张志刚
云南大学研究员、中国科学院昆明动物研究所研究员
中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室研究员,博士生导师,云南省中青年学术后备人才。以(共同)第一作者或(共同)通讯作者发表SCI论文近20篇,承担重大科研项目5项。
张志刚团队: 人类和非人灵长类肠道菌群的趋同及独特的年龄变化模式
① 选择3种非人灵长类动物(狐猴、黑猩猩和恒河猴)和4个人群(中国、意大利、日本、英国)共913个样品,分为年轻和年老两组;② 结合泛基因组分析发现, 6个具有产丁酸潜力的抗炎特征菌属(Coprococcus、罗斯氏菌属、Gemmiger、普雷沃菌属、Prevotellamassilia 和粪杆菌属)与衰老密切相关;③ 恒河猴的66种血浆差异代谢物发生了年龄相关变化,其中羟脯氨酸和亮氨酸分别与普雷沃菌属和Prevotellamassilia呈显著正相关;④ 泛基因组分析6个特征菌属可以合成亮氨酸和精氨酸,宿主可利用精氨酸生成羟脯氨酸和脯氨酸。
06-27
于黎+张志刚+陈武:肠道菌群研究助力穿山甲圈养保护
① 饮食组成差异与抗生素使用会造成圈养和野生穿山甲肠道菌群组成改变和功能差异;② 短时圈养组和野外组的肠道菌群组成更相似,圈养时间增加和抗生素使用加大了圈养组和野外组的肠道菌群差异;③ 圈养组肠道菌群对多糖类和脂肪酸等代谢能力增强,野外组具有更强的代谢外源物质能力;④ 圈养穿山甲中抗性基因和毒力因子的种类和数量明显增加,其中与胃肠道炎症相关的毒力因子数量显著增加,揭示了圈养穿山甲易患胃肠道疾病的潜在机制。
2021-08-05
国内团队:COVID-19感染导致儿童上呼吸道和肠道菌群持续失衡
① SARS-CoV-2感染改变了儿童上呼吸道和肠道的菌群结构;② 儿童在新冠感染后的2个月内菌群持续失衡且极具波动,甚至到康复出院后的2–3周;③ 感染儿童的上呼吸道和肠道菌群展现不同步的动态演化趋势;④ 上呼吸道和肠道菌群协调恢复在新冠病毒感染的儿童和成人间存在明显差别,儿童的菌群相对脆弱,易受干扰;⑤ 新冠病毒对儿童上呼吸道和肠道菌群发育的长期影响及其带来的潜在健康风险值得持续关注。
2021-05-29
龙瑞军+张志刚等:牦牛肠道菌群揭秘如何适应青藏高原季节变迁
① 研究季节性转场放牧和连续开放式放牧中,青藏高原季节变迁对牦牛膳食与肠道菌群互作的影响;② 牦牛饲粮全年以禾本科和蔷薇科植物为主,冬、夏成分差异大,冬季更多样;③ 菌群在两种放牧方式中均呈现显著季节动态,且季节性饲粮的周转和菌群组成变化一致;④ 季节间饲粮和菌群差异高于季节内,季节内饲粮差异大于菌群,菌群的丰度与膳食不相关;⑤ 牦牛肠型根据冷暖季节的膳食变化改变,冬季呈现AKK菌-WCHB1-41主导肠型,高效利用氮和能量。
2021-04-20
张驰宇+张志刚等:新冠患者上呼吸道和肠道菌群之间的动态关联
① 纳入35名新冠肺炎患者、19名健康成人、以及10名有其他疾病的非新冠肺炎患者,纵向分析其咽拭子和肛拭子中的菌群结构;② 根据上呼吸道和肠道的菌群构成,新冠肺炎成年患者可分为4种咽型(I–IV)和3种肠型(I–III);③ 新冠肺炎患者的咽部和肠道菌群多样性低于健康对照组,病程期间菌群动态变化复杂,分别由各自的I型逐渐变为咽部III型和肠道IV型;④ 6/8名轻症新冠肺炎患者的上呼吸道和肠道菌群,从早期失衡向后期多样化状态同步恢复。
2021-02-18
张志刚团队:新冠病毒可能来自穿山甲吗?
① 对已发表的马来穿山甲肺部样本病毒组数据进行进行重新组装,鉴定出与SARS-CoV-2相近的冠状病毒,命名为Pangolin-CoV;② 该病毒与SARS-CoV-2的基因组相似度为91.02%,仅次于蝙蝠冠状病毒RaTG13,可能是二者的共同起源;③ 该病毒的S1蛋白比RaTG13更接近SARS-CoV-2,其涉及与人类ACE2受体互作的5个关键氨基酸残基与SARS-CoV-2完全一致;④ 这3个病毒中,仅SARS-CoV-2在S蛋白的S1/S2酶切位点含有与MERS-CoV类似的潜在Furin蛋白识别序列。
2020-03-19
复旦雷群英团队:减少饮食中的支链氨基酸,或可抑制胰腺癌
① 在胰腺上皮内瘤变(PanIN)及胰腺导管腺癌(PDAC)患者及小鼠的病变组织中,BCAT2表达显著上调;② 特异性敲除胰腺中的BCAT2或BCAT2抑制剂均可抑制KC小鼠的PanIN进展;③ BCAT2通过增强BCAA的吸收,以维持BCAA的分解代谢及线粒体呼吸;④ BCAA可以剂量依赖性方式增强KC小鼠的胰腺导管类器官的生长,而BCAT2抑制剂可抑制其生长;⑤ KRAS可抑制SYK介导的磷酸化,以减少TRIM21 E3连接酶介导的BCAT2降解;⑥ 低BCAA饮食可抑制PDAC小鼠模型的疾病进展。
2020-02-06
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
2022
2021
2020
2019
2016
2015
云南大学研究员
中国科学院昆明动物研究所研究员
云南省万人计划青年拔尖人才
中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室研究员,博士生导师,云南省中青年学术后备人才。以(共同)第一作者或(共同)通讯作者发表SCI论文近20篇,承担重大科研项目5项。
1998.09-2002.07,内蒙古农业大学,学士
2003.09-2008.12,云南农业大学,博士
2009.02-2013.12,中国科学院昆明动物研究所助理研究员
2014.01-2016.12,中国科学院昆明动物研究所副研究员
2017.01-至今,中国科学院昆明动物研究所研究员
动物肠道微生物与动物适应性性进化
肠道微生物与多细胞动物宿主的协同进化
探索肠道微生物干预或调控动物复杂性状的机制机理
预防医学协会云南省微生态分会副主任委员
云南省万人计划青年拔尖人才
云南省自然科学一等奖(2018)