Amnon Amir

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Amnon Amir

文章数：11篇

徐振江等：人类唾液菌群的日常动态变化

口腔菌群与口腔和全身的健康存在关联，然而吃饭和刷牙等日常活动对口腔菌群的动态影响，目前仍缺乏研究。南昌大学徐振江团队与加州大学圣迭戈分校Rob Knight团队合作在Genome Research发表论文，通过高频采样，揭示了人唾液菌群的日常动态变化，以及口腔不同部位菌群间的复杂互作。

口腔菌群唾液菌群

护肤品对皮肤化学及菌群的影响

BMC Biology上发表的一项最新研究，研究了几款不同的护肤品对皮肤化学物质及皮肤菌群（包括细菌及古菌）的影响。

皮肤菌群 16S rRNA sequencing bacteria Mass spectrometry metabolomics

宿主-菌群互作

宿主生理和饮食，哪个对菌群影响更大？

ISME Journal发表的一项研究，从演化角度，分析比较了18种灵长目动物的肠道菌群组成，表明影响菌群的主要因素是宿主本身的生理演化，而非宿主食性。该结论与此前的部分研究有所不同，作者也进行了一些探讨。对菌群-宿主互作、菌群-宿主共演化感兴趣的专业人士不妨关注。

宿主-菌群互作灵长类动物微生物组食性

炎症性肠病

南方医科大学：肠道菌群用于IBD诊断和疗效预测

南方医科大学陈烨和周宏伟团队主导的最新研究，基于肠道菌群开发诊断标志物，可用于不同人种的IBD诊断，结合肠道菌群及其它指标，可用于IBD患者对英夫利昔单抗治疗应答的预测。

炎症性肠病生物标志物英夫利昔单抗 Disease activity Gut microbiota

短多重区域框架（SMURF）

Microbiome：大幅提高16S菌群分析分辨率的新方法

这是近期发表在Microbiome[IF：8.496]的关于菌群组成分析的方法学文章，介绍的SMURF方法可获得比现有16S法更高的分辨率，且此方法简单、成本低，或可在菌群研究中推广使用，推荐专业人士阅读。

短多重区域框架（SMURF） 16S rRNA基因 16S rRNA gene High resolution Microbial profiling

SR：圈养改变菌群，唯一未被驯化的野马也不能幸免

普氏野马是唯一尚未被人类驯化的马种，是研究自然状态下野生动物和圈养动物菌群差异的良好模型，这篇文章正是关注于此，值得好好看看。

马普氏野马驯化圈养 Min Han

Microbiome：基于数据特性的标准化和微生物丰度差异分析策略

Rob Knight和团队操刀的方法学文献一篇，特别推荐给大家。

16s rRNA测序标准化归一化丰度差异检验稀释

AJE：收集粪便样本，不必太纠结取样方法

又是方法学必读文献，为什么必读，看标题。

feces microbiota specimen collection Craig Baker-Austin Craig Baker-Austin

Science：我们死后，被哪些细菌分解？

今年1月Rob Knight在Science的“恐怖”之作，结果大概是，不管你死后被埋在哪里，分解你尸体的细菌大概都是类似的。。。

尸体分解微生物群法医死亡时间刑事案件

Cell子刊：利用口腔微生物来预测龋齿

① 对50个4岁学龄前儿童菌斑和唾液中的微生物进行了2年的跟踪；② 微生物的变化早于ECC临床症状的发生，在发病期间，菌斑和唾液微生物的变化与ECC严重程度（dmfs）比与进展更相关；③ 通过区分随年龄和随疾病发展变化相关的微生物类群，并利用发病和进展之间不同的微生物动态变化，开发了一个模型，该模型可根据龋齿微生物指标，以 70% 的准确率从健康样本中诊断 ECC，并以 81% 的准确率预测临床认为健康的样儿童的未来ECC发病情况。

幼儿龋齿口腔微生物龋齿预防

Science：我们死后，被哪些细菌分解？

今年1月Rob Knight在Science的“恐怖”之作，结果大概是，不管你死后被埋在哪里，分解你尸体的细菌大概都是类似的。。。