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Toshiki G Nakashige
文章数:3篇
细菌凝集素
Nature 子刊:人类微生物组中细菌凝集素的功能和多样性
凝集素是一种非酶类的碳水化合物结合蛋白,所有生物体都将其作为建立生态位、躲避宿主防御和抵御病原体的一部分,但细菌凝集素在人类微生物组中的作用在很大程度上还没有被探索。Nature Communications近期发表的研究,通过对宏基因组衍生的Cbeg5凝集素的研究,发现该凝集素与血液和肠道中的骨髓细胞存在相互作用。并且还发现,人类微生物群含有大量未知和多样化的凝集素编码基因,提示Cbeg5凝集素可能是由凝集素介导的更广阔的宿主-微生物相互作用网络的一部分,人类微生物群编码的凝集素或代表了一个生物学上相关的、功能多样的、但在很大程度上未被研究的效应器家族。
细菌凝集素
肠道微生物组
凝集素Cbeg5
菌群-宿主互作
Cell子刊:多重功能宏基因组学分析,挖掘菌群影响宿主的效应物
肠道菌群产生的效应分子(如蛋白质和小分子),是其与宿主相互作用的一个主要方式。Cell Reports近期发表的一项研究,建立了一个由14个婴儿粪便菌群构建的宏基因组文库,并对其进行大规模筛选以寻找可能影响宿主细胞免疫、自噬和氧化还原电位的效应物。这一研究方法和相关发现,扩展了人们对调节宿主途径的菌群效应物的认知,有助于深入研究共生微生物影响宿主的分子机制。
菌群-宿主互作
效应物
婴儿肠道微生物组
宏基因组学
宿主-菌群互作
功能基因组筛选鉴定出可激活NF-κB信号通路的细菌菌株
来自mBio上发表的一项最新研究,通过将不同人体细菌菌株的基因组导入大肠杆菌中进行功能基因组筛选,鉴定出了来自6种不同的人体细菌菌株中的多种效应基因编码的蛋白可激活NF-κB信号通路。该研究提供了一种深入理解宿主-菌群互作机制的方法。
宿主-菌群互作
NF-κB
functional screening
human microbiome
NF-κB信号通路