王金锋
中国农业大学杰出人才、中国农业大学食品科学与营养工程学院教授、博导
从事生物组学与食品营养学科交叉融合方向的研究,聚焦菌群及代谢与宿主健康之间的密切联系。迄今已在Cell、Gut、Nature communications等杂志上发表第一(或并列第一)作者和通讯作者论文20余篇,累计引用超千次,作为项目负责人主持了4项国家自然科学基金课题。
王金锋+赵方庆:婴儿肠道菌群的肠型和演变模式
① 分析17国1956名婴儿前3岁的13776个粪便菌群,发现可分为4个肠型,分别以厚壁菌门、双歧杆菌属、拟杆菌属和普氏菌属为主导;② 厚壁菌和双歧杆菌肠型对应早期发育阶段,群落结构较不稳定、菌群成熟度较低,而拟杆菌和普氏菌肠型对应后期阶段,菌群多样性较高、群落内联系更强;③ 生态模型和功能分析表明,从婴儿向成年的菌群转变模式是确定的、可预测的,厚壁菌和双歧杆菌肠型随成长而被拟杆菌和普氏菌肠型所替代,伴随代谢通路的变化。
08-24
赵方庆+王金锋:阴道菌群移位可影响子宫健康
① 分析145名女性的阴道和子宫菌群,结合挖掘已报道数据和动物实验,来研究女性生殖道中的微生物移位现象及其对子宫健康的影响;② 子宫和阴道菌群有显著差异,但二者存在同步变化且随年龄增长逐渐趋同,流产史和分娩方式影响二者的群落结构和相似性,慢性子宫内膜炎中存在子宫和阴道菌群失调;③ 大鼠中,向阴道移植菌群可影响子宫菌群的组成,特定的阴道细菌可诱导或减轻子宫内膜炎;④ 阴道菌群的上行移位可影响子宫菌群和子宫内膜健康。
07-07
张红萍+王金锋:口腔菌群助力识别妊娠糖尿病
① 妊娠糖尿病(GDM)患者的两种口腔样本(唾液和牙菌斑)的菌群,与牙周炎或龋病患者的口腔菌群表现出显著差异;② GDM与牙周炎之间可能的关系可能与链球菌属和韦荣球菌属的丰度降低有关,就菌群的变化而言,GDM与龋病之间几乎没有关系;③ 利用口腔菌群中的细菌生物标志物,构建了基于支持向量机和随机森林算法的GDM分类模型;④ 唾液或牙菌斑中的某些细菌可以有效区分GDM孕妇和健康孕妇。
01-20
北京师范大学团队:空气污染增加新生儿黄疸风险
① 纳入北京市25782名新生儿数据,并收集同期空气污染监测站的数据;② 暴露在PM2.5浓度在10-35、35-75、75-200ug/m3的儿童,其胆红素水平随着PM2.5的浓度每增高一个单位,胆红素分别增高0.076、0.029、0.009mg/dL;③ 暴露于SO2浓度10-15、>15ug/m3的儿童,其胆红素随着SO2浓度每增高一个单位,分别增高0.094、0.161mg/dL;④ 胆红素水平随着CO增加一个单位,每增加0.351mg/dL;⑤ 胆红素的增加与上述污染物的暴露时间呈线性递增关系。
2019-08-20
赵方庆团队:洗牙后口腔菌群的变化和重建
① 对9名个体洗牙前和之后3个月11个时间点采样,分析唾液和牙菌斑菌群的纵向变化;② 牙菌斑菌群在整个过程中波动明显,洗牙后7小时到3天,其组成与洗牙前差异最大;③ 唾液菌群相对稳定,是牙菌斑菌群的主要补充来源;④ 牙菌斑生物膜的菌群组成变化可分3个时期:洗牙后菌群解构,1天后严重偏离原始状态,3天后重建直至逐渐恢复;⑤ 聚类和共现网络分析显示,在中期变化剧烈的细菌与早期定植菌发生互作,可能在牙菌斑生物膜发育中有关键作用。
2019-06-20
赵方庆等:孕期健康可塑造新生儿的初始菌群
① 分析486名孕妇和新生儿出生时多个身体部位的样本(口腔、咽喉、肠道等);② 新生儿样本中有丰富的细菌类群,不同部位菌群各有特征,提示新生儿的菌群定植应发生在出生前;③ 患妊娠期糖尿病(GDM)的孕妇及其新生儿的菌群明显改变,二者间存在一致的变化趋势,不同部位的菌群结构差异降低,某些细菌与口服糖耐量试验结果强相关;④ GDM新生儿胎便的菌群均匀度降低、代谢功能通路减少、某些病毒丰度上升;⑤ GDM改变孕妇及新生儿出生时的菌群。
2018-05-14
赵方庆团队:突破宏基因组组装难题的新方法MetaSort
① 大部分分析宏基因组数据的现有方法有赖于参考基因组,而新的微生物群落的数量远远超出参考数据库的覆盖范围,从复杂的微生物群落做从头合成的宏基因组组装仍然是巨大挑战;② 研究者建立了新的实验和生物信息学平台MetaSort,用于宏基因组样本中细菌基因组的有效组装;③ MetaSort提供基于流式细胞仪和单细胞测序方法学的分类迷你宏基因组方法,并采用新的计算算法以有效地从分类迷你宏基因组并结合原始宏基因组中重建高质量基因组;④ MetaSort在基因组重建和组装中表现优异且无偏性,利用它分析在一种海藻表面定殖的未被探究的菌群,一次性成功重建75个高质量基因组。
2017-01-23
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
2021
2020
2019
中国农业大学杰出人才
中国农业大学食品科学与营养工程学院教授、博导
从事生物组学与食品营养学科交叉融合方向的研究,聚焦菌群及代谢与宿主健康之间的密切联系。迄今已在Cell、Gut、Nature communications等杂志上发表第一(或并列第一)作者和通讯作者论文20余篇,累计引用超千次,作为项目负责人主持了4项国家自然科学基金课题。
2000.09—2004.07,沈阳师范大学,学士
2004.09—2007.07,南京师范大学,硕士
2007.09—2010.07,中国科学院海洋研究所,博士
2011.01—2015.12,中国科学院北京生命科学研究院,助理研究员
2016-01~2021-03:中国科学院北京生命科学研究院,副研究员
2021-04~至今:中国农业大学食品科学与营养工程学院,教授
多组学整合评价人体健康及膳食维护效果
靶向消化道菌群的母婴及孕产期精准营养
噬菌体及病毒组技术在食品安全中的应用