肠道菌

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文章数：9篇

Nature Reviews：肠道菌群在宿主中如何进化？（综述）

Nature Reviews Microbiology发表的综述文章，回顾了自然选择如何影响肠道菌在宿主（重点是小鼠和人类）内进化的最新研究成果，发现健康宿主的微生物群并非一成不变，相反，每个肠道定殖物种的基因组都可能是高度动态的，而这种动态性似乎与微生物群的物种多样性有关。通过遗传学和生物信息学工具以及对时间序列数据的分析，可以量化肠道生态系统中新出现的突变和水平转移事件的选择强度。未来需要了解宿主内部微生物群进化的规则，以更有效地开发微生物群疗法，帮助维持或恢复宿主健康。

进化肠道菌

肠道化学稳态

Nature子刊：肠道稳态维持不仅仅依赖酶促反应，还有普通化学反应

H2S是肠道中一种重要的还原性物质，主要来源有肠道菌群对含硫蛋白代谢产生、硫酸盐细菌产生，以及由宿主肠道上皮代谢产生。在机体内，H2S对结肠细胞具有毒性，但是另一方面H2S可以促进肠道黏液层的完整性，具有神经保护的作用，因此对于其对肠道的，特别是肠道化学环境的影响具有重要的作用。近期一篇发表在Nature Metabolism上的研究工作，发现H2S在肠道中可以介导非生物性的氧化还原反应，促进偶氮类物质偶氮键的断裂，从而消除偶氮类物质对机体的有害作用。这一研究揭示了肠道化学环境中的非生物性化学变化，提示这类化学变化对肠道化学环境的塑造具有重要的影响。

肠道化学稳态还原偶氮物质非生物化学反应研究论文基础研究

刘平生团队：肠道细菌中的脂滴

肠道菌群对于人类健康的重要性越来越被认可，甚至已经有人提出肠道菌群是人类的外延器官的概念。肠道菌群在多方面参与调控肠道物质能量稳态，其中一个重要的方面是肠道菌群调控宿主的脂质代谢过程。然而目前对于该方面的研究主要集中在宿主肠道细胞的脂质代谢的细胞学研究中，而对于肠道菌中的脂质代谢相关的研究较少。近期中国科学院物理所刘平生课题组在Protein & Cell上发表了其最新的研究工作，通过电镜和共聚焦的方法他们探究了肠道菌中脂滴的形态和大小，同时通过蛋白质组学鉴定了肠道菌脂滴的蛋白组分。这些研究成果对肠道菌群的研究开辟了一个新的角度和思路。

脂滴肠道菌脂滴的分离透射电镜研究论文

Nature 子刊：人肠道菌碳水化合物硫酸酯酶如何识别硫酸化聚糖？

硫酸化糖是与真核生物宿主共同进化的微生物群体无处不在的营养来源。细菌通过部署碳水化合物硫酸酯酶来代谢硫酸化糖，以去除硫酸酯。尽管硫酸酶具有重要的生物学意义，但人们对其识别糖类底物的能力的机制仍然知之甚少。Nature Chemical Biology发表的研究，确定了7个拟杆菌属S1碳水化合物硫酸酯酶的结构。总的来说，这项研究增加了我们对碳水化合物硫酸酯酶进化和功能的理解。

硫酸酯酶硫酸化聚糖肠道菌拟杆菌结构生物学

肠道菌Parasutterella在肥胖和糖尿病中扮演什么角色？

最近研究表明，除了Akkermansia，Parasutterella sp.在2型糖尿病和肥胖症的发展中很重要。Gut Microbes,发表的文章，纳入1544名受试者，进行肠道菌群分析，探讨Parasutterella的特征，同时也在一个独立的队列（n = 438）中进行了主要验证。结果发现，Parasutterella与人类肥胖症和2型糖尿病有关，并可能涉及到一个新的饮食碳水化合物-微生物群-宿主代谢轴。其中对L-半胱氨酸的代谢可能与2型糖尿病的发展有关，而与脂肪酸生物合成途径的联系则与肥胖症发展中富含碳水化合物饮食的体重增加有关。

Parasutterella 肥胖 2型糖尿病脂肪合成代谢轴半胱氨酸

高通量测序

高通量测序如何用于定位可诱导噬菌体的基因组位置？又如何量化噬菌体活性？

温和的噬菌体影响细菌种群的密度、多样性和功能。最近研究表明，它们也是肠道微生物群的直接调节剂，并间接影响宿主的健康和疾病。Microbiome发表的文章，提出了一种使用高通量测序数据定位可诱导的前噬菌体并量化其活性的方法。最后，研究还强调，对预测的噬菌体进行实验验证仍然是细菌基因组注释的一个重要任务，因为单靠生物信息学工具的预测可能不够准确。

高通量测序肠道噬菌体前噬菌体溶源化前噬菌体诱导噬菌体活性

国内团队：天然淀粉或可缓解小鼠结肠炎症

近期Molecular Nutrition and Food Research发表了来自山东省农业科学院农业食品科学技术研究所刘丽娜和刘玮副研究员团队研究成果，该研究利用葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠结肠炎动物模型，评价了食用5种不同的天然马铃薯淀粉(PS)、豌豆淀粉(PEAS)、玉米淀粉(CS)、山药淀粉(CYS)、红高粱淀粉(RSS)对肠道微生物组成和结肠炎症的潜在影响。结果表明，马铃薯、豌豆和山药淀粉对小鼠模型结肠炎症状有一定的缓解作用，并表现出明显的益生元特征。这些发现或为IBD的治疗提供了一种经济的饮食策略。

天然淀粉炎症性肠病(IBD) 肠道菌益生元小鼠结肠炎模型

饱和脂肪与心血管疾病的关系需重新审视

饱和脂肪在健康和疾病中的作用仍然存在争议。半个多世纪以来，人们一直认为，饮食中的饱和脂肪会增加血液中的胆固醇，从而促进心脏病的发生。然而，American Journal of Clinical Nutrition发表的研究中，对所谓的“饮食-心脏假说”提出了挑战。新的膳食脂质的顺粘适应(HADL)模型，解释了脂蛋白胆固醇的变化是一种自适应的稳态调节，有助于维持细胞膜的流动性，从而优化细胞功能。与该模型相对应，研究还进一步提出了低密度脂蛋白胆固醇浓度升高与动脉粥样硬化之间的其他相关因素，如饮食-肠道微生物组相互作用导致的内毒素负荷增加，以及慢性低度炎症。

心血管饱和脂肪低密度脂蛋白动脉粥样硬化胆固醇

靶向清除细菌

Cell子刊：靶向清除特定肠道菌的新方法

目前治疗肠道感染以及肠道菌群研究中，通常使用抗生素来达到目的，然而抗生素杀菌不具有特异性，因此易导致不确定结果。建立特异性清除细菌的技术对于临床应用和科学研究有重要的意义。近期一篇发表在Cell Host and Microbe的一篇论文通过应用纳米抗体-抗原特异性结合的技术和具有T6S细胞毒性的阴沟肠杆菌构建了可编程抑制细胞（PIC），PIC可以靶向清除表达特定表面抗原的细菌，而不影响肠道菌群整体的其它组成，效果显著优于抗生素，且PIC不易导致细菌耐药性的产生。该技术具有广泛的应用前景和临床应用价值。

靶向清除细菌 interbacterial community Microbiome Probiotic