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Jon Clardy
文章数:9篇
发现新型免疫调节作用代谢物——来自鼠肠杆菌的心磷脂
近日,发表在Journal of the American Chemical Society上的这篇文章,对小鼠肠道菌群进行系统表型筛选以寻找具有免疫调节作用的代谢物,并发现来自鼠肠杆菌的心磷脂诱导抗原特异性细胞因子反应。
AKK菌
Nature:Akk菌如何调节免疫?锁定新的关键分子
肠道菌群中的嗜黏蛋白阿克曼菌(Akk菌)可谓是一种“明星”肠菌,可发挥多种健康益处,包括调节宿主免疫,然而其分子机制仍待揭示。Nature最新发表了来自哈佛医学院Jon Clardy团队和Ramnik Xavier团队的合作研究,通过一系列体外实验,鉴定出Akk菌表达的一种具有免疫调节作用的磷脂分子,并揭示了其功能特征和机制。研究表明,该分子通过作用于非经典的TLR2-TLR1异二聚体来引起特定炎症细胞因子的释放,且在低剂量作用下能“钝化”免疫细胞的活化阈值。这为Akk菌的免疫调节作用提供了一种新的分子机制,将菌、效应分子、信号途径和生物学表型串联起来。这些发现仍需在体内模型中进行验证,但其采用的研究方法和思路对于挖掘其他肠道微生物的分子机制具有参考意义。
AKK菌
免疫调节
肠道菌群
活泼瘤胃球菌
活泼瘤胃球菌驱动炎症反应与荚膜多糖密切相关!
目前,尚不清楚活泼瘤胃球菌(R. gnavus)对IBD疾病的影响。PNAS近期发表的文章,发现表面包被荚膜多糖的R. gnavus细菌能抑制炎症反应,相反,表面不含荚膜多糖的R. gnavus会促进炎症反应。这项工作从分子层面阐述了R. gnavus与IBD疾病的关系,或为IBD潜在的治疗干预提供新的见解。
活泼瘤胃球菌
荚膜多糖
炎症
树突状细胞
肠内分泌细胞
Cell子刊:肠内分泌细胞怎样感知肠菌信号并传给神经?
肠上皮利用上皮感觉肠内分泌细胞(EEC)感知营养和微生物刺激。脊椎动物的肠道受肠内神经系统(ENS)和来自自主神经的外源性神经元的支配,但肠道微生物刺激是否以及如何通过EEC调节ENS或迷走神经感觉活动尚不清楚。发表在Cell Host and Microbe上的一项研究发现了保守的TRPA1途径,通过这个途径,EEC可以调节肠道和迷走神经通路以响应微生物信号,或可用来治疗肠道菌群相关的神经系统疾病。
肠内分泌细胞
色氨酸代谢产物
共生菌-神经互作
菌群-肠-脑
肠蠕动
IBD
与克罗恩病相关的活泼瘤胃球菌可产生促炎症性多糖
活泼瘤胃球菌的丰度增加与克罗恩病患者的症状严重程度相关,但背后的机制尚未明确。来自PNAS上发表的一项最新研究,发现活泼瘤胃球菌可产生一种促炎症性多糖glucorhamnan,可以TLR4依赖性方式诱导树突细胞分泌TNF-α。
IBD
INFLAMMATORY BOWEL DISEASE
Microbiome
Polysaccharide
菌群-免疫互作
菌群-肠-脑轴
Nature子刊:产生神经递质GABA的肠道菌可能与抑郁症有关联
菌群-肠-脑轴是肠道菌群研究中的重要领域,通过调节菌群来改善神经疾病是很有吸引力的研究方向。Nature Microbiology本周发表的一项研究,通过共培养方法,鉴定出一系列产生神经递质γ-氨基丁酸(GABA)的肠道细菌,其中拟杆菌属的丰度与抑郁症负相关。
菌群-肠-脑轴
抑郁症
肠道菌群
神经递质
γ-氨基丁酸
醌
Microbiome:甲基萘醌是人体肠道菌群的生长因子
这是Microbiome[IF:8.496]发表的一项重要的关注“交叉喂养”的研究,确定出上游(帮手)细菌的甲基萘醌合成途径对下游细菌的生长具有促进作用。类似的研究都值得特别关注,对揭开微生态系统中不同物种的协作机制有很大参考价值。
醌
甲基萘醌
Cultivation
Faecalibacterium
growth factors
代谢产物
Cell:肠道菌群代谢产物抑制宿主蛋白酶活性
Cell又有新的菌群文献发出!通过生物信息学分析,从肠道细菌中鉴定出非核糖体短肽合成酶的基因簇,将其中一些基因在大肠杆菌和枯草杆菌中表达,发现表达的酶释放的生物活性物质会抑制宿主的蛋白酶。这是一项重磅研究,通过生物信息学分析得到菌群里的基因信息,进而可以了解细菌的代谢产物对宿主的的影响,很了不得,这或许是菌群研究全面进入分子机制的开端之作之一。周末放毒,强烈推荐!
代谢产物
短肽合成酶
二肽醛
生物信息学
合成生物学
抗生素
Cell:在宏基因组中寻找编码抗生素的基因簇
① 对人体菌群基因组进行系统性分析,共鉴定出3118个小分子生物合成基因簇(BGC);② 分析752份宏基因组样品,发现用于临床试验的硫肽类抗生素的BGC,广泛分布于人类微生物群的基因组和宏基因组;③ 从阴道菌群的重要成员中纯化出硫肽类抗生素lactocillin,lactocillin对一系列革兰氏阳性阴道病原体具有抑制作用,且和其他硫肽BGC在人体细菌中表达;④ 编码小分子的BGC在人体菌群中广泛存在,且人体菌群可产生类药物分子。
抗生素
药物开发
硫肽类抗生素
生物合成基因簇
阴道细菌