华中科技大学陈卫华、佛山大学刘庆友与团队，基于8种反刍动物10个胃肠道位点的2333个样本，构建出统一反刍动物噬菌体目录，用于表征不同反刍动物和胃肠道位点中噬菌体基因组的分布。

复旦大学赵兴明团队与华中科技大学陈卫华和刘智团队，通过富集病毒样颗粒（VLP）和短读、长读测序相结合，成功组装出中国肠道噬菌体目录（CHGV），其中约35%的vOTUs为完整基因组，揭示了肠道噬菌体的巨大多样性和功能能力。

Cell Host and Microbe最新发表了来自华中科技大学张必翔、杨祥良、刘智、陈孝平、陈卫华与团队的重要研究，结合队列分析、小鼠实验和临床试验等手段，发现长双歧杆菌对促进肝癌术后肝功能恢复、提高生存率具有积极作用，并探索了背后的肠-肝轴机制。这项研究为肝癌术后治疗提供了新策略，强调了调节肠道菌群的重要作用。

华中科技大学的陈卫华和复旦大学的赵兴明合作在Gut发表文章，发现质子泵抑制剂（PPI）比组胺-2受体拮抗剂（H2RA）对肠道微生物组和口-肠传播的影响更大，从而揭示了与长期使用PPI相关的某些疾病风险更高的机制。

佛山科学技术学院刘庆友、华中科技大学卫华与团队近期在Microbiome发表研究，对来自不同胃肠道部位、不同年龄、不同饲养方式和不同地理位置的268只山羊的497个样本进行了全面的微生物生态结构调查。

复旦大学类脑智能科学与技术研究院赵兴明教授、人类表型组研究院郑琰研究员，以及华中科技大学的陈卫华教授在Microbiome上发表了题为Enterotypes of the human gut mycobiome的研究论文。此研究揭示了肠道真菌组成高度结构化的性质，并发现其与宿主表型之间的紧密相关性。

DNA甲基化在噬菌体的生存中起着至关重要的作用，但对其基因组甲基化的理解仍然有限。近日，华中科技大学陈卫华和刘智、复旦大学赵兴明、欧洲分子生物学实验室Peer Bork及团队在Advanced Science发表最新研究，使用单分子实时测序分析了来自104个粪便样本的近9000个宏基因组组装的高质量噬菌体的DNA甲基化模式，发现肠道噬菌体普遍存在甲基化，进一步分析揭示广泛的DNA甲基化与其编码的甲基转移酶有关，值得关注。

近日，复旦大学赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Gut Microbes发表最新研究，系统地评估了基于肠道菌群的机器学习分类器对20种疾病的跨队列分类性能，发现可以使用肠道菌群作为独立的、跨队列的诊断工具，但仅用于少数肠道疾病。

近日，复旦大学类脑智能科学与技术研究院Luis Pedro Coelho、赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Genome Biology发表最新研究，开发了一种基于机器学习，用于全自动识别和纠正宏基因组数据中装配错误的工具metaMIC（https://github.com/ZhaoXM-Lab/metaMIC），通过模拟和真实数据集验证，发现metaMIC的性能良好可为下游分箱提供可靠基础，值得测试。

郑州大学第一附属医院张明智、李兆明及华中科技大学陈卫华团队近日在Gut发表最新文章，建立了用于NK/T细胞淋巴瘤诊断和预后的肠道菌群标志物模型，支持肠道菌群成为NK/T细胞淋巴瘤的有效无创辅助诊断工具。

广西大学刘庆友、华中科技大学陈卫华和华中农业大学滑国华及团队在Nature Communications上发表文章，在国际上首次提供了完整的水牛肠道微生物基因组目录。该成果为水牛肠道菌群相关研究以及分析肠道菌群对水牛粗纤维消化率、产奶性状、生长速度等经济性状的影响提供了重要的数据基础和挖掘蓝图。

GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库，其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性，并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2，在这个新版本中，作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。

华中科技大学陈卫华、刘智和复旦大学赵兴明作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，报道了mBodyMap——一个针对人体菌群及其与健康和疾病关联的精选数据库。