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单拷贝基因
文章数:2篇
MetaBinner
复旦大学:从复杂微生物群落中实现高性能分箱新工具MetaBinner
随着测序技术和生物信息学的快速发展,分箱工具不断革新以促进基因组的完整性和低污染率。近日,复旦大学的朱山风及团队在Genome Biology发表最新研究,开发出了从复杂微生物群落中恢复基因组的高性能和独立的集成装箱方法MetaBinner(https://github.com/ziyewang/MetaBinner),通过模拟和真实数据集测试该工具的性能也优于现有工具,值得关注和进一步测试。
MetaBinner
分箱工具
研究论文
基础研究
宏基因组学
微生物分类
Nature子刊:用单拷贝基因系统发育方法分析OTU
16S rRNA基因用于系统分类学研究的地位已经不稳了。之前就有研究人员通过单拷贝基因构建了新的生命之树(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1087194889),发现有明显优势。《Nature Communications》近期发表研究,又进一步基于新的生命之树开发了mOTUs2菌群分析工具。随着宏基因组测序的不断发展,这种分析方法或许将成为菌群结构分析的标准动作之一,非常值得关注!
微生物分类
菌群结构
生物信息学工具
宏基因组学
生物信息学数据库