Jun Yu

缺少病毒参考基因组是病毒组研究面临的一大挑战。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表研究，通过改良病毒DNA提取，结合基于三代和二代测序的超深度宏基因组测序，以及配套的生信分析流程，从健康人粪便中解析出1058种基因组完整的新病毒，并对这些病毒基因组进行了多角度分析。这些发现可助力疾病诊断、扩充病毒参考基因组，为进一步开展病毒组研究作出贡献。

人类肠道病毒组三代测序 PacBio测序超深度宏基因组测序诊断标志物

COVID-19

于君等+李晓星+许丽霞：新冠病毒感染肝胆类器官

研究显示，COVID-19患者的γ-谷氨酰转移酶（37%）和总胆红素（5%）异常升高，与患者死亡率较高有关。然而，新冠病毒（SARS-CoV-2）是否可以感染人肝细胞和胆总管细胞，从而造成局部损伤，尚不清楚。香港中文大学的于君、中山大学第一附属医院的许丽霞和李晓星与团队在Gut发表letter文章，发现人类肝脏和胆汁类器官易受SARS-CoV-2感染，并支持病毒大量复制，诱导产生促炎性细胞因子/趋化因子，导致局部肝细胞和胆管细胞受损，胆汁酸积聚，进而导致肝损伤。

COVID-19 肝胆类器官新冠 SARS-CoV-2

结直肠癌

于君等GUT：吸烟改变肠道菌群及其代谢物，促大肠癌

吸烟是结直肠癌（CRC）的一个主要风险因素。Gut最新发表了香港中文大学于君和中山大学附属第一医院魏泓与团队的研究，表明香烟烟雾诱导的肠道菌群失调在CRC中起着致癌的作用。机制上，烟雾诱导的肠道菌群失调改变了肠道代谢物，损伤了肠屏障功能，可能通过激活结肠上皮细胞的MAPK/ERK致癌信号通路来促进CRC的发生。因此，调节肠道菌群或能用于吸烟人群的CRC预防。

结直肠癌肠道菌群肠道菌群代谢物肠屏障

菌群与癌症治疗

于君团队：靶向菌群，优化癌症治疗（综述）

肠道菌群与癌症及其治疗的关系是当前的一个研究热点。Gut近期发表了来自香港中文大学于君团队的重磅综述，总结了菌群与化疗和免疫治疗（免疫检查点抑制剂）之间的药物微生物组学互作，重点阐释了药代动力学和药效学方面的机制，探讨了这些发现的转化潜力，以及目前存在的局限性和未来的研究方向。推荐专业人士学习参考。

菌群与癌症治疗药物微生物组学化疗免疫治疗菌群调节

菌群标志物

黄秀娟+陈家亮+于君：用粪菌标志物诊断肠道腺瘤复发

香港中文大学黄秀娟、陈家亮和于君与团队，近期在Alimentary Pharmacology and Therapeutics发表研究，在前期工作的基础上（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1090389874），评估了粪菌基因标志物用于无创诊断肠道腺瘤复发的潜力。

菌群标志物复发腺瘤

结直肠癌

于君团队：肠道代谢物+菌群或可无创诊断大肠癌

迄今为止，微生物和代谢物如何相互以促进CRC发展的早期事件尚不清楚。香港中文大学的于君团队在Microbiome上发表文章，通过对结直肠癌(CRC)患者、结直肠腺瘤(CRA)患者和健康者(NC)的粪便样本进行代谢组学和宏基因组学分析，鉴定出结直肠肿瘤发生早期阶段潜在的驱动代谢物。代谢组和菌群的综合分析显示，CRC相关代谢物和细菌之间的关联在CRC的不同阶段发生变化。

结直肠癌肠道代谢物肠道菌群标志物

结直肠癌

于君等：N6甲基腺苷阅读器YTHDF1促进大肠癌

香港中文大学的于君团队和多伦多大学的Housheng Hansen He团队合作在Gastroenterology发表文章，发现N6甲基腺苷阅读器YTHDF1在结直肠癌中过表达，且鉴定出YTHDF1-m6A-ARHGEF2轴调控CRC的肿瘤发生和转移。同时证明siRNA药物靶向YTHDF1-m6A-ARHGEF2轴具有治疗CRC的潜力。

结直肠癌 N6-methyladenosine 蛋白翻译

结直肠癌

于君+陈家亮：鸡乳杆菌或可预防结直肠癌的发生

粪便宏基因组测序发现，结直肠癌患者体内出现鸡乳杆菌（Lactobacillus gallinarum）的缺失。香港中文大学的于君和陈家亮作为共同通讯作者在Gut发表文章，发现鸡乳杆菌通过分泌保护性代谢产物——吲哚-3-乳酸（ILA），促进结直肠癌细胞凋亡，从而预防结直肠癌的肿瘤发生。

结直肠癌鸡乳杆菌吲哚-3-乳酸 colorectal cancer probiotics

结直肠癌

于君团队：PCID2或促进大肠癌

全基因组测序显示，PCID2在结直肠癌中扩增。香港中文大学的于君团队在Oncogene发表文章，对结直肠癌中PCID2的表达、生物学功能、分子机制和临床特征进行研究，揭示了PCID2通过降解PML激活典型的Wnt/β连环蛋白信号，同时抑制CTNNB1-ARF-p53轴，发挥致癌功能，提示我们PCID2或可作为结直肠癌复发的独立预测标志物。

结直肠癌 PCID2 PML 复发

结直肠癌

于君团队：rRNA转录抑制子ZNF545缺失促进大肠癌发生

香港中文大学的于君团队在Oncogene上发表文章，对核糖体RNA（rRNA）的转录抑制因子ZNF545在结直肠癌发生中的作用进行探究。发现ZNF545的缺失通过促进核糖体生物合成和蛋白质翻译过程，促进小鼠结直肠癌的发生。提示我们，靶向rRNA生物合成或是治疗ZNF545下调CRC的潜在治疗策略。

结直肠癌核糖体蛋白翻译

少肌症

肠道菌群对肌肉的影响（综述）

Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle上发表的一篇系统性综述，纳入26项临床前研究及10项临床研究的结果进行总结。在多项动物实验中，可观察到肠道菌群对肌肉表型的直接影响，且通过益生菌、益生元、短链脂肪酸等菌群干预手段可增加肌肉量并改善肌肉功能，同时探究了肠道菌群通过肠-肌肉轴的潜在作用机制。在人体研究中，可观察到肠道菌群与肌肉的关联，但肠道菌群对肌肉的影响尚需进一步研究。

少肌症综述

肠道炎症

于君+黄秀娟：靶向肠道菌群治疗新冠肺炎，潜力如何？（评论）

新冠肺炎是目前全球面临的重大健康安全威胁。目前对于临床治疗新冠肺炎的方案一直在不断的探索和修订。近期，香港中文大学于君、黄秀娟与团队在Gastroenterology上发表评论文章，对目前新冠肺炎与肠道菌群的研究进行了汇总和评论。大量的研究数据显示新冠肺炎伴随着肠道菌群的显著改变，因此作者认为在临床治疗新冠肺炎的方案中，应当将肠道菌群干预作为潜在有效的辅助治疗手段。

肠道炎症肠道菌群菌群干预新冠肺炎其他

结直肠癌

于君团队：高脂饮食让肠菌和代谢物“变坏”从而促进肠癌

高脂饮食增加大肠癌的风险。Gastroenterology最新发表了来自香港中文大学于君团队的研究成果，发现高脂饮食能通过诱导小鼠肠道菌群失调、代谢改变和肠上皮屏障功能障碍，驱动结直肠肿瘤发生，并揭示了其中有潜在关键作用的细菌和代谢物。这些发现为靶向肠道菌群及其代谢物来预防和治疗高脂饮食相关的大肠癌，提供了新思路。

结直肠癌高脂饮食肠道菌群代谢物 Dietary nutrient

肝癌

于君+黄炜燊+夏强：从肠入肝的代谢物变化或参与肝癌发生

代谢物的改变在肝细胞癌（HCC）的肿瘤发生中起重要作用。来自香港中文大学的于君、黄炜燊和上海交通大学夏强与团队在Gut上发表文章，通过对2个队列人群中HCC患者和健康对照的门静脉血液代谢物变化进行综合代谢组学分析，并与肝组织和粪便样本中的代谢物变化进行比较。结果显示，HCC患者的代谢组发生改变，尤其是门静脉中代谢物的改变，提示出某些代谢产物或在HCC发生中起作用。

肝癌代谢组学门静脉

非酒精性脂肪肝炎

于君团队：脂肪肝炎诊疗的新靶点

Gastroenterology近期发表了来自香港中文大学于君团队的重要研究成果，首次报道了胆固醇合成的限速酶——角鲨烯环氧化酶（SQLE）在非酒精性脂肪肝炎（NASH）发生发展中的关键作用，揭示了背后的分子机制，并探索了SQLE在NASH诊断和治疗方面的潜在作用。

非酒精性脂肪肝炎角鲨烯环氧化酶碳酸酐酶3 脂质从头合成血清标志物

瘤内菌群

于君团队：肿瘤内的菌群是不均一的，且与大肠癌变相关

结直肠癌（CRC）中存在肠道菌群失调，具核梭杆菌等细菌可促进CRC的发生发展。然而，肿瘤内的菌群组成和特征及其与CRC进展的关系尚不清楚。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表重要研究，首次揭示了结直肠腺瘤和CRC中的肿瘤内菌群异质性，及其与CRC进展和CRC相关基因突变的关系。这些发现为研究肠道菌群在CRC中的作用和机制提供了新的视角。

瘤内菌群结直肠癌异质性 colorectal cancer colorectal carcinogenesis

肿瘤免疫治疗

于君团队：肠道菌群如何影响肿瘤免疫治疗（综述）

香港中文大学的于君团队在Gut Microbes上发表的一篇综述文章，详细介绍了肠道菌群对3种肿瘤免疫治疗方法（包括过继免疫细胞转移、免疫检查点抑制剂（ICI）、CpG寡聚脱氧核苷酸（CpG-ODN））的影响，并讨论了3种菌群靶向调控策略（包括饮食干预、补充益生菌及粪菌移植）以改善肿瘤免疫治疗的疗效的潜能。

肿瘤免疫治疗综述

结直肠癌

黄曦+于君：大肠锯齿状瘤变中的肠道菌群及分子通路（综述）

结直肠癌的癌前病变主要包括腺瘤和锯齿状息肉两大类，此前研究大多关注肠道腺瘤，但近年来对锯齿状病变的研究开始成为新热点。Gut Microbes近期发表来自香港中文大学黄曦和于君与团队的综述文章，详细介绍了锯齿状瘤变的分子特征和通路，以及肠道微生物在其中的潜在作用机制。推荐专业人士学习参考。

结直肠癌肠道菌群锯齿状息肉

胃癌

于君等：NK细胞在胃肠道癌中的角色（综述）

作为对抗癌症的第一道防线，自然杀伤细胞（NK）可以快速靶向和溶解肿瘤细胞而无需事先活化。除了在先天免疫中发挥关键作用外，NK细胞还通过分泌细胞因子和保持免疫记忆增强抗肿瘤适应性免疫反应。来自香港中文大学的于君及研究团队在Oncogene发表最新综述，讨论了NK细胞在胃癌中的细胞毒性和调节作用，及其在临床治疗中的应用现状。

胃癌综述基础研究 NK细胞细胞毒性

结直肠癌

于君等：m6A甲基转移酶或可作为大肠癌治疗靶点

近年来，RNA N6-甲基腺苷（m6A）修饰被证明参与癌症进展的调控。来自香港中文大学的于君与研究团队在Gastroenterology发文指出，RNA m6A甲基转移酶METTL3通过激活m6A-GLUT1-mTORC1轴促进结直肠癌（CRC）进展，或可作为CRC治疗靶点。

结直肠癌研究论文基础研究 m6A 葡萄糖代谢

奇异变形杆菌

黄秀娟+于君：奇异变形杆菌或介导克罗恩病的炎症发展

变形杆菌属是一种革兰氏阴性兼性厌氧杆菌，近期研究表明变形杆菌属物种与肠切除后的克罗恩病（CD）复发相关。香港中文大学的黄秀娟（Siew C Ng）和于君与团队，近期与国外团队合作在Gastroenterology上发表的一项最新研究，发现变形杆菌属在CD患者的粪便及结肠活检样本中更常见且丰度更高，而从患者体内分离出的变形杆菌属均属于奇异变形杆菌。进一步研究发现，奇异变形杆菌在体内外均可诱导炎症应答，并恶化DSS诱导的小鼠结肠炎。该研究提示，奇异变形杆菌可能在克罗恩病的发病机制中起到关键作用。

奇异变形杆菌 P. mirabilis Crohn’s disease Inflammation Pathogen

肠道真菌组

国内团队：中国六族人群的肠道真菌组

昆明医科大学第一附属医院缪应雷、王昆华和香港中文大学黄秀娟与团队，近期在Gastroenterology发表了一项关于中国人肠道真菌组的重要研究。该研究纳入了香港和云南不同地区的6个民族的900多名健康人，系统性地分析了宿主、环境、饮食等多种因素（共118个变量）与肠道真菌组的关联，揭示了地理、城市化、民族和饮食习惯等在塑造肠道真菌组中的重要影响。

肠道真菌组 Mycobiome geography Ethnicity urbanization

嗜热链球菌

港中大+澳科大：嗜热链球菌如何抑制大肠癌？

嗜热链球菌是酸奶生产中使用的一种益生菌，此前研究对526份粪便样本的测序分析鉴定出结直肠癌患者的嗜热链球菌减少。香港中文大学胡嘉麒、于君、陈德威和澳门科技大学伍建林与团队，在Gastroenterology上发表的一项最新研究发现，嗜热链球菌可显著抑制结直肠癌细胞系的存活，并可显著抑制小鼠模型中的结直肠癌发生发展。进一步分析表明，嗜热链球菌的抗肿瘤作用主要由其分泌的β-半乳糖苷酶所介导，后者可调控肠道菌群组成以增加有益菌的丰度，并可通过促进半乳糖的产生以抑制Hippo信号通路。

嗜热链球菌 β-半乳糖苷酶结直肠癌研究论文基础研究

癌症

是敌是友？于君等详述肠道菌群在癌症治疗中的作用（综述）

越来越多的证据显示，调节肠道菌群具有提高抗癌药物疗效的潜力。来自香港中文大学的于君研究团队在Gut发表最新综述文章，讨论了有关肠道微生物群在癌症治疗中的作用，并介绍了可用于靶向特定致癌细菌的方法和技术。

癌症肠道菌群化疗药物免疫检查点抑制剂益生菌

肝细胞癌

于君团队：膳食胆固醇影响肠道菌群及其代谢物，驱动脂肪肝相关肝癌

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是一类代谢疾病，可从脂肪肝进展至脂肪性肝炎，进一步导致肝硬化甚至肝细胞癌（HCC），胆固醇被认为是疾病发展过程中主要的脂毒性分子。Gut杂志最新发表了来自香港中文大学于君团队的研究，以小鼠为模型研究了膳食胆固醇在NAFLD及其相关HCC发生发展过程中的作用和机制，表明高脂高胆固醇饮食可通过改变肠道菌群的组成和代谢物，驱动NAFLD-HCC的发生发展，降胆固醇药物和肠道菌群干预或是有效的预防策略。

肝细胞癌膳食胆固醇肠道菌群肠道菌群代谢产物非酒精性脂肪性肝病

结直肠癌

于君、王海天等：促大肠癌细菌可影响抑癌基因的表观遗传调控

肠道菌群的特定变化以及异常的抑癌基因（TSG）启动子超甲基化，是结直肠癌（CRC）的两个重要特征。香港中文大学于君、王海天与团队在Microbiome发表的一项最新研究，对人结肠组织样本的DNA甲基化组和微生物组进行了平行分析，发现CRC中富集的具核梭杆菌和Hungatella hathewayi可上调DNA甲基转移酶，与多个TSG启动子的超甲基化存在显著关联，从而可能驱动了CRC的发生和发展。

结直肠癌 colorectal cancer microbiota DNA methylation MBDCap-Seq

结直肠癌

于君等：大肠癌中的肠道古菌组失调

结直肠癌（CRC）与肠道菌群失调关系密切，此前研究主要聚焦肠道细菌，对真菌和病毒的变化也有报道，但肠道古菌与CRC的关系仍不清楚。《Gastroenterology》最新发表了来自香港中文大学于君与团队的研究，用宏基因组测序分析鉴定了我国健康人、CRC癌前病变（腺瘤）和CRC患者的肠道古菌组成特征，表明粪便古菌组或能作为CRC肿瘤发展的标志物，并报道了CRC中的古菌与细菌间的生态网络互作的变化，提示CRC中的肠道古菌失调可能与细菌失调共同促进了肿瘤发生。这些发现为描绘CRC肠道微生态的失调特征又填补了一块缺失的拼图，也为CRC的检测诊断和预防治疗提供了新思路。

结直肠癌肠道古菌组 stool sample microbe single-celled prokaryote

阿司匹林

于君团队：肠道细菌可影响阿司匹林的抗大肠癌作用

肠道菌群变化影响结直肠癌发展及药物代谢。来自香港中文大学的于君团队在Gastroenterology上发表的一项最新研究，发现在接受过抗生素处理的结直肠癌小鼠模型中，阿司匹林可抑制肿瘤发生发展；但在未接受抗生素处理的结直肠癌小鼠模型中，阿司匹林则无类似的抗癌作用。另外，相比于菌群正常化的小鼠，无菌小鼠在阿司匹林处理后，结直肠癌的发展可被显著抑制。机制上，肠道菌群中的球形芽孢杆菌（Lysinibacillus sphaericus）可降解阿司匹林，消除阿司匹林通过改善肠道菌群而发挥的抗癌作用。

阿司匹林结直肠癌动物实验球形芽孢杆菌药物代谢

胃肠道癌

于君团队：胃肠道癌类器官的基础和转化研究（综述）

胃肠道癌 gastrointestinal cancer Gastrointestinal models 类器官胃肠道模型

梭杆菌属

港中大团队：我国南方人肠道菌群中常见多种梭杆菌，或与大肠癌有关

梭杆菌属中，具核梭杆菌在结直肠癌（CRC）中富集，FadA黏附素可能介导了这种细菌对CRC的促进作用。Gut近期发表的来自香港中文大学团队的研究发现，我国南方人群的肠道菌群中，多个梭杆菌属细菌类群都比在其它人群中更为常见，含量和多样性也更高，并且从可变梭杆菌（F. varium）和溃疡梭杆菌（F. ulcerans）等多个梭杆菌菌种中，鉴定出FadA同系物的存在，或许与CRC相关。这些发现不仅扩充了与CRC有潜在关联的肠道细菌种类，也揭示出不同人群中梭杆菌属细菌的分布和多样性差异，再次提示基于菌群类群特征的诊断和治疗方法需要针对不同人群进行“量身定制”。

梭杆菌属结直肠癌肠道菌群标志物肠道菌群中国人群