Adam J Berlinberg

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粘膜细胞刷采样菌群是否更准确？

这是发表在Microbiology spectrum上的一份工作，作者通过粘膜细胞刷和结肠镜活检两种采样方式对5名志愿者进行了肠内微生物采样，并应用宏转录组和代谢组进行比较评估。有趣的是，粘膜细胞刷样品表现出更多的细菌读长数，且不可用读长和宿主读长显著降低，同时菌群分类均匀度以及多样性都有上升趋势，其中α多样性呈总体上升趋势，β多样性显著上升。但在分类概况和功能上，两种样品间差异很小。另外，代谢组学揭示了结肠镜活检样本与粘膜细胞刷样本的不同，似乎表明所谓微生物产生的代谢物和宿主吸收的代谢物之间的区别。因此，针对菌群分类学和功能的研究可使用微创的粘膜细胞帅采样，但涉及代谢物水平研究，应谨慎选择。

采样方法肠道菌群