吴崇明
中国医学科学院药用植物研究所副研究员
长期致力于肠道菌群与疾病和药物的相互作用研究,建立了独立、完整、国际领先的肠道微生物组研究平台,在肠道微生物组测序、定量宏基因组检测、人类肠道细菌纯培养、菌株水平的人类肠道细菌生理功能、基因组信息、代谢组信息,以及肠道细菌介导药物体内功效以及抗致病菌(抗生素替代)等领域均获得了突破性的进展。(1)开发了成本接近16S测序但精度达到菌种水平的新型菌群测序方法,使人们能够以低成本开展大规模菌群样品的实验检测;(2)可执行对皮肤拭子、母乳、胃灌流液等微量微生物样品的精准全基因宏基因组测序,使人们对痕量DNA样品的菌群组成认知突破16S测序的限制,达到菌种水平;(3)实现了基于spike-in的定量宏基因组测定,使微生物组检测从定性走向定量;(4)建立了包含7万余株单菌的人类肠道活菌库,使人们能够对每一种肠道菌的功能进行实验验证,将菌群研究从关联性分析提升到实证性检验;(5)完了1万余株肠道单菌株的降糖、降脂、降尿酸和产GABA功能的高通量筛选,首次在菌株水平对人类肠道菌的功能进行全面扫描,将人们对肠道菌功能的认知从微生态层面深入到菌株水平;(6)建立了包含8000余株人类肠道菌的参考基因组信息库,包含200余个新种;完成了500株肠道细菌的非靶向代谢组学分析,建立了200余种肠道菌的参考代谢组学信息库;(7)揭示了多种药物和营养物发挥功效的肠道分子机制,发现了多个极具开发潜力的新型药物或食品资源。这些工作将肠道菌群研究工作大幅推向精准。
国内团队:微塑料和纳米塑料扰肠菌、伤肠道
① 对小鼠饲喂微米级和纳米级两类塑料颗粒,持续28天,导致小鼠肝、肾、脾明显损伤,肠道屏障受损,肠屏障的损伤程度:氨基修饰>羧基修饰>无修饰的颗粒;② Caco-2肠上皮细胞模型中发现,塑料颗粒虽可被内吞,但没有明显的细胞毒性,对紧密连接、旁通透性也无明显影响;③ 然而,塑料颗粒改变了肠道菌群结构,富集了损伤肠屏障的条件致病菌,减少了促进紧密连接功能的有益菌,可能促进了微/纳米塑料颗粒对肠屏障的损伤。
2021-04-07
高能所邢更妹+药植所吴崇明等:警惕食品中添加的二氧化钛纳米颗粒
① 二氧化钛纳米颗粒(TiO2 NP)被广泛应用于口香糖、糖果、布丁中,其对肠道菌群的影响尚未明确;② 小鼠分别口服两种晶相的TiO2 NP(金红石及锐钛矿)28天,钛元素在脾脏、肺部、肾脏中聚集,但对器官组织学特征无显著影响;③ 金红石NP(而非锐钛矿NP)可增长肠绒毛,并导致不规则的绒毛上皮细胞排列;④ TiO2 NP不会降低肠道菌群多样性,但改变了肠道菌群的结构,金红石NP的影响更为显著;⑤ 不同晶相的TiO2 NP对不同菌属的影响不同。
2018-03-28
中国医学科学院药用植物研究所副研究员
长期致力于肠道菌群与疾病和药物的相互作用研究,建立了独立、完整、国际领先的肠道微生物组研究平台,在肠道微生物组测序、定量宏基因组检测、人类肠道细菌纯培养、菌株水平的人类肠道细菌生理功能、基因组信息、代谢组信息,以及肠道细菌介导药物体内功效以及抗致病菌(抗生素替代)等领域均获得了突破性的进展。(1)开发了成本接近16S测序但精度达到菌种水平的新型菌群测序方法,使人们能够以低成本开展大规模菌群样品的实验检测;(2)可执行对皮肤拭子、母乳、胃灌流液等微量微生物样品的精准全基因宏基因组测序,使人们对痕量DNA样品的菌群组成认知突破16S测序的限制,达到菌种水平;(3)实现了基于spike-in的定量宏基因组测定,使微生物组检测从定性走向定量;(4)建立了包含7万余株单菌的人类肠道活菌库,使人们能够对每一种肠道菌的功能进行实验验证,将菌群研究从关联性分析提升到实证性检验;(5)完了1万余株肠道单菌株的降糖、降脂、降尿酸和产GABA功能的高通量筛选,首次在菌株水平对人类肠道菌的功能进行全面扫描,将人们对肠道菌功能的认知从微生态层面深入到菌株水平;(6)建立了包含8000余株人类肠道菌的参考基因组信息库,包含200余个新种;完成了500株肠道细菌的非靶向代谢组学分析,建立了200余种肠道菌的参考代谢组学信息库;(7)揭示了多种药物和营养物发挥功效的肠道分子机制,发现了多个极具开发潜力的新型药物或食品资源。这些工作将肠道菌群研究工作大幅推向精准。
迄今发表科研论文83篇,其中SCI论文57篇,总影响因子220+,被引用1500余次。其中以通讯作者或第一作者发表论文50篇,包含中科院1区期刊论文7篇,IF>5论文11篇。H-index 21, RScore 32.79,超过全球90%的研究人员。
作为主持人先后获得中国博士后科学基金1项、中国医学科学院青年医学人才奖励项目1项、中国医学科学院创新团队骨干项目1项、和国家自然科学基金项目3项。
担任Journal of Integrative Nephrology and Andrology和Diseases & Research等期刊编委,担任《中国消费者报》学术顾问,并长期担任Phytomedicine, J Agr Food Chem, J Funct Foods, Nanoscale, Nanomedicine等近50种SCI期刊的特约审稿人。