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Wei Ni
文章数:3篇
数据库
国内团队:AnimalMetaOmics用于研究动物微生物遗传多样性和基因功能的多组学数据库
动物微生物在宿主中扮演着重要的角色,其多样性已经成为研究人员极感兴趣的焦点。随着高通量测序技术的迅猛发展,公共数据库中的动物微生物组数据迅速增加。然而,由于数据的庞大和分散性质,研究人员常常难以充分挖掘、比较和分析这些数据。近日,石河子大学胡圣伟、倪伟,华中农业大学杨庆勇,新疆农垦科学院周平及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究,构建了AnimalMetaOmics数据库,是一个整合宏基因组、宏转录组和宏蛋白质组数据的多组学资源库,为动物微生物组学研究提供了综合资源,值得关注。
数据库
动物微生物组
研究论文
基础研究
多组学
肠道菌群
国内团队:对马肠道菌群进行宏基因组组装
石河子大学的胡圣伟团队在Microbiome发表文章,收集马的肠道菌群进行宏基因组组装(MAG),共组装出4142个MAG,为马肠道微生物组提供了详尽的微生物基因组目录,为发现性能增强微生物和研究马肠道微生物提供了宝贵的资源。
肠道菌群
马
宏基因组组装基因组 (MAG)
CRAMdb
胡圣伟+倪伟+陈同等:动物微生物组组成与功能综合数据库—CRAMdb
近年来,随着高通量测序技术与生物信息学技术的快速发展,已经成为研究人员解决动物健康与疾病的诊断、治疗、预防等一系列科学难题的两把利刃。随着科学数据的爆炸式增长,急需建立以动物宏微生物组为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据。近日,中国中医科学院陈同、石河子大学胡圣伟、倪伟及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究,建立一个包含与动物相关的细菌、古细菌、真菌和病毒数据的CRAMdb综合数据库(http://www.ehbio.com/CRAMdb/;含9430种细菌、278种古细菌、2216种真菌和458种病毒等超1.2万种微生物),用于探索各种动物中微生物的组成和功能,以及与表型的关联等。总之,极大地促进了国内外动物微生物相关数据的汇总、储存以及共享,也为未来的实际转化应用奠定了基础。
CRAMdb
综合数据库
研究论文
基础研究
动物微生物组