ChIP-seq分析

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ChIP-seq分析

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SWI/SNF(BAF) 染色质重组复合物

SWI/SNF缺失致癌机制：谱系特异性增强子失活

① 约20%恶性肿瘤存在SWI/SNF染色质重组复合物亚基的编码基因异常，在转录调控和抑制肿瘤中起重要作用；② 采用小鼠胚胎成纤维细胞和肿瘤细胞株模型，ChIP-seq等方法，SWI/SNF优先靶向远端谱系特异性增强子，与p300相互作用调控组蛋白H3赖氨酸27位点乙酰化，典型及非转录区的增强子对SWI/SNF的需求更大；③ SWI/SNF依赖性远端增强子是调控与发育过程相关基因表达的基础；④ 特定背景下，分化潜能的缺失，是SWI/SNF亚基缺失引起肿瘤形成的机制。

SWI/SNF(BAF) 染色质重组复合物谱系特异性增强子小鼠胚胎成纤维细胞 ChIP-seq分析