Géraldine Pascal

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Géraldine Pascal

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FROGS：分析真菌多样性的强大工具

检测真菌最常用的标志物是 ITS，但有一个主要缺陷：PCR可能会在大量真菌中产生非重叠的读长。当这些读长被过滤掉时，传统的宏条形码流程会丢失部分信息，从而产生关于所研究环境的组成和结构的有偏差的图片。本研究开发了一种解决方案-FROGS工具，可以处理包括重叠和非重叠在内的整个读长集，从而提供更准确的真菌群落表征。作者使用模拟数据和真实数据进行对比测试证明了其解决方案的有效性，大家可通过命令行或基于 Galaxy 的 Web 界面使用该解决方案。

真菌 ITS 宏条形码工作流程扩增子