Guojun Wu

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赵立平+张晨虹+朱召芹：通过肠道菌群预测新冠严重程度和预后

上海交通大学的赵立平、张晨虹和上海市公共卫生临床中心的朱召芹与团队在mBio发表文章，对新冠患者入院时的粪便样本进行宏基因组学分析，鉴定出两个功能差异的细菌群，其在病情严重程度不同的患者中分布不同，同时根据这两个功能群的丰度差异可对患者的病情严重程度进行分群。这种分类方法适用的广谱性在不同国家的数据、以及四个独立数据集中得到验证。因此，这种分类方法可能有助于早期识别住院的新冠肺炎患者，这些患者在入院时有更严重结局的高风险。

新冠肺炎粪便菌群

上皮内淋巴细胞

肠道菌群调控γδ上皮内淋巴细胞

表达γδ T细胞受体的上皮内淋巴细胞（γδ IELs）是抵抗肠腔内微生物的第一道防线。Mucosal Immunology上发表的一项研究结果发现，一组特定的肠道共生菌可调控γδ IELs的增殖和行为，为增强肠上皮屏障防御带来新启示。

上皮内淋巴细胞菌群-免疫互作研究论文基础研究急性感染

赵立平团队：“功能群”分析或是人类肠道菌群研究的突破口

肠道菌群研究为探索疾病机理打开了一扇新的大门，但目前这一领域的研究存在着难以找到真正的“致病”微生物等难题。罗格斯大学、上海交通大学的赵立平团队在Genome Medicine发表观点文章，讨论了目前常用的菌群分析方法中存在的缺陷，提出了更具有生态学意义的基于“功能群”的研究策略，并列举了两个实例，说明了如何将这种研究思路应用于宏基因组和16S测序的数据分析，值得专业人士关注。

肠道菌群功能群