赵立平
美国罗格斯大学应用微生物学冠名讲席教授、上海交通大学微生物学特聘教授
在国内最早系统开展微生物分子生态学研究,在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作,取得了有意义的结果。在美国科学院院报(PNAS), 国际微生物生态学会会刊(ISME Journal)、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物发表论文四十余篇,2012年6月,美国《科学》周刊曾对他的研究工作做过专题报道(Science 336: 1248)。
肠道菌群或是环境和健康之间的桥梁
① 肠道微生物组受到宿主环境的强烈影响,并影响宿主的代谢、免疫和神经内分泌功能,同时也可反应因社会不平等、种族及其他歧视所带来的健康不平等;② 通过影响或干预肠道菌群可以促进人群健康结果,这可以体现在影响儿童营养不良,或营养过剩相关疾病、早产与神经发育、心理健康、COVID-19感染等方面;③ 同时,生命早期的菌群及代际间的菌群动态与健康密切相关;④ 调控肠道菌群,比如靶向生物医疗干预和生态干预,或可缓解健康不平等现象。
06-14
上海交大张晨虹:生酮饮食对糖脂代谢、肠道菌群及代谢产物的影响
① 小鼠摄入两种生酮饮食(KDR含89.5%脂肪,KDH含91.3%脂肪);② KDR导致小鼠的胰岛素抵抗和血糖稳态受损,KDH促进脂质积累,KDR损伤糖代谢与其较高的反式脂肪酸含量相关;③ KDR与KDH均改变了小鼠的肠道菌群和代谢产物,降低短链脂肪酸及色氨酸代谢产物,增加脱氧胆酸;④ KDR富集拟杆菌属等与血糖稳态失调指标正相关的细菌,KDH富集毛螺菌科等与脂肪积累指标正相关的细菌;⑤ 临床试验常用的生酮饮食配方也可引起小鼠的胰岛素抵抗及脂肪积累。
03-30
赵立平团队:“功能群”分析或是人类肠道菌群研究的突破口
① 肠道微生物组数据存在高维度和高稀疏性的特点,这使得鉴定出驱动疾病表型的微生物困难重重;② 目前基于分类单元和基于基因的菌群分析方法,能有效降低数据维度和稀疏性,但都存在缺陷;③ 比如:忽视了未知的细菌和基因,且由于同一分类单元内不同成员间可存在巨大的功能差异,而难以建立分类单元与疾病表型的联系;④ 应采用更具有生态相关性的分析方法,通过将微生物(菌株)聚集成“功能群”来识别与疾病有因果关系的候选肠道细菌。
02-09
赵立平团队:活跃期益生元改善小鼠脂肪肝
① 益生元显著改变高脂饮食喂养小鼠肠道菌群,改善肝脏脂肪变性和降低血清胆固醇,而其体重无显著变化;② 干预7天后,共有包含狄氏副拟杆菌,多形拟杆菌、粪杆菌和Akk菌等的8/32个共丰度组(CAG)响应益生元干预增殖;③ 其中,与无限制干预相比,含毛螺菌科和双歧杆菌的CAG在活跃期干预组丰度更高;④ 益生元促进的CAG与改善肝脏脂肪变性、降低胆固醇水平以及增加粪便丙酸增加显著相关;⑤ 活跃期益生元干预通过肠道菌群及SCFAs干预肝脂肪变性。
2020-12-24
赵立平等:菌群研究走向因果,回归培养必不可少(Nature Reviews年度回顾)
① 回顾今年3项使用细菌纯培养来阐释潜在的致病或保护性肠道细菌的作用机制的研究;② 分离自人结直肠癌(CRC)组织的产基因毒素大肠杆菌菌株,能诱导与其长期共培养的人肠道类器官发生类似CRC患者的基因突变特征;③ 小鼠的F. BP1菌株及其对应的人肠道菌H. biformis,通过产生丁酸,在CRC小鼠模型中发挥抗肿瘤作用;④ 通过对细菌和无菌小鼠进行遗传操作,证明了LPS-TLR4的互作是源自肥胖患者的阴沟肠杆菌B29引发肥胖相关表型的关键上游事件。
2020-12-21
赵立平团队等:过度生长的产内毒素肠菌,可诱导脂肪肝
① 从肥胖脂肪肝患者中分离出阴沟肠杆菌B29等3株在肠道内过度生长的产内毒素致病共生菌;② 用这些菌对高脂喂养的无菌小鼠进行单菌株定植,可诱发非酒精性脂肪性肝病(NAFLD),而定植内毒素活性明显较低的共生菌多形拟杆菌则不会引起NAFLD;③ 敲除细菌内毒素合成通路中的waaG基因,以及敲除小鼠TLR4,均导致阴沟肠杆菌B29无法引发炎症和NAFLD,提示LPS-TLR4互作是NAFLD最上游和重要的分子事件。
2020-02-04
上海交大张晨虹团队:节食时间影响小鼠肠道菌群和代谢表型
① 不论白天或夜间(活动期)进食,节食都能改善小鼠代谢,但与夜间进食(CRD)相比,白天进食(CRL)的小鼠表现出肌肉减少等代谢表型差异,及菌群结构和组成的差异;② 恢复自由取食后,CRL小鼠出现大量进食行为,而CRD小鼠更能保持节食对脂肪积累、糖代谢、肠屏障和炎症指标的改善效果;③ 进食时间影响肠道菌群,被节食富集的乳杆菌属OTU在CRD小鼠里丰度更高;④ 恢复自由取食后,CRD小鼠菌群变得接近未节食的小鼠,而CRL小鼠菌群仍有差异。
2019-12-03
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
2021
2020
FACADemonstration of causality: back to cultures
Nat Rev Gastroenterol Hepatol, 10.1038/s41575-020-00400-6
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2019
2018
CAMicrobiome: from community metabolism to host diseases
Sci China Life Sci, 10.1007/s11427-018-9335-8
一种中生菌素母药清洁生产方法 CN106865804A 2017.06.20
富勒烯作为调节微生物生长或代谢的调节剂的用途 CN103789251A 2014.05.14
平衡肠道菌群结构改善代谢综合症的全营养组合物及应用 CN102987383A 2013.03.27
悉生动物肥胖模型的构建方法及其应用 CN102792919A 2012.11.28
改善肠道菌群结构的方法及应用 CN102743420A 2012.10.24
美国罗格斯大学应用微生物学冠名讲席教授
上海交通大学微生物学特聘教授
在国内最早系统开展微生物分子生态学研究,在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作,取得了有意义的结果。在美国科学院院报(PNAS), 国际微生物生态学会会刊(ISME Journal)、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物发表论文四十余篇,2012年6月,美国《科学》周刊曾对他的研究工作做过专题报道(Science 336: 1248)。
1979-1983,山西农业大学植物保护专业,学士
1983-1989,南京农业大学分子植物病理学专业,博士
1989-1993,山西省农业科学院生物技术研究所副所长
1993-1995,康奈尔大学植物病理学系访问学者
1995-1997,山西大学生物技术研究所副教授
1997-2001,山西大学生物技术研究所教授,主任
2000.4-2000.7,南卡罗莱纳大学土木工程系客座教授
2001-2017,上海交通大学生命科学与生物技术学院微生物学教授
2005-2009,上海系统生物医学研究中心常务副主任
2012.9-2013.4,美国犹他州普罗沃杨百翰大学客座教授
开发分子和基因组工具,用于理解和预测操纵人类和动物肠道中复杂的微生物群落
了解饮食与肠道微生物群之间在慢性疾病如肥胖和糖尿病的发病和进展之间的相互作用
制定中药饮食与现代饮食相结合的干预措施,调节肠道微生物群落与人类的关系,实现预防保健
美国微生物科学院院士(2014年)
Journal of Molecular Medicine,FEMS Microbiology Ecology,Microbial Biotechnology等国际刊物编委;ISME Journal(国际微生物生态学会会刊,影响因子9.3)的资深编辑,Scientific Report编委。