微流体芯片

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呼吸道菌群

国内团队：微流体芯片+全基因组扩增，助力呼吸道菌群分析

目前对呼吸道疾病中起重要致病作用的微生物群落的分类和基因功能尚不清楚，其中一个关键原因是呼吸道样本中宿主细胞/DNA的严重污染，阻碍了后续微生物基因组测序。mSystems发表的来自北京基因组研究所康禹+北京大学人民医院高占成团队的文章，描述了一种微生物样品收集和扩增的新方法(简称为MEEA)，先用微生物富集微流体装置大量富集微生物，然后在大量液滴中进行的DNA扩增，制备呼吸道微生物测序样品。在模拟样本和临床痰液样本的检测中，这种方法能有效地去除宿主细胞，扩增微生物基因组，且微生物之间没有明显的偏差，并且能分析到菌株水平，可更有效地发现前噬菌体以及对病原菌优势株进行更加全面地分析。MEEA在研究呼吸道微生物结构中具有广阔的应用前景。

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