复杂群落的外来细菌定植结局取决于复杂的种间相互作用，其中很多暂未被揭示，中国科学院深圳先进技术研究院戴磊、哈佛大学医学院刘洋彧与团队发表研究，基于数据驱动预测外来细菌的定植结局。

中科院先进院马迎飞、戴磊与团队在Cell Host and Microbe发表重要研究，首次建立了大规模肠道主要共生细菌噬菌体培养组技术，利用噬菌体培养物解析了肠道细菌和噬菌体长期共存的机制，并展示了这些噬菌体在肠道菌群调控中的应用潜力。本研究针对肠道主要共生细菌构建噬菌体资源库，展示了这些噬菌体培养物在肠道菌群调控中的价值。利用这一资源拟开展的肠道噬菌体和细菌的互作研究，有助于深入了解肠道菌群的多样性、功能和作用，为预防和治疗相关疾病提供新的思路和方法。

近日，中国科学院深圳先进技术研究院戴磊及团队在Nature Communications发表最新研究，开发了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交技术，用于解析复杂微生物群落的空间结构。该方法可识别复杂群落中的不同微生物物种，在单细胞尺度上原位解析微生物物种间以及微生物-宿主间的互作。总之，该技术是研究微生物群落生态和功能的重要工具，值得关注。

近日，中国科学院深圳先进技术研究院合成微生物组学研究中心戴磊团队在ISME Journal上发表最新研究，通过广义Lotka-Volterra（gLV）模型为框架，解析膳食纤维干预下肠道菌群应答的生态学机制，发现某些细菌在菊粉作用下显著增加，其基线丰度和种间竞争解释了微生物群落密度和组成动态的基线依赖性，并揭示了微生物生态网络对于理解与预测肠道菌群应答的重要性。总之，该研究为未来系统理解肠道菌群的生态学规律以及开发相应的精准营养调控手段奠定了重要基础。

中国科学院深圳先进技术研究院的戴磊团队在iScience上发表文章，发现自体和异体粪菌移植均可恢复老年小鼠的肠道菌群，并影响宿主基因表达谱。而且，与自体FMT相比，异体FMT建立的肠道菌群在DSS诱导的结肠炎症期间弹性较差，恢复力较弱。研究结果强调需要监测移植肠道菌群的长期稳定性，并在必要时进行多重FMT。

什么是微生物组工程？回顾基因组工程技术的发展，对下一代微生物组技术有哪些启示？