Lora V Hooper

肠道菌群在调节动物宿主的脂质吸收、代谢和储存方面发挥重要作用，是防治代谢性疾病的潜在靶点。长非编码 RNA（lncRNA）是一种不翻译但具有生物功能的 RNA 转录物，可调控多种生物过程。浙江大学医学院王宇浩团队与美国德克萨斯大学西南医学中心Lora Hooper团队合作，在Science发表重要研究，揭示了肠道菌群调控宿主代谢的一种新机制，表明菌群可通过调控宿主lncRNA，来影响宿主脂代谢。该研究发现，肠道菌群通过免疫细胞间的信号中继，降低肠上皮细胞中的lncRNA基因Snhg9的表达，这抑制了CCAR2-SIRT1复合物的解离，从而上调转录因子PPARγ的活性，增加脂质的吸收和储存，促进宿主长胖。这些结果为靶向菌群和lncRNA治疗代谢性疾病提供了新线索。

菌群-宿主互作肠道菌群肠上皮脂代谢 lncRNA

抗微生物蛋白

胡泽汗等Science突破：一种新型肠道抗菌蛋白，在寄生虫感染时保护肠屏障

抗微生物蛋白（AMP）是宿主分泌的对粘膜表面病原体的一道重要防线。美国德克萨斯大学西南医学中心的Lora V. Hooper实验室胡泽汗和张晨璐等在Science发表的一项最新研究中，鉴定出一种新型杀菌蛋白SPRR2A（富含脯氨酸的小蛋白2A），在系统发育和作用机制上不同于已知的菌群诱导的AMP。该蛋白能选择性抑制革兰氏阳性的共生菌和致病菌，并能由抗寄生虫的2型免疫诱导，在肠道蠕虫感染期间保护肠屏障抵抗细菌入侵。

抗微生物蛋白粘膜免疫革兰氏阳性菌抗寄生虫免疫肠道屏障

肠道免疫

Science：调控肠道适应性免疫的新机制

维生素A的代谢物视黄醇对肠道适应性免疫有关键作用，缺乏维生素A可增加肠道感染风险。肠道髓系细胞（如树突状细胞和巨噬细胞）能摄入视黄醇，将其加工成视黄酸（RA），并将生成的RA传递给发育中的B细胞和T细胞，进而促进B细胞和T细胞的肠道归巢、诱导B细胞生成IgA。但目前不清楚的是，视黄醇是如何被转运至髓系细胞中的。血清淀粉样蛋白A（SAA）是肠上皮表达的一种视黄醇结合蛋白，其表达受肠道菌群和膳食维生素A的调控。Science发表的一项最新研究鉴定出SAA的髓系细胞表面受体——低密度脂蛋白受体相关蛋白1（LRP1），并证实其能结合SAA-视黄醇复合体，介导了肠道髓系细胞对视黄醇的摄取。对敲除Saa和髓系细胞特异性敲除Lrp1的小鼠模型的进一步研究，证实了SAA和LRP1在维生素A依赖性的肠道适应性免疫中有关键作用。这些发现扩展了人们对肠道免疫机制的认知，为调节肠道免疫、治疗相关疾病提供了新线索。

肠道免疫适应性免疫维生素A 髓系细胞

菌群-免疫互作

Cell：生物钟通过肠道菌群调控先天性免疫的昼夜节律

进食的昼夜节律导致动物的食源性细菌暴露也表现出昼夜差异。Cell上发表的一项最新研究，发现生物钟可通过调控小鼠的进食节律，导致分节丝状菌与肠道上皮的节律性粘附，以驱动上皮细胞的STAT3表达及活化的昼夜节律，从而造成抗菌肽表达的昼夜差异，最终导致小鼠对致病菌感染的抗性的昼夜节律。

菌群-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）昼夜节律

基因水平转移

转导组学——研究基因转移的组学新技术

水平基因转移（HGT）在微生物进化中起着重要作用，但是目前尚缺乏观察微生物群落中正在进行的HGT的方法。Microbiome近期发表一种“转导组学”测序方法，通过检测病毒类颗粒中的细菌来源DNA，检测微生态样本中正在进行的基因水平转移事件。该方法可用于检测主要肠道细菌类型间的HGT事件，对研究微生态进化、耐药基因转移等均具有重要参考价值。

基因水平转移基因组测序研究论文转导组基础研究

肠道炎症

Cell子刊：肠道炎症中，多形拟杆菌将其它细菌的铁载体收为己用

炎症期间，我们的身体会限制微生物对铁的利用。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究发现，不表达铁载体的肠道共生菌（比如多形拟杆菌）可将其它肠道菌（比如肠杆菌科细菌）生成的铁载体“收为己用”，从而增强自身在宿主肠道炎症环境中的生存能力。这些发现揭示出肠道菌群内部的一种互养机制，可帮助菌群抵抗环境扰动。

肠道炎症菌群内互作 GUT INFLAMMATION iron metabolism siderophore

代谢节律

Science：菌群如何掌控肠道代谢生物钟

生物体的代谢存在明显的昼夜节律性，Science最新发表来自德克萨斯大学西南医学中心团队的一项小鼠研究，表明菌群控制宿主小肠上皮细胞的营养摄入和代谢的昼夜节律性。该过程中，组蛋白脱乙酰酶3（HDAC3）整合肠道菌群和光暗节律信号，是调控代谢基因节律性表达的关键因子。这些发现为肠道菌群调控宿主代谢和生物钟提供了新的机制，也表明靶向肠上皮HDAC3，或是治疗肥胖等代谢疾病的新策略。Science同期专门配发了解读性的观点文章（链接见延伸阅读），不妨搭配阅读。

代谢节律菌群-宿主互作表观遗传小肠上皮细胞组蛋白脱乙酰酶3

皮肤免疫

Cell子刊：膳食维生素A如何帮助抵抗皮肤感染？

缺乏维生素A可增加皮肤感染易感性，但机制不清。《Cell Host and Microbe》近期发表的一项研究显示，抵抗素样分子α（RELMα）是表皮细胞表达的一种抗微生物蛋白，可塑造皮肤菌群，抑制皮肤感染，而且，RELMα可由饮食中的维生素A所诱导，介导维生素A的抗皮肤感染作用。为了皮肤健康，饮食中可别缺了维生素A~

皮肤免疫 Skin innate immunity antimicrobial protein vitamin A

肠道免疫

孕产期高脂饮食如何影响后代菌群和肠炎易感性

JCI insight近期发表一项动物研究，证实围产期食用高脂饲料的母鼠，其后代小鼠肠道菌群发生改变，可引起3型天然淋巴细胞扩增，增加对肠道炎症的易感性。

肠道免疫 IMMUNOLOGY Inflammation INFLAMMATORY BOWEL DISEASE innate immunity

肠道病毒组

Nature子刊：结肠炎状态下肠道噬菌体组发生变化

肠道噬菌体可能在炎症性肠炎中具有重要作用。本研究通过对比健康小鼠和结肠炎小鼠的肠道噬菌体组，发现在炎症性肠炎条件下，肠道噬菌体组的结构组成和宿主类型会发生变化，为研究IBD中噬菌体的作用奠定了一定的基础，值得专业人士参考。

肠道病毒组炎症性肠炎小鼠模型 Erica L Plummer Mimi L Tang

潘氏细胞

Cell子刊：菌群介导的肠壁细胞自噬帮助维持肠稳态

肠道内环境稳定依赖多细胞的协同作用，包括局部免疫细胞、肠道上皮细胞和肠道菌群。Cell Host and Microbe[IF：14.946]近期发表的研究发现，肠道菌群诱导IFN-γ引发潘氏细胞正常自噬，有助于抵御急性胃肠道感染；潘氏细胞的自噬功能的丧失会在胃肠道感染过程中引发了严重的肠道炎症反应。对研究肠道稳态维持、菌群-宿主互作很有参考价值。

潘氏细胞细胞自噬弓形虫自噬蛋白Atg5

肠道炎症

Nature：精准消灭肠道特定细菌，改善结肠炎！

肠道炎症靶向清除肠杆菌科钨酸盐 Jerome Ozkan

酒精性脂肪肝

CHM：酒精怎样让蛋白受损、细菌移位、脂肪肝产生？

① 长期饮酒导致的肠道紊乱及细菌过度生长，与肠道内REG3凝集素水平降低有关；② 肠道缺失REG3B或REG3G可导致黏膜相关细菌数量增加，并增强细菌向肠系膜淋巴结和肝脏的转移，促进酒精诱导的脂肪性肝病向脂肪性肝炎发展；③ Reg3g在肠道上皮细胞过表达，可限制细菌在黏膜表面定植，减少细菌易位，抑制酒精诱导的小鼠脂肪肝发展；④ 酗酒可导致人小肠内粘膜相关细菌增加；⑤ 酒精损伤机体对黏膜菌群的控制能力，破坏黏膜屏障，促进酒精性肝病进展。

REG3 酒精性脂肪肝粘膜相关菌群

缺氧诱导因子-1α

【耐药专题】Nature子刊：肠道细菌如何抑制白色念珠菌定殖？

① 拥有成熟且完整的肠道菌群的成年小鼠对白色念珠菌在胃肠道的定殖有抗性；② 共生厌氧细菌——特别是厚壁菌门中的梭菌属（IV及XIVa簇）及拟杆菌门对维持白色念珠菌的定殖抗性十分关键；③ 缺氧诱导因子-1α（HIF-1α，活化先天性免疫效应细胞的重要转录因子）及抗菌肽LL-37（小鼠中的CRAMP）在抗白色念珠菌定殖中发挥决定性作用；④ 抗生素处理可使白色念珠菌定殖，药物激活Hif1a可诱导CRAMP表达，并显著降低白色念珠菌定殖。

缺氧诱导因子-1α 抗菌肽LL-37 白色念珠菌 Briana Vecchio-Pagan Sharon Bewick