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MAG
文章数:2篇
HiFi测序
使用HiFi测序有助于识别MAG中的罕见突变
HiFi reads是基于Sequel II平台推出的CCS测序模式产生的兼具长读长和高准确度的测序序列,有利于生成更完整的MAG,也促进了识别潜在的突变位置。近日,美国加州大学圣地亚哥分校在Genome Research发表最新研究,开发了strainFlye流程,通过相关数据集测试证明可以较好地鉴定和分析HiFi reads组装的MAG中的罕见突变,值得相关人员测试。
HiFi测序
罕见突变
研究论文
基础研究
生信分析工具
鸡肠道菌群
鸡肠道微生物再添新成员
鸡是大部分人非常重要的蛋白质来源,鸡盲肠微生物群通过短链脂肪酸的产生、氮的再循环和氨基酸的产生在鸡的营养中起着关键作用。通过控制鸡的盲肠微生物群可能提高鸡的生产能力,因此我们需要对鸡肉中存在的细菌类型及其营养功能有一个很好的了解。《Genome Biology》上发表的一项研究对鸡盲肠菌群进行宏基因组测序,组装了许多新的基因组,并明确了品系、饮食方式和性别对鸡肠道菌群丰度及体重的影响。该研究丰富了鸡盲肠微生物群的组成,为鸡肠道菌群的功能研究奠定了基础。
鸡肠道菌群
microbiota
chicken
metagenome
microbial ecology