微生物组-代谢组

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微生物组-代谢组

文章数：4篇

癌症免疫疗法

微生物代谢组或可作为癌症免疫治疗效果的预测指标（观点）

近年来，癌症的免疫疗法取得了突飞猛进的发展。目前位于免疫疗法尖端的“免疫检查点阻断剂”对于很多癌症，尤其是恶性且化学药物耐受性癌症的治疗中有着明显的效果。其中，效果最显著的是“cytotoxic-T-lymphocyte-associated protein 4 （CTLA-4）”以及“programmed cell death 1 （PD-1）”两类免疫检查点阻断剂。尽管免疫检查点阻断癌症疗法已成为许多癌症类型护理治疗的标准，但缺乏强有力的预测性生物标志物。发表在Journal for ImmunoTherapy of Cancer上的一项观点文章认为，微生物代谢组或可作为癌症免疫疗法的预测性生物标志物及调控靶点，从而更好地对该疗法进行效果评价以及进行有效治疗。

癌症免疫疗法微生物组-代谢组免疫检查点阻断代谢产物与疾病生物标志物

微生物-宿主互作

浙大团队：杀虫剂不管用？可能是虫子的肠道细菌解毒了

在农业中大量用于害虫控制的有机磷酸盐杀虫剂已经在世界范围内引起了越来越多的环境问题和公共健康问题。与此同时，主要鳞翅目害虫也快速发展出了对杀虫剂的抗性，其部分原因在于它们的共生微生物。来自浙江大学的邵勇奇团队在Environment International上发表的一项研究中，以家蚕（鳞翅目:蚕蛾科）为模式生物，研究了微生物群促进鳞翅目昆虫产生抗药性的可能机制，表明特定的肠道细菌通过改变宿主代谢、增加关键营养供应显著提高了宿主的适应性，从而使幼虫能够更有效地规避这些有毒化学物质的有害影响。这种新的抗药性机制为研究复杂环境系统中宿主和肠道细菌之间的相互作用提供了有用的模板。

微生物-宿主互作 Insecticide resistance gut bacteria Silkworm

微生物组-代谢组

浙大团队：瘤胃菌群及代谢产物对奶牛生产性状的影响

浙江大学刘建新团队和加拿大Alberta大学Leluo Guan团队先前对超过300头奶牛的性状进行了分析，发现在同样的营养和管理条件下，部分奶牛的乳蛋白含量（MPY）有较大差异。该团队在《Microbiome》上发表的一项研究通过比较高MPY和低MPY奶牛的瘤胃宏基因组、代谢组和血清代谢组，揭示了这种差异形成的原因，发现瘤胃菌群代谢产物和血清代谢产物对MPY的贡献较大，分别为29.76%和26.78%，其次为菌群功能（21.56%）和菌群组成（17.81%）。该研究将有助于对促进高质量牛奶生产的肠道菌群依赖性和宿主代谢产物依赖性机制的理解，提示人们或可通过饮食管理或遗传选择来改变奶牛瘤胃菌群以提高牛奶质量。

微生物组-代谢组 Dairy cattle Milk protein yield Rumen metagenome Rumen metabolome

微生物组-代谢组

亟待优化的微生物组-代谢组关联分析

用相关性分析手段评估微生物对代谢物变化量的影响常会得到假阳性结果，因为1）其对“影响”二字无严格定义，2）缺乏自然条件下微生物-代谢物互作的真实数据。本文通过建立数学模型和使用化学恒化器建立简化的体外微生物-代谢物模型证明了传统的相关性分析预测准确度低，但也随不同菌株、代谢物和环境波动的不同而变化，而原理验证结果可帮助改善准确度。尽管如此微生物组-代谢组数据仍包含了大量信息，建议未来的方向包括1）使用多菌株代谢模型来复制实验，2）多变量分析解构菌株与环境间关系，3）使用概率方法融入未知原理。

微生物组-代谢组关联性分析 Correlation evaluation metabolic modeling