宏基因组学流程

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宏基因组学流程

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人类宿主过滤

南方科技大学团队开发快速检测病原细菌及耐药基因的宏基因组流程

本文报道了一个对临床研究样本中的病原细菌及其携带耐药基因进行快速检测的宏基因组学工作流程，该流程整合了基于GPU运算的Nanopore适应性采样“人类宿主DNA过滤”测序模式和自主研发的实时物种鉴定/抗性基因预测的分析工具RUARGpore（https://github.com/sustc-xylab/RUARGpore.git），实现了上机4.5小时内病原及所携带耐药基因的精准检测。同时，该方法相比现有宏基因组学检测方法有效的降低了成本，有潜力应用于大规模临床推广。

人类宿主过滤宏基因组学流程病原体检测抗生素抗性基因 (ARGs) 纳米孔适应性采样