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Frank M Aarestrup
文章数:7篇
异基因造血干细胞移植
儿童异基因造血干细胞移植治疗的菌群分析
接受异基因造血干细胞移植(HSCT)的患者表现出肠道微生物群的变化,并可能经历一系列并发症,包括急性移植物抗宿主病(aGvHD)。Microbiome近期发表文章,通过对29例HSCT治疗的儿童患者进行肠道、口腔和鼻腔菌群的动态监测,绘制了移植后三个部位的菌群变化图谱。同时发现移植前三个部位的菌群构成可用于预测移植后aGvHD的发生,且免疫稳态的重建与三个部位的菌群具有相关性。
异基因造血干细胞移植
儿童
菌群
急性移植物抗宿主病
耐药组
养殖场与屠宰场工人的粪便耐药组
Environment International上发表的一项最新研究,对比分析了养鸡场工人、养猪场工人、猪肉屠宰场工人及对照的粪便抗菌素耐药基因(ARG),发现粪便耐药组受到养殖场类型、养殖场工作时间、屠宰线工作位置等因素的影响。
耐药组
Resistome
Microbiome
Antimicrobial resistance
occupational exposure
宏基因组
Science:倡导建设一个基于生活污水宏基因组测序的抗性基因监测系统
生活污水中的DNA含有很多有用的信息,通过对生活污水取样测序,可以获取社区中抗性基因的含量和变化规律。这种方式无侵入性、灵活性强、成本低廉、可信度高,十分适合开展大范围乃至全球的流行病学调查研究,有望成为未来的大健康基础设施。
宏基因组
抗生素抗药性
生活污水
宏基因组测序
造血干细胞移植
肠道菌群及免疫特征与儿童造血干细胞移植后的临床结局相关
来自Microbiome上发表的一项最新纵向队列研究结果,对37名接受了同种异体造血干细胞移植的儿童进行1年的监测,发现肠道菌群组成、免疫标志物、免疫系统重建情况及移植后的临床结局之间存在关联,提示肠道菌群组成或可用于预测造血干细胞移植后的免疫重建情况及移植物抗宿主病等不良事件的风险。
造血干细胞移植
纵向队列研究
同种异体造血干细胞移植
免疫标志物
移植物抗宿主病
噬菌体
Nature子刊:被忽视的巨大噬菌体
噬菌体对肠道细菌结构、营养分配、细菌进化等具有重要影响。本研究在哺乳动物肠道中发现了一种巨大噬菌体,该噬菌体的基因结构较特殊,可能拥有尚未被阐释的特殊生物特征,值得参考。
噬菌体
肠道宏基因组
巨大噬菌体
肠道噬菌体
Xiaoyu Gao
抗生素耐药性
Nature子刊:欧洲九国养殖猪和鸡的抗生素耐药组特征
动物养殖中常用到抗生素,导致的抗生素耐药菌可能给人类健康带来威胁。Nature Microbiology的一项最新研究,用鸟枪法宏基因组学分析了欧洲9个国家共350多个养猪和养鸡场的耐药组情况,值得专业人士关注。
抗生素耐药性
耐药组
动物养殖
猪
鸡
眼部菌群
SR:利用宏基因组测序分析玻璃体菌群
使用传统的培养法+分离株基因组测序,以及DNA提取+宏基因组测序法,对眼内炎患者的玻璃体菌群进行分析,提示基于宏基因组的分析方法可用于患者的眼部菌群鉴定。
眼部菌群
玻璃体
宏基因组测序
Yujin Lee
Dariush Mozaffarian