菌群产物

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菌群产物

文章数：12篇

泛素同源物

高翔等Nature子刊：脆弱拟杆菌泛素同源物会驱动肠菌种内细菌竞争？

细菌间的拮抗和相关的防御策略在细菌竞争中必不可少。人类肠道共生体脆弱拟杆菌会分泌一种泛素同源物（BfUbb），对体外脆弱拟杆菌菌株的一个亚群有毒。近日，山东大学高翔及团队在Nature Microbiology发表最新研究，系统深入地解析了人肠道拟杆菌分泌的泛素同源物BfUbb独特的杀菌机制，并表明BfUbb是塑造人类肠道内菌株组成的强大驱动因子，具有重要的应用潜力，值得关注。

泛素同源物种内竞争研究论文基础研究肠道菌群

Nature子刊：菌群或可帮助筛查肛门癌

人乳头瘤病毒可引起侵袭前的高级鳞状上皮内病变 (HSIL)，作为肛门生殖器区域癌症的前兆，其中菌群是促成因素之一。感染HIV的男男性行为者患肛门癌的风险很高，但目前HSIL的筛查策略缺乏特异性。近日，发表在Nature Medicine上的这篇文章，通过研究肛门菌群以改善HSIL筛查，并发现菌群衍生的钴胺素和琥珀酰辅酶A可作为改善肛门癌筛查的生物标志物。

肛门癌生物标志物菌群产物肛门菌群癌症筛查

肠易激综合征

一种细菌产物或可作为治疗IBS的新方法

先前研究表明，大肠杆菌Nissle1917产生的一种含γ氨基丁酸（GABA）的脂肽，能对辣椒素诱导的小鼠内脏超敏具有镇痛作用。近期Gut上发表了一项研究，在小鼠模型中研究了产前应激、肠道菌群和内脏超敏之间的关系，发现一些GABA脂肽能起到阵痛作用，并显著降低产前应激小鼠的内脏敏感性；而IBS患者肠道却显著缺乏这些GABA脂肽。这些结果说明GABA脂肽可能是宿主和肠道菌群之间的沟通机制之一，或许可以开发含GABA的细菌脂肽或其产生菌作为治疗IBS的新手段，未来还需进一步的临床研究。

肠易激综合征细菌脂肽产前应激肠道菌群菌群产物

Cell 子刊：肠道菌群蛋白BefA如何促进胰岛β细胞增殖

糖尿病的特征之一是菌群失调，然而微生物产物如何影响胰岛素的产生目前尚不清楚。近日，发表在Cell Metabolism上的这篇文章，通过研究菌群来源的蛋白BefA促进产胰岛素β细胞增殖的作用机制，揭示膜透化是细菌和宿主蛋白刺激β细胞扩增的共同机制。

肠-胰腺轴肠道菌群菌群产物胰岛β细胞 BefA

Nature：用新方法系统性挖掘IBD相关的菌群蛋白

菌群中具有生物活性的微生物产物，在微生物之间以及微生物-宿主间的相互作用中发挥关键介导作用，但目前人们对于这些菌群产物的了解仍然有限。Nature最新发表了来自哈佛大学公共卫生学院的一项研究，开发了一套用于鉴定微生物组中的新型生物活性基因产物的计算系统 MetaWIBELE，并用其分析了炎症性肠病（IBD）队列宏基因组数据，鉴定出大量未被表征的有潜在生物活性的IBD相关微生物蛋白家族，对研究菌群相关的IBD疾病机理和相关疗法具有重要意义。

菌群产物菌群研究工具炎症性肠病肠道菌群宏基因组学

菌群-免疫互作

Cell子刊：特定细菌产物促进STING的活化及稳定，恶化肠炎

cGAS-STING DNA感知通路的变化可影响肠道稳态。来自Immunity上发表的一项最新研究，发现肠道髓系细胞中的STING活化可诱导小鼠的自发性结肠炎及肠道菌群失调，而特定细菌产物（环二GMP等）可进一步促进STING的K63连接泛素化及稳定，从而形成前馈环路以促进T细胞依赖性的肠道炎症及纤维化。利用抗生素去除革兰氏阴性菌可抑制STING的累积并缓解肠道炎症。另外，在IBD患者的炎症结肠部位，以及4种不同的结肠炎小鼠模型的结肠中，均可观察到STING表达的显著增加。

菌群-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠） cGAS-STING

Nature Outlook：聚焦微生物分子

Nature发表的关于肠道菌群研究的Outlook专题中，对斯坦福大学的生物工程师Michael Fischbach教授进行了采访，其内容涉及研究肠道菌产支链短链脂肪酸的方法，脂肪酸的作用及研究意义（如可通过识别微生物分子结合的受体，设计与这些受体互作的药物），并指出了未来研究的方向。

菌群产物短链脂肪酸肠道菌群 Clare M Lloyd Clare M Lloyd

Science：研究肠道菌产物对宿主影响的新利器

肠道菌群可产生大量多样化的生物活性分子，对宿主的生理活动和健康产生影响。然而由于缺乏相应的遗传操纵工具，人们一直难以深入分析特定细菌产物对宿主的影响和作用机制。比如哺乳动物肠道中常见的共生梭菌，就是一类难以进行遗传操纵的细菌。Science最新上线的一项研究报道了一种可对梭菌进行多基因敲除的方法，并通过小鼠定植实验，发现生孢梭菌产生的支链短链脂肪酸对宿主的免疫调控功能。这种方法不仅可研究梭菌等细菌产生的分子对宿主的影响，也可通过编辑特定细菌的基因组，实现对特定菌群产物的调控。

菌群产物梭菌 CRISPR-Cas9 基因编辑短链脂肪酸

宏基因组分析工具

Science：从人类微生物组的数据海洋中，揪出菌群的生物活性小分子

已有不少研究揭示了菌群在生理和疾病中的作用，但其中涉及的菌群分子和相关机制仍有很多未知。Science刚刚发表了由普林斯顿大学Mohamed S. Donia团队主导的最新研究，报道了一种新的算法MetaBGC，与合成生物学方法结合使用，可从人类宏基因组数据中鉴定具有生物活性作用的菌群小分子。该研究中以II型聚酮合酶（TII-PKS）的生物合成基因簇（BGC）为例进行分析（这是一类不常见的细菌BGC，但其已知的小分子产物中包括四环素和抗癌药阿霉素，具有临床药用价值），表明TII-PKS BGC广泛存在于人类微生物组成员中。这种微生物组分析方法，为系统性研究介导菌群-宿主以及菌群-菌群互作的生物活性分子，提供了有力手段。

宏基因组分析工具菌群产物生物合成基因簇人类微生物组 Hongchao Wang

Science：胖还是不胖？宿主免疫塑造的肠道菌群有话说

肠道菌群是代谢调控的重要因素，宿主免疫系统可通过IgA抗体等方式来塑造菌群。《Science》上发表的最新研究表明，滤泡辅助性T细胞应答缺陷可使小鼠的肠道菌群变得促肥胖，其中梭菌纲细菌的减少是关键，与脱硫弧菌属细菌过度生长和IgA抗体靶向异常有关。进一步研究显示，梭菌纲细菌可通过其分泌的物质来抑制脂质吸收相关基因的表达，而脱硫弧菌则有相反作用。这些发现阐释了宿主免疫-肠道菌群-代谢表型三者间的互作关系，揭示了抑制肥胖和促进肥胖的菌群成员及其生物学机制，表明调节脂质吸收的菌群产物或能用于治疗肥胖和代谢综合征。

肥胖小鼠肠道菌群免疫免疫-菌群互作

肠道菌群干预

Science子刊：菌群靶向疗法的现状和挑战（观点）

菌群研究进展迅速，为诸多疾病的疗法研发开辟了新的道路。为了庆祝创刊十周年，Science Translational Medicine特别刊发系列文章，其中的第一篇出自Eran Elinav团队，讨论了菌群靶向疗法（饮食干预、益生菌、菌群产物、粪菌移植、噬菌体疗法和改善肠屏障）的研究现状、未来方向和挑战，有不少值得参考的观点，特别推荐给刚接触肠道菌群领域的科研和产业人士。

肠道菌群干预饮食干预益生元个性化营养粪菌移植

非酒精性脂肪肝病

肠道菌群及其产物，如何影响非酒精性脂肪肝（综述）

EMBO Molecular Medicine近期发表了来自Eran Elinav团队的综述，详细介绍了非酒精性脂肪性肝病/炎中肠道菌群及其产物的作用。

非酒精性脂肪肝病非酒精性脂肪肝炎 microbiome/microbiota Nonalcoholic fatty liver disease NONALCOHOLIC STEATOHEPATITIS