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Nicholas DiBenedetto
文章数:3篇
艰难梭菌
Cell子刊:用于艰难梭菌系统分析的调控和代谢网络预测模型
艰难梭菌(Cd)是医院内感染的首要病原体,可引起伪膜性结肠炎。Cell Host and Microbe发表的这项研究,报道了可用于解析Cd与宿主互作的Cd基因调控和代谢网络的3个预测模型,研究者建立了一个网站((http://networks.systemsbiology.net/cdiff-portal/),为Cd研究者提供研究模型、数据集和算法工具。
艰难梭菌
宿主-致病菌互作
细菌间互作
Cell子刊:共生菌塑造肠道环境,影响致病菌感染
肠道共生菌与致病菌间存在复杂的互作关系,Cell Host and Microbe发表的这项研究,采用多组学的系统生物学方法,在艰难梭菌感染小鼠模型中,探索了不同的梭菌属细菌( Paraclostridium bifermentans 和 Clostridium sardiniense )如何调控致病菌定植、生长和毒力从而影响宿主生存。这些发现为研发抗艰难梭菌的细菌疗法带来启示。
细菌间互作
艰难梭菌感染
肠道菌群
代谢调控
改变肠道共生菌的胆盐水解酶,可影响宿主代谢
菌群功能影响宿主代谢,但由于菌群基因和功能的复杂性,如何解析单个基因/功能对宿主的影响,是关键问题。eLife上一项来自哈佛医学院的最新研究,提供了一个值得参考的例子。通过细菌培养、细菌基因敲除、在无菌小鼠中进行单菌株定殖等方法,该研究揭示了共生菌的特定胆盐水解酶对宿主代谢的影响。
代谢调控
胆盐水解酶
肠道共生菌
多形拟杆菌
biochemistry