噬菌体宿主

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噬菌体宿主

朱怀球团队：从宏病毒组中识别噬菌体片段宿主的工具HoPhage

借助宏基因组学技术，鉴定出大量无法培养的新型噬菌体，与自然携带直接宿主信息的传统基于培养的方法相比，宏基因组方法，尤其是宏病毒组，缺乏噬菌体与其细菌宿主之间的联系。因此，对开发用于短噬菌体片段宿主识别的计算工具的需求不断增加。北京大学朱怀球团队近期在Bioinformatics发表的研究中，考虑到真实群落宏基因组数据中的噬菌体片段长度较短，微生物群落的分类组成复杂，开发了HoPhage（噬菌体宿主），并展示了它在更广泛的候选宿主范围内识别短噬菌体片段宿主的良好性能。HoPhage 可在网址 http://cqb.pku.edu.cn/ZhuLab/HoPhage/ 中使用。

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