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Simon R Carding
文章数:3篇
衰老
年轻菌群可逆转老年小鼠的肠、眼、脑的衰老
衰老相关的肠道菌群组成改变,与炎症、组织功能下降和老年病风险升高相关。Microbiome近期发表的一项研究,通过在年轻和老年小鼠之间进行粪菌移植,发现衰老的肠道菌群驱动了炎症,引起了大脑和眼睛功能的有害变化。这些发现表明,调节肠道菌群或能用于治疗老年时的炎症相关组织功能衰退。
衰老
肠道菌群
粪菌移植
肠-脑轴
视网膜
病理机制
Nature子刊:通过iSNP揭示UC病理机制
UC是一类涉及遗传因素、环境因素等的多因素复杂性疾病,其病理机制仍不清楚。近年来人们通过全基因组关联分析发现很多与疾病相关的基因单核苷酸多态性位点(SNP),其中大约10%的SNP位于基因编码区,而大部分SNP则位于非编码区,对于这些非编码区的SNP影响疾病发生的机制大部分均不清楚。近期一篇发表在Nature子刊,Nature Communications上的研究工作,通过基于非编码SNP的两种潜在调控基因表达的机制:miRNA位点和转录因子结合位点为研究对象,构建了综合单核苷酸多态性网络平台(iSNP),对UC信号通路发生变化通路网络进行系统分析,从而可以将UC患者分为不同的驱动簇,确定了钙离子稳态、伤口愈合和细胞运动是UC发病的关键过程。
病理机制
非编码SNP
iSNP平台
综合信号通路分析
UC关键信号通路
胞外囊泡
多形拟杆菌产生的胞外囊泡如何影响宿主免疫?
紊乱的微生物群可导致与胃肠道有关的疾病,包括炎症性肠病(IBD),因此确定宿主与微生物的相互作用对于更好地了解肠道健康至关重要。肠道细菌的胞外囊泡(BEVs)被释放到肠道腔内,可以穿过粘液层,进入底层免疫细胞。Journal of Extracellular Vesicles发表的文章,为了探讨BEVs与宿主的相互作用,研究了由肠道共生细菌多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)产生的BEVs对宿主免疫细胞的影响。研究利用单细胞RNAseq数据集与多形拟杆菌BEV蛋白质组相结合,开发了一个BEVs对免疫细胞在不同发展阶段、健康和溃疡性结肠炎状态下的影响的计算工作流程,并进一步通过BEV-单核细胞共培养实验,证实了BEVs可通过TLR4与人类单核细胞相互作用。本研究结果或有助于了解BEVs在IBD中的潜在治疗价值。
胞外囊泡
宿主免疫
多形拟杆菌
单细胞RNA-seq
炎症性肠病