纵向菌群数据

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纵向菌群数据

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肝硬化患者肠道微生物组成或可辅助预测首次失代偿

肝硬化从代偿期发展到失代偿期意味着病情的恶化，患者死亡风险明显增加。代偿期肝硬化治疗中需积极预防失代偿的发生。肠道微生物群的失调与肝硬化及失代偿的发生相关，但目前缺乏对肝硬化病情进展不同阶段的肠道微生物群（尤其古菌、病毒）纵向研究。近日Gut发表研究文章，对157例不同阶段的肝硬化患者的肠道微生物群进行了纵向分析，发现与病情稳定或后续失代偿患者相比，首次失代偿患者的肠道微生物群发生显著变化，肝硬化患者古菌-病毒-细菌的网络特征及特定物种的丰度或可用于首次失代偿事件的预测，并可能成为预防肝硬化进展的潜在靶点。

肝硬化肠道微生物组代偿期失代偿期研究论文

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phyLoSTM：一种基于纵向菌群数据进行疾病预测的新型深度学习模型

人类菌群在纵向时间尺度上是高度动态的，会随着饮食或医疗干预而动态变化。在研究中，作者提出了一种新的深度学习框架“phyLoSTM”，结合使用卷积神经网络和长短期记忆网络 (LSTM) 进行特征提取和分析纵向微生物组测序数据中的时间依赖性以及宿主的环境因素，用于疾病预测，并提出了通过 LSTM 处理受试者中的可变时间点方面以及在不平衡情况和对照之间的权重平衡方面的其他新颖性。

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