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Shuaicheng Li
文章数:4篇
肠易激综合征
方晓东+卞兆祥+李帅成:IBS患者的代谢组和菌群变化
ISME Journal近期发表了广州中医药大学方晓东、香港浸会大学卞兆祥、香港城市大学李帅成作为共同通讯作者的研究,通过对两个队列共400余人的粪便和血清样本进行分析,揭示了肠易激综合征(IBS)患者中的血清/粪便代谢组的改变及其与肠道微生物组的关系。该研究强调了IBS中的血清代谢物变化或能用于临床诊断,提示代谢失调或参与了IBS的发病机理,并为理解IBS抑郁症的合并症提供了新的线索。
肠易激综合征
抑郁
肠道菌群
粪便代谢组
血清代谢组
菌株
香港城市大学:宏基因组菌株分析的新算法
鸟枪法宏基因组测序使我们能够实际分析菌群中的菌株。然而,由于菌株之间的序列高度相似,目前的方法还不完善。作者发现可以通过基因型频率推测在同一单核苷酸变异(SNV)基因座处的菌株基因型,以及相同读长覆盖的不同基因座中的变异可以提供证据,证明它们存在于同一菌株上。基于此作者设计了PStrain算法,可以根据基因型频率和覆盖多个SNV基因座的读长从鸟枪法宏基因组测中迭代地推断菌株。
菌株
鸟枪法宏基因组测序
基因型频率
大肠癌肠道菌群
单核苷酸变异(SNV)
结直肠癌
国内团队:来自粪菌的大肠癌生物标志物
结直肠癌(CRC)在世界范围内具有很高的发病率和死亡率,而非侵入性肠道微生物组(GM)生物标志物在CRC早期诊断中具有巨大潜力。然而,根据种族、饮食和生活环境的不同,GM生物标志物在不同地区的表现也存在显著差异。来自重庆军医大学附属第一医院的Peiwu Yu、香港城市大学的Shuaicheng Li以及来自华中科技大学的周可研究团队,最新发表在Gut Microbes的研究对中国重庆52例结直肠癌(CRC)患者和55名共同生活的健康家庭成员粪便进行宏基因组关联分析,发现22个微生物基因可作为CRC生物标志物。该方法对对来自香港和法国的队列同样适用。与以前的生物标志物相比,该研究报道的GM生物标志物增加了敏感性和适用性,显著促进了CRC的早期诊断。
结直肠癌
Biomarkers
colorectal cancer
Family cohort
gut microbiome
鼻咽菌群
Genes:肺炎患儿的鼻咽菌群及口咽菌群变化
这是深圳儿童医院和香港城市大学团队发表在Genes[IF:3.600]的肺炎患儿的鼻咽和口咽菌群研究,值得专业人士关注。
鼻咽菌群
口咽菌群
肺炎支原体肺炎