去污染算法

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去污染算法

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宏基因组测序

中科院团队建立微量样本的宏基因组学研究方法

宏基因组测序大大扩展了人们对各种生态位中菌群的理解。然而，将低于1ng的DNA转换为高质量的宏基因组文库并且获得高保真数据仍然面临挑战。本研究中作者评估了多种文库制备方法在0.5 pg-5 ng合成菌群DNA上的表现，描绘了污染特征，并进一步应用不同算法去除污染。本研究证明，结合适当的文库制备方法和去污染算法，可以从低于1ng的微量DNA样本中获得高质量宏基因组数据。本研究为不同微生物载量的样本的宏基因组学研究方法提供了参考。

宏基因组测序内切酶文库制备异质性去污染算法