Xin Tong

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文章数：4篇

张涛+贾慧珏：Nature子刊揭示肠道菌群与血液代谢物间的因果关系

肠道微生物组与人体的生理状态和疾病密切相关，但这些关联是否具有因果关系仍存争议。Nature Genetics最新发表了深圳华大生命科学研究院张涛和贾慧珏作为共同通讯作者的研究，收集分析了3432名中国人的全基因组、粪便宏基因组、人体测量学和血液代谢物数据，通过M-GWAS以及双向孟德尔随机化分析，鉴定出肠道微生物组（如特定微生物分类单元及菌群功能）与血液代谢物水平之间的潜在因果关系，为进一步揭示菌群与表型和疾病关系以及潜在干预方法，提供了新的证据和假说。

肠道菌群孟德尔随机化血液代谢物微生物组全基因组关联分析

宿主基因组多态性

刘小敏+张涛+贾慧珏：基因决定口腔微生物组组成

人类口腔内有超过十亿的口腔微生物组，这些微生物不仅仅在口腔中发挥重要的作用。而且可以通过吞咽的方式进入消化道的其他位置，例如肠道，从而影响肠道微生物组，对人体的健康产生重要的影响。多个宏基因组研究均提示，口腔微生物组与风湿性关节炎、结肠癌、2型糖尿病等疾病有一定的关系。肠道微生物组的研究发现，人类遗传因素与肠道微生物组组成具有相关性。但是，高度动态变化的口腔微生物组是否也与宿主遗传因素具有一定的相关性呢？这一问题目前尚没有证据证明。近期深圳华大生命科学研究院刘小敏、张涛和贾慧珏作为共同通讯作者，在Cell Discovery上发表的最新工作，首次通过大样品基因组测序探索了宿主基因组对口腔微生物的影响，发现了5个影响口腔微生物组的显著性位点，并应用人工智能学习的方法探索了基因组和微生物对牙周疾病的预测性能，取得了较好的结果。

宿主基因组多态性宏基因组关联分析 miRNA 机器学习口腔菌群

口腔微生物组

揭著业+贾慧珏：人类口腔微生物基因组目录

华大基因的揭著业、贾慧珏与团队近期在Genomics, Proteomics & Bioinformatics上发表文章，阐述并提供了一个人类的口腔菌群基因组参考，高度代表未用于基因组装，可以促进细菌培养、功能筛选、疾病诊断和基于口腔微生物群的调节的宏基因组样本。值得专业人士仔细阅读。

口腔微生物组宏基因组组装基因组(MAGs) 研究论文

遗传-菌群互作

张涛+贾慧珏+侯勇：深度剖析中国人的遗传-菌群关联

人体遗传因素在一定程度上能影响肠道菌群的组成和功能，但相关研究尚未充分开展。Cell Discovery近期发表了深圳华大生命科学研究院张涛、贾慧珏、侯勇与研究团队的成果，纳入近1300名中国人，首次通过深度的全基因组和宏基因组测序，分析了宿主遗传（常见变异、罕见变异和拷贝数变异）与肠道菌群之间的关联，并首次揭示了这些关联中的性别差异。这些发现对于研究宿主遗传因素对肠道菌群的影响及其在健康与疾病中的作用，有重要参考意义。

遗传-菌群互作微生物组全基因组关联分析性别差异