肠道大小和与氨基酸降解和脂质代谢相关的菌群功能的不同改变;⑤ 移植酪蛋白喂养小鼠粪菌促进体重增加,而移植乳清蛋白菌群抑制体重增加。
2021-05-11
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
2022
2021
2020
中国科学院微生物研究所研究员
中国肠道大会联合发起人
中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师,国家高层次海外人才项目入选者,德国马普学会合作伙伴小组负责人,北京市科技新星。主要进行生物数据的深度挖掘和分析工作,工作中利用统计学和生物信息学结合的方法,研究肠道菌群在动物和人类生态、基因组进化和疾病中的作用。至今,在Science,Nature,Nature Genetics,Nature Biotechnology等国际一流科技刊物上发表SCI论文28篇,承担重大基金项目5项,申请专利5项。
2004-2008: 中国海洋大学生物技术专业,本科;
2008-2010: 比利时根特大学、西班牙奥维耶多大学、德国不来梅大学,联合硕士;
2010-2014: 德国普伦马普进化生物学研究所,博士。
2014-2017: 比利时鲁汶大学弗拉芒生物研究所,博士后;
2017.3-至今:中国科学院微生物研究所生物信息和计算生物学研究组组长。
主要利用统计学和生物信息学结合的方法,进行生物数据的深度挖掘和分析工作,涉及分子进化,数量遗传学,疾病的遗传学因素和环境因素,微生物生态和功能分析等。