噬菌体衍生序列

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朱怀球团队：DeePhage——区分宏病毒组中的毒性和温和噬菌体衍生序列的工具

北大朱怀球团队在本研究中提出了一种新的计算方法 DeePhage，它可以直接快速地将每个读长或重叠群判断为有毒或温和的噬菌体衍生片段，特别是用于宏基因组学分析，通过直接检测来自宏基因组和宏病毒组的温和病毒片段，该研究进一步提出了一种新策略来探索菌群中的噬菌体转化。检测这种转变的能力为人们提供了对人类疾病潜在治疗方法的新见解。DeePhage 可通过 http://cqb.pku.edu.cn/ZhuLab/DeePhage 或https://github.com/shufangwu/DeePhage 免费获得。

DeePhage 深度学习方法宏病毒组噬菌体衍生序列卷积神经网络