蛋白质组学

结直肠癌是最常见的消化系统恶性肿瘤之一，也是全球癌症相关死亡的主要原因。与其他癌症不同，大多数CRC病例并没有单一的危险因素。近日，复旦大学附属中山医院丁琛、侯英勇、许剑民、Chen Xu及团队在Cell Reports Medicine发表最新研究，基于254个肿瘤组织的蛋白质组，揭示了与治疗反应相关的潜在分子特征和调节机制，并确定了治疗反应的生物标志物，最终可在临床实践中为结直肠癌患者服务，值得关注。

治疗反应蛋白质组学研究论文基础研究预后

胃肠道间质瘤

复旦大学：从蛋白质组学视角认知胃肠道间质瘤

胃肠道间质瘤（GIST）是最常见的胃肠道间充质肿瘤，具有较高的转移率和复发率。复旦大学的贺福初、沈坤堂、侯英勇和丁琛与团队在Gastroenterology发表文章，通过对GIST的蛋白质组学和磷酸蛋白质组学进行分析，进一步研究GIST发生的生物过程和治疗机会。

胃肠道间质瘤蛋白质组学磷酸蛋白质组学

多组学

刘占举+郭天南+朱瑞新Cell子刊：多组学破译克罗恩病中宿主与肠道菌群互作的空间特征

宿主-菌群互作失调在克罗恩病 (CD) 肠炎的发生发展中起着关键作用，然而肠道及其附属组织的空间分布和相互作用网络尚不清楚。近日，同济大学刘占举、朱瑞新团队联合西湖大学郭天南在Cell Reports Medicine发表文章，通过对克罗恩病患者的肠道及其附属组织的整合多组学分析，揭示了宿主蛋白和肠道菌群的空间特征及其相互作用，为CD发病机制以及基于蛋白和微生物的潜在诊断标志物提供了新见解。

多组学炎症性肠病肠道菌群蛋白质组学克罗恩病

结直肠癌

蛋白质组可预测异时性进展期大肠肿瘤的发展

结肠腺瘤性息肉或腺瘤是常见的癌前病变，也是大多数结肠腺癌的起源。但流行病学显示，只有一小部分腺瘤（3-5%）发展为癌症，目前缺乏相关的分子标志物来进行监测。Gastroenterology近期发表的文章，使用各种新算法和统计包对98个切除腺瘤样本的定量蛋白质组数据进行了深入分析，发现它们的蛋白质组可以提前几年预测异时性进展期病变的发展和进展。

结直肠癌蛋白质组学结直肠腺瘤

饮食-菌群-宿主互作

Cell：肠菌喜欢吃什么？

正如不同的人喜好不同的口味，肠道细菌对营养物质的偏好也各有脾性。Cell最新发表的一项研究，通过基于同位素示踪的方法，对小鼠肠道菌群以及菌群中不同成员（细化到菌属水平）的营养偏好，开展了大规模的体内定量分析，并结合小鼠饮食干预实验进行了检验。该研究系统性地回答了“哪类营养喂养了肠道菌群，产生了哪些菌群代谢物”以及“哪些肠菌偏好哪些营养物质”等重要问题，为进一步理解饮食-菌群-宿主的相互作用，提供了新的方法和资源。

饮食-菌群-宿主互作肠道菌群代谢组学蛋白质组学同位素示踪

炎症标志物

3种与IBD患者的肠道炎症相关的粪便标志物

Journal of Crohn's and Colitis上发表的一项最新研究结果，基于蛋白质组学分析，鉴定出了3种与IBD患者的肠道炎症相关的粪便蛋白质：糜蛋白酶C、凝溶胶蛋白及RhoGDI2。

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肠-脑轴

谢鹏+魏泓：菌群相关抑郁症中的肠-脑轴蛋白质组学分析

肠道菌群可能通过肠-脑轴影响抑郁症的发生发展。重庆医科大学谢鹏团队和第三军医大学魏泓团队合作，近期在Translational Psychiatry发表研究，在移植了抑郁症患者肠道菌群的小鼠模型中，揭示了肠道菌群失调相关的肠-脑轴蛋白质表达和功能的改变，为进一步理解菌群在抑郁症中的作用带来了新启示。

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禁食

Cell子刊：为啥间歇性禁食不易减掉肚子上的肥肉

间歇性禁食有助于改善肥胖，Cell Reports近期发表的一项研究，通过蛋白质组学方法，在小鼠中分析了不同部位和类型的脂肪组织对间歇性禁食的反应差异，揭示了内脏脂肪对禁食的抵抗机制。

禁食脂肪组织蛋白质组学

新冠肺炎

国内团队：新冠病毒或影响母乳成分

来自华中科技大学同济医学院、武汉金银潭医院、中科院武汉病毒研究所、广州妇女儿童中心、厦门大学、湖北省妇幼医院等多家机构科研团队合作开展的研究发表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》中。本研究利用多组学技术探索了新冠康复的孕妇产后初乳中脂质组学、蛋白组学和代谢组学的变化，并通过数据库比对阐释这其中可能导致的功能性变化。为进一步探索孕妇新冠病毒感染对后代造成的潜在影响提供可能。

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转移性结直肠癌

国内团队：多组学分析预测大肠癌转移和药物反应

来自中科院上海生物化学与细胞生物学研究所和上海科技大学的曾嵘和吴家睿，以及来自海军医科大学附属长海医院的Wei Zhang研究团队合作，在Cancer Cell上发表最新研究。共纳入146名结直肠癌（CRC）患者（包括70名转移性CRC患者）的480例临床组织，对其进行多组学整合分析。原发瘤的蛋白质组学和磷酸化蛋白组学分析成功区分出转移病例。结合网络分析，可准确反映原发瘤和转移瘤的药物反应。该研究为更好地理解转移性CRC提供了潜在的临床应用价值。

转移性结直肠癌研究论文医学研究基因组蛋白质组学

治疗靶标

Nature：号外！中国学者发现治疗早期肝细胞癌的新靶标！

乙型肝炎病毒感染是我国肝细胞癌的主要诱因。国家蛋白质科学中心和复旦附属中山医院近期联合在Nature上发表研究，利用蛋白组学将早期肝细胞癌进行分型，并发现了可有效抑制高死亡率亚型的治疗靶标和对应药物，对于研究癌症病理、开发个性化治疗手段具有重要参考价值！

治疗靶标蛋白质组学 liver cancer proteomics 动物实验

果胶降解细菌

人肠道中存在专性降解果胶的细菌

果胶是水果蔬菜中的重要成分，一度被认为由肠道中的多能多聚糖降级细菌分解。本研究在人肠道中发现了一种专性降解果胶的细菌Monoglobus pectinilyticus。这种细菌的存在可能与肠道菌群适应人类高果胶饮食的过程有关，填补了专性果胶降解细菌的空白，值得参考。

果胶降解细菌 Monoglobus pectinilyticus 基因组分析蛋白质组学人肠道细菌

肠道菌群体外培养

JPR：体外培养肠道菌群，需注意培养基成分

Journal of Proteome Research[IF：4.268]发表的这篇文章关注培养肠道菌群时，不同的培养基成分会对细菌的组成和功能产生显著影响。这是很有启发意义的文章，特别推荐。

肠道菌群体外培养培养基正交实验设计蛋白质组学 Ken Cadwell

锻炼

Nature Reviews：锻炼时，葡萄糖如何被更多消耗？（综述）

锻炼时，肌肉组织直接从血液中获得葡萄糖以满足能量来源需求，这不依赖于胰岛素，对糖尿病患者来说，通过锻炼无疑可能降低血糖水平，这是很有意义的事情。这篇文章值得好好看看。

锻炼葡萄糖糖尿病胰岛素抵抗蛋白质组学