Michael Inouye

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Michael Inouye

文章数：4篇

慢性肺部疾病

肠道菌群是慢性肺部疾病的重要危险因素

Journal of Allergy and Clinical Immunology近期发表的文章，通过分析大规模前瞻性人群队列的肠道菌群与慢性肺部疾病的关系，发现肠道菌群是哮喘和慢性阻塞性肺病发病的重要危险因素，且独立于常规危险因素。

慢性肺部疾病肠道菌群哮喘慢性阻塞性肺病（COPD）

Faith系统发育多样性

Rob Knight团队：Faith系统发育多样性的高效计算及其在菌群特征分析中的应用

基于系统发育、系统基因组树和稀疏数据分析的算法和资源进步的推动，作者开发了一种新的算法——即 Stacked Faith 的系统发育多样性 (SFPhD)，用于快速计算 Faith's PD。此外，作者旨在证明基于系统发育分析的在宏基因组研究中是值得关注的角度，之前在这些研究中该指标不常使用。基准测试的代码可在 GitHub (https://github.com/biocore/faiths-pd-benchmarking) 上找到。对 FINRISK 宏基因组数据进行基准测试所需的数据和代码也可在 GitHub 上获得。SFPhD 代码可在 unifrac Python 包 (https://github.com/biocore/unifrac) 中找到。

Faith系统发育多样性 SFPhD 计算资源多样性差异算法

肠道菌群与健康食物摄入显著相关

膳食影响肠道菌群，进而影响机体的健康或疾病状态。American Journal of Clinical Nutrition近期发表研究人群研究，关注健康食物与肠道菌群丰度的关联，发现肠道菌群的α和β多样性均与特定健康食物有关。植物基或者富含膳食纤维的食物可能更利于维持肠道菌群的多样性以及短链脂肪酸（SCFA）的产生。

健康饮食肠道菌群丰度菌群结构

Nature子刊：肠杆菌科富集＝更高的死亡风险？

Nature Communications上发表的一项前瞻性队列研究结果，对超过7000名芬兰人进行15年随访，发现肠道菌群的组成及功能与死亡率相关，尤其是肠杆菌科的富集与更高的全因死亡率、胃肠道疾病死亡率及呼吸道疾病死亡率相关。

死亡率研究论文前瞻性队列研究