Jun Wang

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文章数：7篇

中科院动物所张知彬组揭示肠道微生物介导了降雨变化对田鼠种群的上行效应

小型啮齿动物的种群波动现象困惑了生态学家将近百年的时间，种群调节也因此成为了种群生态学中的经典问题。目前，从食谱-肠道微生物相互作用的角度，阐明降雨对种群的上行效应的研究少之又少。本研究中，作者分别开展了野外大型人工增雨实验和室内食谱功能的验证实验。该项研究提供了降雨通过食谱-肠道微生物互作的途径发挥对种群上行效应的实验证据，同时，强调要多多关注动物种群在响应气候变化时，宿主肠道微生物从中起到的重要作用。本研究验证了肠道微生物在降雨对种群的上行效应中发挥的作用机制。

布氏田鼠肠道微生物

中科院动物所张知彬组揭示肠道微生物介导了降雨变化对田鼠种群的上行效应

小型啮齿动物的种群波动现象困惑了生态学家将近百年的时间，种群调节也因此成为了种群生态学中的经典问题。目前，从食谱-肠道微生物相互作用的角度，阐明降雨对种群的上行效应的研究少之又少。本研究中，作者分别开展了野外大型人工增雨实验和室内食谱功能的验证实验。该项研究提供了降雨通过食谱-肠道微生物互作的途径发挥对种群上行效应的实验证据，同时，强调要多多关注动物种群在响应气候变化时，宿主肠道微生物从中起到的重要作用。本研究验证了肠道微生物在降雨对种群的上行效应中发挥的作用机制。

布氏田鼠肠道微生物降雨上行效应羊草短链脂肪酸

儿童肠道菌群

学龄儿童可能存在3种肠型特征

Microbiome发表的一项最新研究分析了荷兰10岁以下的学龄儿童的肠道菌群特征，鉴定出3种肠型，与哺乳期长短和学前饮食习惯相关，并分析了每种肠型的组成和功能特征，发现肠型可影响饮食与代谢表型的关联。

儿童肠道菌群 School-age children Gut microbiota enterotype Metabolic phenotypes

华大基因等：素食对肠道菌群和免疫有何影响？

华大基因团队参与的一项研究近期在Frontiers in Immunology发表，首次用宏基因组测序分析了素食对肠道菌群和免疫的影响，表明短期素食（3个月）对免疫系统和菌群宏基因组没有显著改变，但长期素食可能使菌群的“炎症性”下降。

饮食素食肠道菌群免疫免疫球蛋白

类风湿关节炎

类风湿性关节炎患者口腔及肠道菌群受到扰乱且在治疗后部分恢复

① 纳入类风湿关节炎患者（RA）及健康人的粪便、牙齿及唾液样品，分析三个部位样品菌群组间差异；② RA患者口腔及肠道菌群失调，且具有一致性，治疗后菌群可部分恢复；③ RA患者样本中，嗜血杆菌属消失殆尽且与血清抗体水平呈负相关，唾液乳酸杆菌过表达且与RA活跃程度正相关；④ 在功能上，RA患者体内的氧化还原环境、铁、硫、锌和精氨酸的转运和代谢发生改变；⑤ 检测到与RA相关的人类抗原的分子拟态，提出利用菌群进行预后和诊断的可能方法。

类风湿关节炎口腔菌群肠道菌群 W H Wilson Tang Stanley L Hazen

PNAS-2013：杨瑞馥等破解鼠疫菌进化规律

① 鼠疫耶尔森氏菌是鼠疫病原体，本文对133株鼠疫菌全球分离株进行了测序和分析，并基于SNP变异重建了鼠疫菌种系关系；② 结果表明该菌进化以中性过程为主，但种系间突变率存在很大差异，各进化分支上变异累积速度显著不同；③ 进而提出中性条件下病原菌进化速度会受到种群大小波动影响，造成静息期与流行暴发期之间的突变率发生变化；④ 本研究将有助于进一步探索鼠疫耶尔森氏菌的进化机制、致病性及其传播的历史模式。

Paul W O'Toole Paul W O'Toole

杨瑞馥老师研究论文集

NEJM2011：杨瑞馥等，3天破解致病菌全基因组

2011年，杨瑞馥、覃俊杰等老师的经典之作。

杨瑞馥老师研究论文集 Jia Xu Fengmei Lian Liping Zhao Xiaolin Tong