张家超
海南大学食品科学与工程学院教授
张家超,海南大学食品科学与工程学院,博士,教授,博导,海南大学高层次引进人才,海南省拔尖人才,入选首届“南海名家”育才计划。主要研究方向为肠道微生物与人类健康和基于肠道微生物组模型的食品营养及功能评价,擅长多组学及生物信息学技术。主持及参与国家级课题5项和省重点研发计划2项。在《ISME J》、《Gut Microbes》、《mSystems》和《Mol Nur Food Res》等高水平国际期刊以第一作者或通讯作者发表SCI研究论文多篇,ESI高被引研究论文1篇,出版专著1部,授权发明专利7项。
iMeta:张家超团队建立基于肠道菌群单核苷酸变异基因标记物的IBD预测模型
肠道菌群是炎症性肠病(IBD)发生发展的重要环境因素。海南大学张家超团队近期在iMeta发表研究,在IBD患者的肠道菌群中发现了基于单核苷酸变异(Single nucleotide variants, SNV)的特异性基因特征,建立了一种新的准确预测IBD的诊断方法。
08-18
张家超团队:大肠癌的肠道噬菌体标志物
在结直肠癌(CRC)的微生物组标志物研究中,噬菌体相关研究还相对较少。海南大学的张家超团队近期在Microbiology spectrum发表文章,报道了5个潜在的CRC噬菌体标志物,可较好的区分CRC与对照人群,为基于微生物组的CRC诊断和噬菌体疗法带来了新启示。
01-12
张家超+翟齐啸+黄适:益生菌摄入引起原住肠道菌群普适性改变
海南大学张家超、江南大学翟齐啸和加州大学圣迭戈分校黄适与团队的研究成果。益生菌对原住肠道菌群的影响是益生菌的安全性和有效性的重要评估。本文基于11个开源宏基因组数据库,深入分析了益生菌对SNVs的影响。本文从一定程度上展现了益生菌和本土菌群的共进化,值得相关人士关注。
2021-11-04
张家超+陈开宁:益生菌+甲硫咪唑可改善Graves病患者的甲状腺功能
Graves病是一种自身免疫疾病,通常导致甲状腺机能亢进。海南大学的张家超团队与海南省人民医院的陈开宁团队在Communications Biology上发表的一项最新干预研究结果,发现特定益生菌(长双歧杆菌)+甲硫咪唑治疗,可改善Graves病患者的甲状腺功能。机制上,益生菌可能调节肠道菌群及代谢产物,从而通过肠-脑轴及肠-甲状腺轴,影响神经递质及血液微量元素。
2021-09-21
张和平+陈永福:植物乳杆菌P9或可缓解农药暴露人群的炎症反应
① 按农药暴露频率将60名受试者分为健康组(13人)和高暴露组(47人,每周喷洒次数>2),高暴露组进一步分为安慰剂组(27人)和P9益生菌组(20人),干预持续30天;② 频繁接触农药会增加血液促炎因子水平及肠道中脂多糖丰度,促使慢性炎症发生;③ 摄入P9可显著降低血液IL-7和INF-γ等促炎因子水平,缓解炎症反应;④ P9通过降低肠道中病原菌和促炎菌丰度、增加抗炎代谢物尿苷和5-羟脯氨酸含量以及促进农药残留物排出抑制炎症反应。
05-25
张家超团队:大肠癌的肠道噬菌体标志物
① 纳入3个国家的317个宏基因组样本,用随机森林模型鉴定出结直肠癌(CRC)中富集的5个噬菌体标志物,包括Peptacetobacter hiranonis噬菌体、微小微单胞菌噬菌体和3个具核梭杆菌噬菌体,可区分CRC和对照(AUC=0.8616);② 并在2个国家含80个样本的队列中进行验证(AUC=0.8197);③ 在溃疡性结肠炎(UC,n=76)和克罗恩病(CD,n=88)队列中,噬菌体标志物可较好区分CRC和UC(AUC=0.7802),但对CD的区分力较低(AUC=0.4800)。
2021-12-22
张家超+翟齐啸+黄适:益生菌摄入引起原住肠道菌群普适性改变
① 纳入11个开放的宏基因组数据集,发现肠道本地菌群单核苷酸变异(SNVs)数量与测序深度强相关;② 摄入益生菌可引起本地菌群出现广泛的SNVs,且相同益生菌株在小鼠肠道中引入的SNVs远多于人类;③ 益生菌诱导的突变存在高度菌株特异性,普氏栖粪杆菌基因组上7个非同义突变会导致细菌蛋白质产物结构改变;④ 一人群队列中,普氏栖粪杆菌的SNVs一半稳定遗传半年,一半短暂出现涉及碳源利用,说明摄入益生菌后本地菌群通过产生SNVs参与碳源竞争。
2021-10-18
张家超+陈开宁:益生菌+甲硫咪唑可改善Graves病患者的甲状腺功能
① 26名GD患者随机分为3组,8名接受甲硫咪唑(MI)治疗,9名接受MI+豆豉治疗,9名接受MI+长双歧杆菌治疗,持续干预6个月;② MI显著可改善多项甲状腺功能指标,并改变肠道菌群,但未能改善TRAb,后者是最重要的指标,可指示GD的复发率;③ MI+豆豉可维持GD患者的肠道菌群稳态,对甲状腺功能指标的改善与MI相似;④ 长双歧杆菌+MI同样可显著改善多项甲状腺功能指标,并显著降低TRAb的浓度,可能通过长双歧杆菌对肠道菌群及代谢产物的调控作用。
2021-09-07
内蒙古农业大学:干酪乳杆菌Zhang在肠道内的“变化”
① 基于宏基因组和宏转录组探究干酪乳杆菌Zhang(LcZ)在体内外的基因表达差异,以及肠道共生菌群对LcZ的应答;② LcZ进入人体肠道后,其复制和转录增加,而肠内原有的干酪乳杆菌菌株不受影响;③ 进入肠道后,LcZ约39%的mRNA和45%的sRNA被抑制,而rli28c sRNA被激活,其在体外抑制了LcZ生长和乳酸产生④ LcZ的ABC转运蛋白和氨基酸代谢基因、糖和SCFA代谢基因,分别在摄入第14和28天被激活;⑤ 人肠道菌群对LcZ的应答是有限且异质的。
2021-07-01
张家超+Rob Knight:趋同进化vs.差异调节-益生菌的适应性突变
① 通过鸟枪法宏基因组+分离株全基因组测序,研究植物乳杆菌HNU082(Lp082)在人、鼠和斑马鱼肠道中的进化适应;② Lp082分布于不同生态位,以相似顺序在同样的时间点获得高度一致的单核苷酸变异SNPs,从而定植并适应不同宿主的肠道选择压力;③ 如获得与基因编码蛋白质内膜相关的SNP等,进化出耐酸性及鼠李糖利用能力;④ 宿主常驻菌群的结构、功能对益生菌引入的反应大相径庭,特别是Lp082的竞争者拟杆菌和双歧杆菌属,累积10-70倍的进化变异。
2021-06-30
张家超等:基于肠道菌群标志物诊断格雷夫斯病
① 格雷夫斯病(GD)是一种自身免疫病,临床诊断存在不便和困难;② 招募162名受试者(健康对照、GD轻症和重症),用鸟枪法宏基因测序分析肠道菌群特征;③ GD患者肠道菌群失调,病原菌和产有害代谢物的条件致病菌增多,菌群多样性、有益共生菌和有机酸生成减少,一些菌种的SNP改变;④ 用随机森林方法建立含32个菌群标志物(涵盖菌种、MAG、基因和SNP)的分类模型,可准确区分3组受试者,并在多队列验证中区分GD与其他疾病(包括帕金森病)。
2021-06-02
海南大学食品科学与工程学院教授
张家超,海南大学食品科学与工程学院,博士,教授,博导,海南大学高层次引进人才,海南省拔尖人才,入选首届“南海名家”育才计划。主要研究方向为肠道微生物与人类健康和基于肠道微生物组模型的食品营养及功能评价,擅长多组学及生物信息学技术。主持及参与国家级课题5项和省重点研发计划2项。在《ISME J》、《Gut Microbes》、《mSystems》和《Mol Nur Food Res》等高水平国际期刊以第一作者或通讯作者发表SCI研究论文多篇,ESI高被引研究论文1篇,出版专著1部,授权发明专利7项。
2008年9月~2014年7月:乳品生物技术与工程教育部重点实验室,博士
2015年5月~至今:海南大学,食品科学与工程学院,教授
2019年6月~2020年3月:UCSD-Rob Knight实验室,访问学者
益生菌与肠道微生物共进化  
基于肠道微生物组的食品营养与功能评价