黄适
香港大学牙学院长聘教轨助理教授  
黄适,近年来作为(共同)第一或通讯作者在Nature Methods,Cell Host Microbe,Microbiome,Genome Biology,ISMEJ,mSystems,Gut Microbes,mBio等国际知名学术期刊发表论文12篇,共计论文超30篇。申请发明专利7项,其中授权国际专利2项、国内专利2项。主持和参加包括国家青年自然基金等多项基金项目。
黄适+徐健+王师:2bRAD-M实现对低生物量或降解菌群进行种水平测序
① 2bRAD-M是一种高度简化且低成本的策略,仅对约 1% 的宏基因组进行测序,可产生物种水平的细菌、古菌和真菌图谱;② 对于DNA总量只有1pg,宿主DNA污染程度高或降解样本中DNA出现严重碎片化等难以测序的样品,2bRAD-M可准确生成物种水平分类图谱;③ 2bRAD-M 在各种粪便、皮肤、环境和临床中福尔马林固定石蜡包埋的样本上测试,可以成功重建全面、高分辨率的微生物图谱。
01-26
徐健+黄适:菌群和多组学分析揭示何为“牙龈亚健康”
① 纳入40名成人,测定牙菌斑菌群和代谢组及唾液细胞因子在从健康到牙龈炎期间的变化;② 这些测量指标在停止刷牙后1-3天就已迅速改变,标志着牙龈进入亚健康(SoH)阶段,其特征包括11种唾液细胞因子活化、牙菌斑中有潜在保护作用的甜菜碱和罗氏菌快速协同减少;③ 对不同队列的荟萃分析显示,在SoH阶段牙菌斑菌群的组成和功能特征已与牙周炎高度接近;④ 持续的SoH发展能加速牙菌斑菌群衰老,28天内的衰老程度相当于牙龈健康时1年的衰老。
2021-03-09
张和平、魏泓等:生命早期环境暴露影响肠道菌群发育
① 无菌小鼠分别暴露于草原、森林和沙漠土壤环境中60天后,再部分转移到另外两种环境,收集粪便样本;② 来自不同环境类型的土壤菌群可成功地在小鼠肠道内定殖,不同土壤小鼠的肠道菌群组成和功能显著不同;③ 早期定殖的肠道菌群在环境转移中会显著影响肠道菌群的发展,形成”优先效应“,导致在环境变化后,出生地相关的分类群及功能特征仍持续存在;④ “优先效应”部分解释了早期土壤暴露对生命后期肠道菌群可塑性的影响。
2020-12-31
苏晓泉、徐健等:基于微生物组大数据的疾病检测方法
① 肠道菌群进行疾病诊断手段受到微生物实验的准确性、重现性,及微生物组高通量数据等多方面的影响;② 本研究利用前期的微生物搜索引擎开发了基于菌群大数据搜索的疾病检测新策略;③ 第一步通过计算待测样本相对于数据库中所有微生物数据得到离群微生物组新颖性评分,确定样本健康与否;④ 第一步中检测到的不健康样本与数据库中多种疾病的参照样本比对,进行疾病分类;⑤ 该方法使用便捷、快速、适用范围广,能够降低漏诊和误诊率。
2020-03-17
中科院徐健团队:基于皮肤菌群的特应性皮炎诊断及疗效评估
① 纳入来自北京、青岛及美国的116名特应性皮炎(AD)患儿及73名健康儿童,分析对比皮肤菌群的差异;② 基于25个皮肤细菌属,能够以86.4%的准确率诊断出AD患儿(AUC=0.90);③ AD患儿的非病变皮肤处的菌群组成与病变皮肤处相似,且与健康儿童的皮肤菌群不同,以金黄色葡萄球菌的富集为特征;④ 利用基于菌群的皮肤健康指数(MiSH),可将症状相同的AD患儿分为2组,2组之间的菌群多样性及治疗效果不同。
2019-08-20
青岛能源所徐健+苏晓泉等:微生物组的“三大指数”
① 开发微生物组搜索引擎,可实现菌群的快速比对和搜索;② 用户只需提供菌群的OTU表,即可在数据库收录的>10万的菌群研究数据中展开搜索,结果可在1秒内返回,给出菌群的“新奇指数”(MNS)、“关注指数”(MAS),和基于二者的“影响力指数”(MFI);③ 通过 MFI 可对菌群样本/项目新颖性和学界关注度进行追踪和比较,并对未来趋势作出预测;④ 海洋、室内环境、母婴互作等菌群研究领域,或将成为未来研究火热的“睡美人”领域。
2018-11-13
益生菌可减轻奶牛中肠道菌群引发的乳腺炎
① 给无菌小鼠移植乳腺炎奶牛的粪便菌群,可引起小鼠乳腺炎症状,以及血清、脾脏和结肠中的炎症,而移植健康奶牛的粪菌无此作用;② 补充干酪乳杆菌,可减轻移植患病奶牛粪菌的小鼠的乳腺炎症状;③ 益生菌未显著改变受体中失调的肠道菌群,但改变了菌群功能,与健康和乳腺炎菌群的均有区别;④ 虽然奶牛与小鼠的乳腺炎症状一致,但二者肠道菌群中乳腺炎相关细菌或功能标志物的共性较少;⑤ 健康与患病奶牛的肠道菌群差异,在受体小鼠中被放大。
2018-11-08
香港大学牙学院长聘教轨助理教授  
黄适,近年来作为(共同)第一或通讯作者在Nature Methods,Cell Host Microbe,Microbiome,Genome Biology,ISMEJ,mSystems,Gut Microbes,mBio等国际知名学术期刊发表论文12篇,共计论文超30篇。申请发明专利7项,其中授权国际专利2项、国内专利2项。主持和参加包括国家青年自然基金等多项基金项目。
2012年~2016年:中国科学院大学/中国科学院青岛生物能源与生物过程技术研究所,单细胞中心,生物化学与分子生物学,博士
2008年~2011年:上海师范大学,生命与环境科学系 水生生物学,硕士
2009年~2011年:中国科学院青岛生物能源与生物过程技术研究所,联培硕士
2022年~至今:香港大学牙学院,长聘教轨助理教授
2018年~2021年:加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心,博士后学者
2017年~2018年:加州大学圣地亚哥分校儿科和计算机工程学院,博士后学者
2016年~2018年:中国科学院青岛生物能源与生物过程技术研究所,单细胞中心,博士后学者
研究方向聚焦在:(1) 基于微生物组的医学诊断工具,(2) 开发简化宏基因组学工具解决低生物量样品微生物组分析挑战,(3) 机器学习在微生物组meta-analysis中的应用,(4) 肠道益生菌适应性进化原理及应用机制
2020年,青岛市科学技术进步奖二等奖