研究论文

炎症性肠病（IBD）患者经常出现焦虑和抑郁等精神病共病，对患者的生理和心理健康造成极大影响。肠道菌群紊乱相关的脑肠轴失调可能是造成（IBD）及其精神病共病的原因之一，而雌激素受体β已被发现与IBD、小鼠焦虑行为相关。近日，陆军军医大学范晓棠、休斯顿大学Jan‑Ake Gustafsson、苏州大学徐兴顺及其团队在Microbiome发表研究文章，发现雌激素受体β敲除导致的肠道菌群失调引发下丘脑-垂体-肾上腺过度活动，与IBD和焦虑样行为的发展相关，为IBD的精神病共病潜在的治疗途径。

焦虑样行为炎症性肠病（IBD）雌激素受体 HPA axis 研究论文

预后标志物

可预测急性严重溃疡性结肠炎患者的类固醇应答的预后指数

预后标志物溃疡性结肠炎研究论文类固醇队列研究

个性化饮食干预

JAMA子刊：个体化饮食干预的减重效果并不比标准化低脂饮食更好

JAMA Network Open近期发表的文章，招募患有糖尿病的肥胖成年人，对比标准化的低脂饮食和降低餐后血糖反应（PPGR）的个体化饮食干预在降低体重方面的作用。结果显示，与低脂饮食相比，降低PPGR的个体化饮食在6个月的干预期内并不能更有效的降低体重。

个性化饮食干预低脂饮食减肥减重研究论文随机对照试验

自组装siRNA

南京大学Nature子刊：体内自组装siRNA或可用于联合治疗结肠炎？

溃疡性结肠炎是一个多因素、多步骤的过程，仅阻断单一炎症细胞因子或免疫靶点可能不足以治愈这种疾病。基于小干扰RNA（siRNA）疗法为溃疡性结肠炎的联合治疗提供了一种有吸引力的策略，然而，开发合适的siRNA体内给药系统仍是相关治疗的主要瓶颈。近日，南京大学张辰宇、陈熹、张骑鹏及团队在Nature Communications发表最新研究，利用合成生物学设计理念，向小鼠静脉注射可表达TNF-α siRNA、B7-1 siRNA和整合素α4 siRNA的合成生物学基因环路，将小鼠的肝脏重构成可产生和分泌siRNA的器官，利用机体自身的外泌体分泌和传输途径，实现siRNA在体内稳定的生产和传输。总之，本研究为溃疡性结肠炎建立了一种可行的联合治疗策略，值得关注。

自组装siRNA 溃疡性结肠炎研究论文基础研究 RNA干扰

宏基因组数据分析

Nature子刊：使用Kraken套件进行宏基因组数据分析

测序数据的生信分析对于准确和完整表征微生物群落至关重要。为促进宏基因组分析的高效性和可重复性，近日发表在Nature Protocols的研究，作者开发了Kraken suite（含Bowtie2、Kraken2、Bracken、Pavian等软件）用于宏基因组数据分类、量化和可视化的流程。该流程可很好应用于对给定的宏基因组数据中物种的定量分析，也可对人类患者临床样本进行致病菌检出分析，特别适合熟悉Unix命令行环境的相关人员，值得尝试。

宏基因组数据分析软件研究论文基础研究生物信息学流程

结肠镜检查

在FIT阳性人群中，内镜医师应提高结肠镜检查的腺瘤检出率

对于通过结肠镜检查进行结直肠癌筛查的内镜医师，腺瘤检出率（ADR）与结肠镜检查后的结直肠癌（PCCRC）相关。Annals of Internal Medicine上发表的一项最新研究结果，在粪便免疫化学检测（FIT）呈阳性的患者中，内镜医师的ADR与PCCRC风险呈负相关。

结肠镜检查结直肠癌结直肠癌筛查研究论文队列研究

五指毛桃

华南理工大学：五指毛桃或可改善肠道菌群结构及其代谢谱？

五指毛桃（又称南芪、佛掌榕、粗叶榕、五指牛奶等），主要分布于我国广东、云南、福建、广西等地，具有舒筋活络、健脾补肺、利湿行气、增强机体抗病能力的功效。目前，关于五指毛桃饮食（FHVD）如何影响人类肠道菌群仍未知。近日，华南理工大学林影及团队在npj Science of Food发表最新研究，发现补充FHVD显著增加了受试者肠道菌群多样性，促进了机体内氨基酸、短链脂肪酸等含量显著增加。总之，该研究为探究中草药与机体肠道菌群互作奠定了基础。

五指毛桃传统中药研究论文基础研究肠道菌群

氧化三甲胺（TMAO）

TMAO及CMPF与晚期慢性肾病的临床结局相关

American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项前瞻性队列研究结果，对700多名晚期肾病患者进行3年左右的随访后发现，基线血清氧化三甲胺（TMAO）水平与全因死亡率呈正相关，而基线血清3-羧基-4-甲基-5丙基-2呋喃丙酸盐（CMPF）水平与全因死亡率及肾脏替代治疗风险呈负相关。

氧化三甲胺（TMAO）研究论文前瞻性队列研究 CMPF 慢性肾病

新冠病毒

JAMA：无证据表明新冠病毒感染会增加自身免疫性疾病

本研究利用儿童数据，分析了既往新冠病毒感染史与未来自身免疫系统疾病风险的关联，目前并无证据支持这一假说。

新冠病毒研究论文胰岛素自身免疫性疾病 1型糖尿病

减肥

体重正常的人减肥会变胖，还增加糖尿病风险？

肥胖是糖尿病、心血管病等众多疾病的危险因素。减肥是降低相关疾病发病风险的有效手段，长远来看，究竟哪种减肥方式最不容易反弹，且对健康最有利。此外，正常体重人群减肥是否有害？近日，哈佛大学公共卫生学院研究人员在Plos Medicine发表最新研究，基于美国约10万人长达24年的随访数据，探究不同减肥方式（低卡饮食、运动、低卡饮食+运动、节食、商业减肥、减肥药、及后三者混合）与体重变化、2型糖尿病（T2D）发病风险间的关联。发现肥胖人群不管采用何种方式减肥，只要减重4.5+公斤，就有利于长期预防T2D，运动减肥的健康收益最为显著。但是体重正常的人群决定大幅减重时应慎重，以免增加患T2D的风险。

减肥糖尿病研究论文基础研究减肥方式

共聚焦荧光成像

杨朝勇+王炜等：共聚焦成像联手单细胞测序，如何解析复杂的微生物样品？

单细胞测序技术已被用于肠道菌群等复杂微生物样本的研究，但目前，仍很难将细菌的基因组信息与显微成像观察到的细菌表型信息有机结合，深入揭示其生物学机制。近日，上海交通大学杨朝勇、王炜及团队在mLife发表最新研究，开发了一种FLCiSS策略。该策略基于共聚焦荧光成像和单细菌挑选测序方法，通过共聚焦特异荧光信息可对复杂样本中的细菌直接挑选和测序，获取其分类学信息。总之，该策略的开发普适性较好，有利于促进各类复杂细菌样本的深入挖掘，值得关注。

共聚焦荧光成像单细胞测序研究论文基础研究氨基酸探针

组合饮食

组合饮食或降低2型糖尿病风险

组合饮食（Portfolio Diet）是一种植物性饮食，可降低LDL胆固醇及其它心血管疾病风险因素。Diabetes Care上发表的一项前瞻性队列研究结果，对近15万名绝经后女性进行平均16年的随访，对组合饮食、DASH饮食或地中海饮食的依从性越高，2型糖尿病风险越低。

组合饮食研究论文前瞻性队列研究 2型糖尿病

慢性压力

某种程度的压力或对结肠炎有益？

通常情况，压力与更严重的炎症有关，已有研究报道心理压力会使炎症性肠病的症状恶化，但真的是这样吗？近日，凯斯西储大研究人员在PNAS发表最新研究，通过施加持续压力对结肠炎小鼠模型，发现结肠中第三淋巴器官（TLO）形成显著增加，但压力没显著增加肠道炎症。进一步探究发现IL-22和IL-23两种细胞因子是TLO形成途径的一部分，慢性压力对结肠炎的继发性损伤有保护作用，表明TLOs可能具有改善粘膜屏障的功能，免疫系统可能从压力的衡量中受益，值得关注。

慢性压力结肠炎研究论文基础研究炎症性肠病

肝硬化

肠道菌群宏基因组特征可预测肝硬化疾病进展

非酒精性脂肪性肝病（NALFD）进展到终末阶段常表现为失代偿期肝硬化，与肝癌和较高的死亡率有关。肠-肝轴与NALFD、肝硬化发病相关。肠道菌群是肝病分期、预后及干预的非侵入性生物标志物的潜在来源。近期，Alimentary Pharmacology and Therapeutics发表研究文章，鉴定出粪便中13种细菌的宏基因组特征可用于NALFD相关肝硬化的失代偿期诊断，具有较高的准确性，并可预测NALFD相关肝硬化的死亡风险。

肝硬化失代偿期肝硬化粪便菌群宏基因组研究论文

结直肠癌

国内团队Nature子刊：去泛素化酶USP14或可成为大肠癌治疗新靶点

色氨酸2,3-双加氧酶1（IDO1）催化色氨酸代谢为犬尿氨酸。IDO1在多种肿瘤中表达上调，造成肿瘤微环境中的色氨酸耗竭和犬尿氨酸积累，抑制效应T细胞增殖，诱导调节性T细胞分化和活化，导致免疫抑制。IDO1是肿瘤免疫治疗的重要靶点，但其抑制剂临床效果不佳，原因之一是对芳香烃受体的非靶向激活。近日，中山大学廖雯婷、宋立兵，香港中文大学(深圳)刘国珍及其团队在Nature Communications发表研究文章，报道了去泛素化酶USP14调控IDO1蛋白水平的机制，证明抑制USP14可有效逆转IDO1介导的免疫抑制和提高免疫治疗效果，并避免了IDO1抑制剂对芳香烃受体的非靶向激活。总之，该研究为IDO1高表达结直肠癌提供了潜在的药物靶点。

结直肠癌 USP14 IDO1 研究论文基础研究

儿童肿瘤

国内团队Lacent发文：我国儿童青少年肿瘤的权威数据

来自国家儿童肿瘤监测中心、首都医科大学等合作团队分析报道了我国2018-2020年期间儿童青少年肿瘤发生的流行病学现况，并对肿瘤发病率与地区经济卫生之间的关联进行了探索。本研究对于儿童肿瘤研究提供了重要的基础数据，同时呼吁社会对儿童青少年肿瘤问题的重视。

儿童肿瘤研究论文中国人青少年儿童

智能胶囊

智能胶囊或可用于靶向采集结肠菌群？

目前，粪便样本常用于评估肠道菌群与饮食间的相互作用，但这种方式仍存在无法全面提供肠道菌群空间变化信息的弊端。近日，美国普渡大学研究人员在Acta Biomaterialia发表最新研究，开发一种无电子智能胶囊，可对结肠区域内菌群进行定点采样。该设备可快速膨胀收集肠腔中液体及其菌群，并在采样后会自动关闭，通过多项测试发现其稳定性、耐受性以及精确性良好。总之，该设备的开发为消化病学研究和临床应用提供了新途径。

智能胶囊微生物群采样研究论文基础研究结肠菌群采样

菌群-免疫互作

Science子刊：慢性疲劳综合征患者的鞭毛蛋白抗体应答异常

肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征（ME/CFS）是一种衰竭性疾病，病因及发病机制并不明确。Science Advances上发表的一项最新研究结果，发现相比于健康对照，ME/CFS患者的针对菌群鞭毛蛋白的血清抗体应答过度表达。

菌群-免疫互作研究论文队列研究鞭毛蛋白抗菌群抗原抗体

褪黑素

西北农林：褪黑素通过肠道菌群缓解衰老引发的肝脏脂代谢异常

由研究表明，衰老个体的肠道菌群对肠道内次级胆汁酸成分的影响可能与导致肝脏脂质代谢异常的原因之一。褪黑素被认为具有抗衰老作用，那么它是否能够通过塑造肠道菌群结构来改善衰老引起的脂代谢异常呢？近日，西北农林科技大学孙超团队在Cellular and Molecular Life Sciences发表研究文章，报道了口服褪黑素通过降低空肠弯曲杆菌丰度调节肠道胆汁酸谱并改善衰老引起的肝脏脂肪积累的现象及其分子机制。

褪黑素肝脂代谢胆汁酸肠道菌群研究论文

肠道神经元

Cell子刊：神经信号如何调控肠上皮细胞表面糖基化及肠道菌群稳态？

肠道中存在大量的感觉神经元和运动神经元，负责大脑与肠道间的双向交流。先前研究发现，肠道菌群及其代谢产物可以通过不同通路调控大脑神经元活性，但神经元是否以及如何调控肠道菌群行为及稳态仍不清楚。近日，路易维尔大学研究人员在Cell Host & Microbe发表最新研究，发现VIP神经元通过分泌VIP信号肽调控肠上皮细胞表面的岩藻糖化修饰，从而调控肠道菌群在肠道内的定殖及稳态。总之，该研究为神经信号如何调控肠上皮细胞表面糖基化及肠道菌群稳态提供了新观点。

肠道神经元菌群稳态研究论文基础研究肠道上皮细胞

儿童瘦体重

BMJ：儿童瘦体重预测模型效果得到多国数据验证

儿童瘦体重研究论文风险预测模型外部验证

粪菌移植

Lancet子刊：粪菌移植可安全有效地用于首次或第二次艰难梭菌感染治疗

粪菌移植（FMT）可有效改善多次复发的艰难梭菌感染，但其是否能用在疾病的早期阶段，即作为首次或第二次艰难梭菌感染的一线治疗方法，目前仍缺少临床证据。Lancet Gastroenterology & Hepatology近期发表了一项随机对照试验的研究结果，招募42名经万古霉素治疗的首次或第二次艰难梭菌感染患者，相对于安慰剂，FMT可以持续缓解患者的艰难梭茵相关性腹泻症状，且安全性较好。值得注意的是，由于FMT组相较于对照组疗效太好，出于伦理考虑而提前终止了试验，后续对照组患者也都接受了FMT治疗。

粪菌移植研究论文艰难梭菌感染随机双盲对照试验

纳米晶体纤维素

国内团队：纳米晶纤维素或可治疗便秘？

便秘会严重影响生活质量，增加结直肠癌的风险，且相关药物会造成不可逆转的肠损伤、影响营养素吸收等副作用。近日，南方科技大学蒋兴宇、中国地质大学胡应模、国家纳米中心查瑞涛、中国农科院基因组所杜然及团队在ACS Nano发表最新研究，通过纳米晶体纤维素（一种刚性棒状纳米颗粒）评估对便秘小鼠的治疗效果，发现NCC能有效治疗便秘，其有益作用与调节肠道菌群、促进脂肪酸代谢、胆汁酸合成和氨基酸代谢有关。此外，相比药物/膳食纤维，NCC不会造成肠神经损伤，治疗效果更好。总之，该研究为未来干预便秘提供了新指导，值得关注。

纳米晶体纤维素便秘研究论文基础研究纳米医学

肠干细胞

国内团队：氟马西尼或可让肠道干细胞免受放化疗的毒副作用？

化疗和放疗会损害肠道干细胞的DNA导致其死亡，引起肠道损伤和多种痛苦的胃肠道症状（腹泻和呕吐等），严重降低患者的生活质量。近日，山东大学临床医学院陈大卫、山东大学齐鲁医学院李景新及团队在Journal of Experimental Medicine发表最新研究，发现接受放疗或化疗药物治疗的小鼠肠道干细胞中，GABRA1（GABAA受体组成部分之一）蛋白水平增加。通过抑制GABAA受体可以保护小鼠免受化疗或放疗的毒副作用，延长了存活时间。氟马西尼是一种廉价的GABAA受体抑制剂，发现对动物肠道和人类结肠类器官均有较好的保护作用。总之，该研究为未来探究氟马西尼在临床上降低放化疗癌症患者的副作用提供了新思路，值得关注。

肠干细胞化疗副作用研究论文基础研究 GABAA受体

小肠隐窝

Science子刊：小肠杯状细胞黏蛋白分泌的特殊方式

肠道粘液屏障是肠道上皮抵御肠道中细菌入侵的最重要的物理屏障。这层物理屏障由肠道上皮中特化的细胞——杯状细胞分泌肠粘液蛋白MUC而形成。目前对于杯状细胞粘液蛋白分泌的方式的研究主要集中在气管中黏液蛋白的分泌和结肠中黏液蛋白的分泌。研究显示，气管中黏蛋白的分泌是一种持续的胞吐过程，而结肠中黏蛋白的分泌则采取的是复合胞吐。但是小肠的功能和微生态环境有其独特性，不同于大肠，小肠肠上皮细胞更多的执行营养物质的摄取，因此更容易受到细菌的侵袭。因此小肠中黏蛋白的分泌采取何种方式以应对小肠特殊的微生态环境尚不明确。近期一篇发表在Science子刊Science Signaling上的研究着重关注了小肠中不同位置杯状细胞黏蛋白分泌的方式，发现小肠隐窝中黏蛋白的分泌是由其临近细胞离子运输来决定，而且是不同于已经报道的方式进行分泌，研究人员将这种新的分泌方式命名为“扩张分泌”，该分泌方式在保证小肠隐窝无菌环境中发挥着重要作用。

小肠隐窝杯状细胞黏蛋白分泌肠细胞离子运输毒蕈碱通路M3受体

坚果

摄入坚果或可降低高危老年人的心血管疾病风险

Cardiovascular Diabetology上发表的一项，在196名心血管疾病（CVD）高危老年人中，更高的坚果摄入量与NMR脂蛋白谱向致动脉粥样硬化风险降低模式变化、胰岛素抵抗降低、循环支链氨基酸减少相关。

坚果脂蛋白心血管疾病动脉粥样硬化横断面研究

SP140

Cell子刊：SP140突变影响肠道菌群，增加IBD风险

炎症性肠病（IBD）是一类严重影响人类健康的慢性疾病，其发病原因与患者遗传背景、环境因素以及肠道菌群均有密切的关系。此前，针对IBD和另外一种多因素复杂疾病，多发性硬化（MS）的全基因组连锁分析发现，有多个基因座位突变与这两种疾病均有关联关系，提示两种疾病病理机制相近。SP140属于一种染色体阅读器家族蛋白成员之一，参与机体免疫，特别是巨噬细胞的功能的调节。尽管目前对SP140调节巨噬细胞的功能有了一定的了解，但是对于其在机体应对肠道菌群变化的免疫反应中的作用，以及该蛋白突变在IBD和MS中发生的机制尚不明确。近期一篇发表在Cell子刊，Cell Host and Microbe上的一篇论文报道了对SP140研究的最新成果，他们发现sp140缺失导致小鼠巨噬细胞针对杀死细菌相关基因的表达缺陷，但却促进了CD8+细胞在肠黏膜固有层的激活，加重了结肠炎症。进一步发现SP140缺失加重肠炎的表型是依赖于肠道菌群的。这一研究成果进一步揭示了sp140突变导致肠炎的病理机制，为临床治疗IBD和MS提供了重要的科学依据和潜在靶点。

SP140 巨噬细胞变形菌门炎症性肠病（IBD）肠道菌群

饮食模式

不同饮食模式与2型糖尿病风险的关联

Diabetes Care上发表的一项前瞻性队列研究结果，对8750名成年受试者进行多年随访，对比了不同饮食模式与2型糖尿病风险之间的关联，发现南方饮食模式与2型糖尿病之间呈最强的正相关。

饮食模式研究论文 2型糖尿病前瞻性队列研究

高果糖

Cell子刊：果糖过度喂养降低棕色脂肪组织的葡萄糖代谢

果糖是一种存在于加工食品中的食品添加剂，其消费量在过去几十年中急剧上升。多项研究已揭示高果糖饮食会导致高甘油三酯血症和高胰岛素血症等疾病，提示果糖消耗和代谢障碍之间具有关联性。Cell Reports Medicine发表最新研究发现，在人类果糖过度摄入期间，棕色脂肪组织葡萄糖代谢功能的降低比其他病理生理异常更早发生。

高果糖 BAT 研究论文基础研究葡萄糖代谢

SeqCode

Nature子刊：SeqCode—基于序列数据描述的原核生物命名规则

目前，仍然存在多数的原核生物不能通过纯培养获得，无法通过国际原核生物命名法 (ICNP) 的规则和建议命名，严重阻碍了微生物学科间的交流。近日，美国内华达大学研究人员在Nature Microbiology发表最新研究，他们开发了SeqCode，通过SeqCode Registry运行（https://seqco.de/），可以根据原核生物基因组序列进行命名的规则和新网站。SeqCode可对分离株的基因组、宏基因组组装基因组或单扩增基因组序列对原核生物命名，在名称组成和优先规则方面与ICNP相似。虽然SeqCode可满足更广泛的研究团体的利益，但作者也强调该命名法目的不是要阻碍培养、并且没有提供关于分类群划分的规则或建议。未来，仍需要进一步优化该命名法，以期改善整个微生物科学的交流。

SeqCode 微生物命名研究论文基础研究原核生物