丁涛
中山大学中山医学院教授,博士生导师
中山大学“百人计划”引进人才,入选国家高层次人才
丁涛+田国宝等:肺部的菌群和健康,与口腔菌群有何关系?
Advanced Science最新发表了来自中山大学丁涛、田国宝团队的研究成果,对肺癌患者和健康人的唾液、口咽、鼻腔和支气管肺泡灌洗样本进行了菌群分析,发现口腔和鼻腔微生物的输入共同塑造了肺部菌群,且口腔菌向肺部的传播程度存在个体差异,较多的口腔菌进入肺部与肺功能下降和促炎症细胞因子增高相关。这些发现阐述了肺部菌群的外部塑造过程,并表明口腔样本(如唾液)或能用于肺部菌群状态的监测和临床评估。
08-31
丁涛+吴忠道:肠道菌群可调控血吸虫病传播媒介光滑双脐螺的碳氮代谢
Microbiology Spectrum近期发表了来自中山大学丁涛、吴忠道与团队的研究成果,利用宏基因组组装和分箱技术,发现淡水螺体内的肠道菌群不仅含有丰富的参与淀粉、半纤维素和几丁质等多糖降解的酶基因,还能保护宿主免受水生环境硝酸盐的毒害。
03-24
丁涛+刘曦+夏瑾瑜:宏基因组分析揭示细菌学检测阳/阴性结核患者肺微生物组特征
Frontiers in cellular and infection microbiology近期发表了来自中山大学丁涛、刘曦、夏瑾瑜与团队的研究,将传统的培养方法与mNGS相结合,改进了细菌学验证方法,识别出与细菌学验证结果相关的独特微生物特征,为这些微生物在结核病进展中的作用提供了初步的讨论,并为理解结核病的各种表型提供了新的视角。
2021-11-27
中山大学中山医学院丁涛课题组博士后及专职研究员招聘
中山大学中山医学院丁涛课题组博士后及专职研究员,欢迎大家踊跃报名。
2020-04-15
丁涛+田国宝等:肺部的菌群和健康,与口腔菌群有何关系?
① 纳入67名肺癌患者、32名健康人,研究唾液、口咽、鼻腔的菌群对肺菌群的塑造作用;② 口腔和鼻腔菌群是肺菌群的重要来源,但对肺菌群的贡献度有较大个体差异,可划分2种肺菌群类型(肺型):HOIT(高口腔输入型,富集口腔菌)和LOIT(低口腔输入型,富集鼻腔菌);③ 肺型与群落组装和功能、微生物互作模式及临床参数存在关联,HOIT肺菌群有更高的抗生素抗性和毒力基因、较低的微生物网络稳健性、较差的肺功能、较高的促炎细胞因子水平;④ 肺型的部分特点可通过口腔菌群指示,体现了人体共生菌群的协同变化特征。
08-28
丁涛+吴忠道:肠道菌群可调控血吸虫病传播媒介光滑双脐螺的碳氮代谢
① 纳入不同食物、不同年龄采集的28份光滑双脐螺肠道样品,利用分箱技术获得84个MAGs,代表9个门和38个科,其中65个和14个MAGs注释到属和种;② 与陆生动物肠道优势门类(厚壁菌门和拟杆菌门)不同,光滑双脐螺以拟杆菌门和变形菌门为主;③ 光滑双脐螺肠道细菌中含多种参与淀粉、半纤维素和几丁质等多糖降解基因,还具有完整的反硝化通路,可将水体氨氮毒素转化为无毒害物质;④ 食物和年龄对光滑双脐螺的肠道菌群结构和碳氮代谢有显著影响。
03-07
兰平、何真等:锁定肠系膜脂肪中的促肠炎细菌
① 纳入48名克罗恩病(CD)患者和16名非CD患者(对照),对肠系膜脂肪组织(mAT)进行多组学分析;② CD患者的mAT菌群与对照不同,且与mAT的宿主转录组和代谢组的变化相关,mAT中存在变形菌门细菌与CD进展相关;③ 在结肠炎模型小鼠中,共定植从CD mAT中分离出的5个菌株能加剧疾病,其中,A. pulmonis(Ap)可显著促炎,在加剧结肠炎中起主要作用;④ Ap可损伤小鼠肠道黏液层、移位至mAT,在CD患者的mAT和黏膜层中Ap水平也显著升高。
2021-11-23
丁涛+刘曦+夏瑾瑜:宏基因组分析揭示细菌学检测阳/阴性结核患者肺微生物组特征
① 收集123例肺结核患者支气管肺泡灌洗液标本,进行宏基因组测序,研究肺部微生物的特征;② 82%的肺结核患者呈细菌学检测阳性;③ 结核分枝杆菌、金黄色葡萄球菌、Kluyveromyces lactis、Pyricularia pennisetigen在细菌学检测阳性组(BC)被富集,副流感嗜血杆菌在细菌学检测阴性组(BN)被富集;④ BN和BC组肺结核患者的微生物相互作用存在差异,如BC组微生物间相互作用降低;⑤ 结核分枝杆菌丰度与白蛋白水平、胸腔等临床特征相关。
2021-09-13
流感病毒感染期间患者上呼吸道的抗生素耐药性及宿主-菌群互作
① 纳入37名流感病毒感染患者(25名感染H3N2、6名感染H1N1、6名感染乙型流感病毒),收集鼻拭子、咽拭子及血液样本;② 根据呼吸道菌群的基因表达谱可将患者分为2组,并鉴定出2组患者菌群组成、功能通路及抗生素耐药基因的差异;③ 部分细菌属与特定抗生素耐药基因的表达相关,例如链球菌属及莫拉克斯氏菌属与β-内酰胺耐药基因呈正相关,葡萄球菌属与四环素耐药基因呈负相关;④ 宿主对于流感病毒感染的应答与呼吸道菌群组成及基因表达相关。
2020-03-17
丁涛:流感病毒感染及疫苗接种状态影响鼻咽菌群组成
① 收集215名感染了甲型流感病毒(H3N2)或乙型流感病毒的受试者的鼻咽样本,分析鼻咽菌群组成;② 感染流感病毒的类型与鼻咽菌群的组成显著相关;③ 是否接种过流感病毒疫苗也与鼻咽菌群组成相关,并受到感染流感病毒类型的影响;④ 在未接种过疫苗的老年感染者中,鼻咽菌群中7个分类群的丰度显著升高,其中狡诈菌属及葡萄球菌属与肺炎相关;⑤ 在健康人及感染者中共鉴定出4中不同的鼻咽菌群群落类型,健康人的群落类型集中分布于其中一种。
2019-07-02
感染结核病对模式动物(猕猴)呼吸道菌群的影响
① 分析了26只猕猴的支气管冲洗物,研究结核菌感染引起的呼吸道菌群变化;② 菌群多样性在感染初期(1个月)增加,感染后期(5个月后)恢复正常;③ 在感染第4个月(结核病已确立)有3个核心菌群丰度发生显著变化,分别是SR1、伴放线放线杆菌(上升),以及毛螺菌科(下降);④ 不过,菌群丰度和结构与肺部炎症或肺叶受累无关;⑤ 共现网络分析发现结核菌感染改变了菌群的相互作用关系,促成了放线菌在感染后样本中的9个新连接(2正7负)。
2018-10-09
中山大学中山医学院教授,博士生导师
中山大学“百人计划”引进人才,入选国家高层次人才
2006,中国科学技术大学生命科学学院,学士学位
2012,俄克拉荷马州立大学,生物化学与分子生物学博士学位
2012.12-2014.3,密歇根大学,博士后研究工作
2014.4-2018,纽约大学,博士后研究工作
微生物组在传染性或慢性疾病(特别是呼吸道疾病)中的动态和功能机制
呼吸道微生物组与肠道微生物组(肠道菌群)之间的协同机制,以及针对宿主免疫的协同应答
基于微生态学和微生物组学大数据的生物信息学和建模等