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Søren Brunak
文章数:9篇
月经期偏头痛
JAMA子刊:月经期偏头痛的临床表现和诊断
偏头痛是一种常见的慢性血管神经性疾病,其特征为反复发作、单侧或双侧搏动性剧烈头痛且多发生于偏侧头部。月经期偏头痛则指与月经有关的、暂时性发作的偏头痛,常于月经来潮前或来潮时出现,可分为单纯性月经性无先兆偏头痛和月经相关性无先兆偏头痛。本研究探讨了月经期偏头痛与非月经期偏头痛的临床表现差异,同时为月经期偏头痛的诊断标准的制订提出了新的证据。
月经期偏头痛
研究论文
偏头痛
女性
诊断标准
药物-组学关联
Nature子刊:利用深度学习模型挖掘药物与多组学数据间的关联
先前多项研究已经证明测序技术和多组学的快速发展,极大促进了疾病标记物的识别和精准医学的发展,但有效整合多组学数据和表型数据的规模和异质性,并且进一步深入挖掘数据间的关联仍存在较大地挑战。近日,丹麦哥本哈根大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究,开发了一个基于深度学习的多组变分自编码器(MOVE),并且将这一方法应用于789名新诊断的2型糖尿病患者的多组学表型数据,以探究药物与组学表型间的关系。发现MOVE能够有效整合处理多组学和表型数据,并能更灵敏地挖掘出药物-组学间的关联,其中二甲双胍和奥美拉唑对多组学数据影响最明显,值得关注。
药物-组学关联
T2D患者
研究论文
基础研究
深度学习模型
痔疮
近百万人的GWAS分析揭示痔疮的风险基因
来自Gut上发表的一项最新研究,对近百万人(包括超过20万名痔疮患者)进行GWAS分析,鉴定出了102个痔疮相关风险基因位点,发现痔疮与神经肌肉运动性、平滑肌收缩及胞外基质组织受损相关,而基于风险基因位点计算的痔疮多基因风险评分可鉴别出严重痔疮的高危人群。
痔疮
研究论文
基础研究
全基因组关联分析(GWAS)
风险基因
ABCG5/8
饮食胆固醇和植物甾醇或增加冠心病风险
ABCG5/8基因是影响肠道吸收甾醇的关键调节因子。European Heart Journal近期发表的文章,利用冰岛、丹麦和英国3个国家的生物数据库探讨膳食胆固醇和植物甾醇吸收的变异性是否影响冠心病的风险。发现胆固醇吸收的遗传变异影响非高密度脂蛋白胆固醇水平和冠心病风险,饮食胆固醇和植物甾醇可直接促进动脉粥样硬化的发生。
ABCG5/8
膳食胆固醇
植物甾醇
吸收
dietary cholesterol
肠道免疫
Cell子刊:孤立淋巴滤泡中的肠道区域化适应性免疫应答
肠道中含有最复杂多样的免疫区域。肠道相关淋巴组织(GALT)是适应性免疫细胞活化及分化的区域,GALT中包括派尔集合淋巴结(PP)及孤立淋巴滤泡(ILF)。来自Immunity上发表的一项最新研究,报道了一种分离肠道中的ILF的方法,并对比分析了ILF、其它GALT及不含GALT的肠道固有层中免疫细胞的组成与功能,发现ILF作为肠道中区域化的适应性免疫应答起始的区域,其中含有更高比例的naive T细胞,同时也是生发中心B细胞致敏(priming)的区域。
肠道免疫
human intestinal regional mucosal follicles
ILF
PP
colon
生物信息学工具
Nature子刊:带你玩转人微生物组和代谢组数据
本文介绍了一个曾被用于揭示肠道菌群在宿主胰岛素抵抗的背景下如何影响循环系统代谢物的数据挖掘方法。对应研究可参考此前日报中的报道:两种肠道细菌改变血清代谢组,增加糖尿病风险(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1095814020)。
生物信息学工具
微生物组
代谢组
血液代谢组学
Ⅱ型糖尿病
血清代谢组学
Nature:两种肠道细菌改变血清代谢组,增加糖尿病风险
最新online的nature,关注肠道菌群如何影响血清代谢组、胰岛素抵抗、代谢和心血管疾病,值得一读。
血清代谢组学
胰岛素抵抗
支链氨基酸
转运蛋白
葡萄糖不耐受
二甲双胍
Nature:二甲双胍对糖尿病人的肠道菌群到底有何影响?
去年Nature上的重量级研究,证实二甲双胍通过微生物调节而产生的药效是通过产生短链脂肪酸,并增加埃希氏杆菌达成的。强烈推荐重温经典。
二甲双胍
二型糖尿病
短链脂肪酸
埃希氏杆菌
Grace Hewon Shin
人肠道宏基因组
Nature:在人类肠道中鉴定出330万个微生物基因(2010)
经典回顾,这是MetaHIT抢在HMP团队之前在Nature上发出的第一个重量级阶段性研究成果,也是覃俊杰博士的成名之作,迄今被引用次数已近4000次。
人肠道宏基因组
Jacques Ravel
Jacques Ravel