张涛
华大生命科学研究院研究员
张涛,博士,2011年加入华大基因,重点推动复杂疾病的健康应用。关注心脑血管,肿瘤等方向研究。目前已累计发表SCI论文26篇,以第一作者以及通讯作者发表Nature Genetics 2篇,Cell Discovery 2篇,Annals of the Rheumatic Diseases 1篇等。多次受邀为Nature Genetics,Microbiome等杂志审稿
张涛+贾慧珏:Nature子刊揭示肠道菌群与血液代谢物间的因果关系
① 纳入2个中国队列(发现+验证,共3432人),用双向孟德尔随机化挖掘肠道菌群(如肠菌、菌群功能)与人体代谢特征的因果关联;② 鉴定出菌群与血液代谢物间的58个因果关联(17个菌→血,41个血→菌),复证了43个;③ 如Oscillibacter和Alistipes可降低血液甘油三酯,而血液谷氨酸可使草酸杆菌属减少,5-甲基四氢叶酸、丙氨酸、谷氨酸盐和硒等可影响变形菌门成员;④ 用日本生物库数据验证了部分发现,并延伸鉴定出肠菌与多种疾病的因果效应。
01-03
刘小敏+张涛+贾慧珏:基因决定口腔微生物组组成
① 首次对1915个人舌背、唾液宏基因组数据和基因组进行了关联分析,发现5个遗传位点与口腔微生物组具有关联性;② 基于1439人的队列分析,验证了其中4个位点与口腔微生物的关联;③ APPL2、SLC2A9、OR11H1和LOC105371703的特定SNP分别与舌苔菌Prevotella jejuni等、OribacteriumuSGB 1215等、F0422 uSGB 392和Eggerthia相关;④ 宿主miRNAs具有调控特定口腔细菌生长的能力;⑤ 基因组和微生物组数据的机器学习可用于预测牙周疾病。
2021-12-07
揭著业+贾慧珏:人类口腔微生物基因组目录
① 研究收集了4154例人类口腔宏基因组样本,重新组装获得56213个质量合格宏基因组组装基因组(MAG);② 整合公共数据库及已发表的宏基因组数据,新获得的MAG中的物种水平基因组(SGB)大于参考库,可代表口腔宏基因组数据;③ 高质量MAG中uSGBs构成的进化枝发现了无胆甾原体目中新的细菌类群Candidatus Bgiplasma;④ 菌株水平检测到奈瑟菌属、卟啉单胞菌属和普氏菌属等,预测了人类疾病相关基因;⑤ 发现一株在男性中富集的弯曲杆菌属菌株。
2021-09-04
张涛+贾慧珏+侯勇:深度剖析中国人的遗传-菌群关联
① 纳入632名中国人,通过深度全基因组和宏基因组测序,分析宿主遗传和肠道菌群的关联,并在另外663人的队列中进行验证;② 鉴定出与特定细菌分类群显著相关的37个基因座、47个基因和18个拷贝数变异,可共同解释至少20%的肠道菌群组成;③ 这些遗传信号主要集中在代谢、神经和免疫功能等方面;④ 鉴定出2个与肠型有关的基因座,解释11%的普氏菌肠型和拟杆菌肠型的差异;⑤ 鉴定出33个男性特异和37个女性特异的菌群-宿主遗传关联。
2021-02-09
马现仓+贾慧珏等:精神分裂症患者的肠道微生物组特征
① 收集90例未经治疗的精神分裂症患者和81例对照的粪便样本,通过宏基因组关联分析鉴定出83个相对丰度有显著差异的OTU;② 患者菌群中,兼性厌氧菌和口腔菌增多,短链脂肪酸合成、色氨酸代谢、多种神经递质的合成/降解等功能潜力发生改变;③ 包含26个OTU的诊断模型可较准确的区分患者和对照(AUC=0.896),并在测试队列中得到确认(AUC=0.765);④ 移植患者中富集的前庭链球菌,可诱导小鼠的精神分裂症样行为、改变外周神经递质水平。
2020-03-31
马现仓+贾慧珏等:肠道菌群异常可影响色氨酸代谢,促进小鼠精神分裂症状
① 给抗生素处理的小鼠移植健康人(HC)或精神分裂症(SCZ)患者的粪菌;② SCZ小鼠有精神运动亢进和认知损伤等SCZ样症状;③ SCZ小鼠的色氨酸(Trp)水平降低,大脑和血液中Trp分解代谢的犬尿氨酸(Kyn)-犬尿喹啉酸(Kyna)通路活性上升,脑内特定区域的神经递质多巴胺和5-羟色胺增多;④ SCZ小鼠的结肠腔滤液可促进Trp-Kyn-Kyna代谢途径关键酶IDO1和KAT II的活性;⑤ HC和SCZ小鼠的肠道菌群组成和功能有差异,可能影响Trp代谢和神经递质水平。
2019-08-07
华大生命科学研究院研究员
张涛,博士,2011年加入华大基因,重点推动复杂疾病的健康应用。关注心脑血管,肿瘤等方向研究。目前已累计发表SCI论文26篇,以第一作者以及通讯作者发表Nature Genetics 2篇,Cell Discovery 2篇,Annals of the Rheumatic Diseases 1篇等。多次受邀为Nature Genetics,Microbiome等杂志审稿
2019年1月~2021年12月:哥本哈根大学,生物学博士
2011年7月~至今:华大生命科学研究院
复杂疾病研究,包含免疫性疾病,心脑血管,肿瘤等
深圳人体共生微生物实验室主任