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假阳性率
文章数:3篇
差异丰度检验
Nature子刊:菌群差异丰度法在38个数据集中产生不同的结果
识别差异丰富的微生物是菌群研究的共同目标。然而,很少有大规模的研究系统地探讨互换使用这些工具(差异丰度检测方法(DA))的适当性,以及它们之间差异的程度和意义。本研究通过 38 个两组 16S rRNA 基因数据集对常见DA工具进行了额外评估,其工作能够改进对这些 DA 工具的评估,并强调了在独立评估中被持有的先前研究提出的关键建议,此外,其分析显示了DA 工具的各种特征,作者可以用其来评估该领域内已发表文献。作者建议研究人员应使用基于多种差异丰度方法的共识方法,以帮助确保稳健的生物学解释。
差异丰度检验
菌群研究
数据集
生物学解释
假阳性率
表观转录组学
Nature子刊:中山大学团队在RNA修饰方法学领域取得重要进展
为了解决RNA修饰检测中所面临的方法学难题,中山大学骆观正团队提出了一种新的研究策略。通过构建全转录组无修饰RNA文库作为负对照,全面评估了现有的基于二代测序的RNA修饰检测技术,并为修饰位点的精确鉴定提供系统的解决方案,有望成为目前和未来RNA修饰检测的金标准。
表观转录组学
无修饰RNA文库
体外合成全转录组RNA
假阳性率
16s rRNA测序
Microbiome:基于数据特性的标准化和微生物丰度差异分析策略
Rob Knight和团队操刀的方法学文献一篇,特别推荐给大家。
16s rRNA测序
标准化
归一化
丰度差异检验
稀释