Jakob Zimmermann

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Science：新方法！记录细菌基因表达，揭示肠道中发生了啥

肠道内的细菌通过不断调整其基因表达，来适应与饮食和疾病有关的肠内环境。Science发表的一项最新研究，报道了一种新工具Record-seq系统。基于这种方法构建的工程菌，其瞬时表达的mRNA在逆转录酶Cas1-Cas2复合物的作用下，会被整合到质粒编码的CRISPR阵列中，从而"记录"细菌在小鼠肠道内的基因表达历史，并能阐明细菌对肠道环境扰动（如饮食、炎症和其他肠菌）的反应。该方法可用于对肠道进行无创测量，在菌群基础研究和诊断应用方面具有潜力。

新方法工程菌细菌基因表达宿主-菌群互作细菌间互作

菌群的进化

Cell子刊：6年追踪小鼠菌群的演化与适应

肠道免疫大佬Andrew Macpherson团队在Cell Host & Microbe上发表的文章，研究在SPF条件下，已知全部定植细菌类群基因组信息的限菌小鼠中，菌群如何演化与适应。并试图回答在理想的实验环境中，肠道菌群遗传漂变的界限到底在哪里。

菌群的进化等基因限菌动物模型其他基础研究 microbiota evolution